RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466764.5

RBM3-204, Transcript of RNA binding motif protein 3, human

TSL 3

Gene RBM3, Length 1,375 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM3-204	ENST00000466764	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		40.58	■■■■■ 4.09
RBM3-204	ENST00000466764	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		35.99	■■■■□ 3.35
RBM3-204	ENST00000466764	ABCC9	O60706	1549 aa		35.1	■■■■□ 3.21
RBM3-204	ENST00000466764	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	33.87	■■■■□ 3.01
RBM3-204	ENST00000466764	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		33.85	■■■■□ 3.01
RBM3-204	ENST00000466764	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		33.77	■■■■□ 3
RBM3-204	ENST00000466764	NACAD	O15069	1562 aa		33.76	■■■□□ 2.99
RBM3-204	ENST00000466764	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		33.57	■■■□□ 2.96
RBM3-204	ENST00000466764	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		33.52	■■■□□ 2.96
RBM3-204	ENST00000466764	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		33.12	■■■□□ 2.89
RBM3-204	ENST00000466764	SCRIB	Q14160	1630 aa		32.96	■■■□□ 2.87
RBM3-204	ENST00000466764	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	32.83	■■■□□ 2.85	2e-6	■□□□□ 8.1
RBM3-204	ENST00000466764	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		32.8	■■■□□ 2.84
RBM3-204	ENST00000466764	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		32.34	■■■□□ 2.77
RBM3-204	ENST00000466764	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		32.03	■■■□□ 2.72
RBM3-204	ENST00000466764	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	31.9	■■■□□ 2.7
RBM3-204	ENST00000466764	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		31.74	■■■□□ 2.67
RBM3-204	ENST00000466764	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		31.66	■■■□□ 2.66
RBM3-204	ENST00000466764	SMARCA4	P51532	1647 aa		31.49	■■■□□ 2.63
RBM3-204	ENST00000466764	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	31.44	■■■□□ 2.62
RBM3-204	ENST00000466764	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		31.34	■■■□□ 2.61
RBM3-204	ENST00000466764	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		31.24	■■■□□ 2.59
RBM3-204	ENST00000466764	SMARCA2	P51531	1590 aa		31.17	■■■□□ 2.58
RBM3-204	ENST00000466764	NCAPD3	P42695	1498 aa		31.14	■■■□□ 2.58
RBM3-204	ENST00000466764	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		31.12	■■■□□ 2.57
RBM3-204	ENST00000466764	WIZ	O95785	1651 aa		31.04	■■■□□ 2.56
RBM3-204	ENST00000466764	HMGXB3	Q12766	1538 aa		31.03	■■■□□ 2.56
RBM3-204	ENST00000466764	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	31	■■■□□ 2.55
RBM3-204	ENST00000466764	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	31	■■■□□ 2.55
RBM3-204	ENST00000466764	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	30.67	■■■□□ 2.5
RBM3-204	ENST00000466764	NES	P48681	1621 aa		30.46	■■■□□ 2.47
RBM3-204	ENST00000466764	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	30.41	■■■□□ 2.46
RBM3-204	ENST00000466764	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		30.31	■■■□□ 2.44
RBM3-204	ENST00000466764	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		30.31	■■■□□ 2.44
RBM3-204	ENST00000466764	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		30.26	■■■□□ 2.43
RBM3-204	ENST00000466764	ERCC6	Q03468	1493 aa		30.19	■■■□□ 2.42
RBM3-204	ENST00000466764	CFTR	P13569	1480 aa		30.12	■■■□□ 2.41
RBM3-204	ENST00000466764	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		30.11	■■■□□ 2.41
RBM3-204	ENST00000466764	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		30.07	■■■□□ 2.4
RBM3-204	ENST00000466764	PRDM2	Q13029	1718 aa		29.98	■■■□□ 2.39
RBM3-204	ENST00000466764	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		29.95	■■■□□ 2.39
RBM3-204	ENST00000466764	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	29.94	■■■□□ 2.38
RBM3-204	ENST00000466764	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		29.89	■■■□□ 2.38
RBM3-204	ENST00000466764	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		29.8	■■■□□ 2.36
RBM3-204	ENST00000466764	CUX2	O14529	1486 aa		29.75	■■■□□ 2.35
RBM3-204	ENST00000466764	WDR62	O43379	1518 aa		29.71	■■■□□ 2.35
RBM3-204	ENST00000466764	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	29.68	■■■□□ 2.34
RBM3-204	ENST00000466764	TOPBP1	Q92547	1522 aa		29.51	■■■□□ 2.31
