RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466252.5

SNX21-208, Transcript of sorting nexin family member 21, humanhuman

TSL 3

Gene SNX21, Length 574 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21-208ENST00000466252 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.67■■■■■ 6.5
SNX21-208ENST00000466252 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.3■■■■■ 5.48
SNX21-208ENST00000466252 ABCC9O60706 1549 aa48.11■■■■■ 5.29
SNX21-208ENST00000466252 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.46■■■■■ 5.03
SNX21-208ENST00000466252 NACADO15069 1562 aa46.36■■■■■ 5.01
SNX21-208ENST00000466252 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.36■■■■■ 5.01
SNX21-208ENST00000466252 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.32■■■■■ 5.01
SNX21-208ENST00000466252 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.19■■■■■ 4.99
SNX21-208ENST00000466252 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.06■■■■■ 4.96
SNX21-208ENST00000466252 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.33■■■■■ 4.85
SNX21-208ENST00000466252 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.09■■■■■ 4.81
SNX21-208ENST00000466252 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.02■■■■■ 4.8
SNX21-208ENST00000466252 SCRIBQ14160 1630 aa44.98■■■■■ 4.79
SNX21-208ENST00000466252 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.44■■■■■ 4.7
SNX21-208ENST00000466252 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.2■■■■■ 4.67
SNX21-208ENST00000466252 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.75■■■■■ 4.59
SNX21-208ENST00000466252 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.52■■■■■ 4.56
SNX21-208ENST00000466252 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.38■■■■■ 4.54
SNX21-208ENST00000466252 SMARCA4P51532 1647 aa43.09■■■■■ 4.49
SNX21-208ENST00000466252 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.06■■■■■ 4.48
SNX21-208ENST00000466252 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.91■■■■■ 4.46
SNX21-208ENST00000466252 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.87■■■■■ 4.45
SNX21-208ENST00000466252 NCAPD3P42695 1498 aa42.86■■■■■ 4.45
SNX21-208ENST00000466252 SMARCA2P51531 1590 aa42.75■■■■■ 4.43
SNX21-208ENST00000466252 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.71■■■■■ 4.43
SNX21-208ENST00000466252 HMGXB3Q12766 1538 aa42.54■■■■■ 4.4
SNX21-208ENST00000466252 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.53■■■■■ 4.4
SNX21-208ENST00000466252 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.45■■■■■ 4.39
SNX21-208ENST00000466252 WIZO95785 1651 aa42.44■■■■■ 4.38
SNX21-208ENST00000466252 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.94■■■■■ 4.3
SNX21-208ENST00000466252 NESP48681 1621 aa41.73■■■■■ 4.27
SNX21-208ENST00000466252 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.61■■■■■ 4.25
SNX21-208ENST00000466252 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.59■■■■■ 4.25
SNX21-208ENST00000466252 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
SNX21-208ENST00000466252 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.54■■■■■ 4.24
SNX21-208ENST00000466252 CFTRP13569 1480 aa41.39■■■■■ 4.22
SNX21-208ENST00000466252 ERCC6Q03468 1493 aa41.37■■■■■ 4.21
SNX21-208ENST00000466252 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.34■■■■■ 4.21
SNX21-208ENST00000466252 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.17■■■■■ 4.18
SNX21-208ENST00000466252 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.06■■■■■ 4.16
SNX21-208ENST00000466252 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.97■■■■■ 4.15
SNX21-208ENST00000466252 PRDM2Q13029 1718 aa40.96■■■■■ 4.15
SNX21-208ENST00000466252 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.95■■■■■ 4.15