RBM3-204	ENST00000466764	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		29.48	■■■□□ 2.31
RBM3-204	ENST00000466764	ABCC8	Q09428	1581 aa		29.4	■■■□□ 2.3
RBM3-204	ENST00000466764	CUX1	P39880	1505 aa		29.38	■■■□□ 2.29
RBM3-204	ENST00000466764	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	29.27	■■■□□ 2.28
RBM3-204	ENST00000466764	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		29.25	■■■□□ 2.27
RBM3-204	ENST00000466764	IFT140	Q96RY7	1462 aa		29.23	■■■□□ 2.27
RBM3-204	ENST00000466764	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	29.23	■■■□□ 2.27
RBM3-204	ENST00000466764	SYNJ1	O43426	1573 aa		29.22	■■■□□ 2.27
RBM3-204	ENST00000466764	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		29.18	■■■□□ 2.26
RBM3-204	ENST00000466764	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	29.17	■■■□□ 2.26
RBM3-204	ENST00000466764	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		29.16	■■■□□ 2.26
RBM3-204	ENST00000466764	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	29.16	■■■□□ 2.26
RBM3-204	ENST00000466764	TOP2B	Q02880	1626 aa		29.15	■■■□□ 2.26
RBM3-204	ENST00000466764	SOGA1	O94964	1423 aa		29.11	■■■□□ 2.25
RBM3-204	ENST00000466764	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
RBM3-204	ENST00000466764	WDR97	A6NE52	1622 aa		29.02	■■■□□ 2.24
RBM3-204	ENST00000466764	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	29	■■■□□ 2.23	1e-8	■■■■■ 40.1
RBM3-204	ENST00000466764	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	28.97	■■■□□ 2.23
RBM3-204	ENST00000466764	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		28.93	■■■□□ 2.22
RBM3-204	ENST00000466764	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		28.84	■■■□□ 2.21
RBM3-204	ENST00000466764	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		28.79	■■■□□ 2.2
RBM3-204	ENST00000466764	PBRM1	Q86U86	1689 aa		28.79	■■■□□ 2.2
RBM3-204	ENST00000466764	GRIN2B	Q13224	1484 aa		28.75	■■■□□ 2.19
RBM3-204	ENST00000466764	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		28.74	■■■□□ 2.19
RBM3-204	ENST00000466764	CHD1	O14646	1710 aa		28.68	■■■□□ 2.18
RBM3-204	ENST00000466764	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	28.65	■■■□□ 2.18
RBM3-204	ENST00000466764	TRIM41	Q8WV44	630 aa		28.64	■■■□□ 2.18
RBM3-204	ENST00000466764	FBLN2	P98095	1184 aa		28.6	■■■□□ 2.17
RBM3-204	ENST00000466764	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		28.6	■■■□□ 2.17
RBM3-204	ENST00000466764	ADAMTS12	P58397	1594 aa		28.57	■■■□□ 2.16
RBM3-204	ENST00000466764	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		28.57	■■■□□ 2.16
RBM3-204	ENST00000466764	KIF27	Q86VH2	1401 aa		28.57	■■■□□ 2.16
RBM3-204	ENST00000466764	SYNJ2	O15056	1496 aa		28.54	■■■□□ 2.16
RBM3-204	ENST00000466764	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		28.52	■■■□□ 2.16
RBM3-204	ENST00000466764	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	28.5	■■■□□ 2.15
RBM3-204	ENST00000466764	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		28.48	■■■□□ 2.15
RBM3-204	ENST00000466764	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		28.47	■■■□□ 2.15
RBM3-204	ENST00000466764	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		28.45	■■■□□ 2.14
RBM3-204	ENST00000466764	IGF1R	P08069	1367 aa		28.43	■■■□□ 2.14
RBM3-204	ENST00000466764	GRIN2A	Q12879	1464 aa		28.41	■■■□□ 2.14
RBM3-204	ENST00000466764	CUL7	Q14999	1698 aa		28.37	■■■□□ 2.13
RBM3-204	ENST00000466764	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		28.32	■■■□□ 2.12
RBM3-204	ENST00000466764	CEP170	Q5SW79	1584 aa		28.31	■■■□□ 2.12
RBM3-204	ENST00000466764	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		28.27	■■■□□ 2.12
RBM3-204	ENST00000466764	NUP160	Q12769	1436 aa		28.26	■■■□□ 2.11
RBM3-204	ENST00000466764	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		28.17	■■■□□ 2.1
RBM3-204	ENST00000466764	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		28.17	■■■□□ 2.1
RBM3-204	ENST00000466764	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		28.17	■■■□□ 2.1
RBM3-204	ENST00000466764	ARHGEF11	O15085	1522 aa		28.17	■■■□□ 2.1
RBM3-204	ENST00000466764	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	28.14	■■■□□ 2.1
RBM3-204	ENST00000466764	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		28.13	■■■□□ 2.09
RBM3-204	ENST00000466764	EEA1	Q15075	1411 aa		28.11	■■■□□ 2.09

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