SNX21-208ENST00000466252 CUX2O14529 1486 aa40.91■■■■■ 4.14
SNX21-208ENST00000466252 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.87■■■■■ 4.13
SNX21-208ENST00000466252 WDR62O43379 1518 aa40.72■■■■■ 4.11
SNX21-208ENST00000466252 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
SNX21-208ENST00000466252 ABCC8Q09428 1581 aa40.45■■■■■ 4.07
SNX21-208ENST00000466252 TOPBP1Q92547 1522 aa40.44■■■■■ 4.06
SNX21-208ENST00000466252 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.36■■■■■ 4.05
SNX21-208ENST00000466252 CUX1P39880 1505 aa40.21■■■■■ 4.03
SNX21-208ENST00000466252 IFT140Q96RY7 1462 aa40.12■■■■■ 4.01
SNX21-208ENST00000466252 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.11■■■■■ 4.01
SNX21-208ENST00000466252 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.02■■■■■ 4
SNX21-208ENST00000466252 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.02■■■■■ 4
SNX21-208ENST00000466252 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40■■■■□ 3.99
SNX21-208ENST00000466252 SOGA1O94964 1423 aa39.99■■■■□ 3.99
SNX21-208ENST00000466252 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.97■■■■□ 3.99
SNX21-208ENST00000466252 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.96■■■■□ 3.99
SNX21-208ENST00000466252 TOP2BQ02880 1626 aa39.9■■■■□ 3.98
SNX21-208ENST00000466252 SYNJ1O43426 1573 aa39.89■■■■□ 3.98
SNX21-208ENST00000466252 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.88■■■■□ 3.97
SNX21-208ENST00000466252 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.79■■■■□ 3.96
SNX21-208ENST00000466252 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.75■■■■□ 3.95
SNX21-208ENST00000466252 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.71■■■■□ 3.95
SNX21-208ENST00000466252 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.66■■■■□ 3.94
SNX21-208ENST00000466252 WDR97A6NE52 1622 aa39.65■■■■□ 3.94
SNX21-208ENST00000466252 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.6■■■■□ 3.93
SNX21-208ENST00000466252 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.49■■■■□ 3.91
SNX21-208ENST00000466252 GRIN2BQ13224 1484 aa39.44■■■■□ 3.9
SNX21-208ENST00000466252 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.44■■■■□ 3.9
SNX21-208ENST00000466252 OSCARQ8IYS5 282 aa39.39■■■■□ 3.9
SNX21-208ENST00000466252 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.33■■■■□ 3.89
SNX21-208ENST00000466252 PBRM1Q86U86 1689 aa39.32■■■■□ 3.88
SNX21-208ENST00000466252 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.3■■■■□ 3.88
SNX21-208ENST00000466252 TRIM41Q8WV44 630 aa39.26■■■■□ 3.88
SNX21-208ENST00000466252 FBLN2P98095 1184 aa39.23■■■■□ 3.87
SNX21-208ENST00000466252 CHD1O14646 1710 aa39.2■■■■□ 3.87
SNX21-208ENST00000466252 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.19■■■■□ 3.86
SNX21-208ENST00000466252 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.17■■■■□ 3.86
SNX21-208ENST00000466252 SYNJ2O15056 1496 aa39.17■■■■□ 3.86
SNX21-208ENST00000466252 KIF27Q86VH2 1401 aa39.16■■■■□ 3.86
SNX21-208ENST00000466252 IGF1RP08069 1367 aa39.1■■■■□ 3.85
SNX21-208ENST00000466252 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.05■■■■□ 3.84
SNX21-208ENST00000466252 ADAMTS12P58397 1594 aa39.02■■■■□ 3.84
SNX21-208ENST00000466252 CHIC1Q5VXU3 224 aa39■■■■□ 3.83
SNX21-208ENST00000466252 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.98■■■■□ 3.83
SNX21-208ENST00000466252 GRIN2AQ12879 1464 aa38.93■■■■□ 3.82
SNX21-208ENST00000466252 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.82■■■■□ 3.8
SNX21-208ENST00000466252 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.81■■■■□ 3.8
SNX21-208ENST00000466252 CUL7Q14999 1698 aa38.8■■■■□ 3.8
SNX21-208ENST00000466252 NUP160Q12769 1436 aa38.8■■■■□ 3.8
SNX21-208ENST00000466252 CEP170Q5SW79 1584 aa38.74■■■■□ 3.79
SNX21-208ENST00000466252 ARHGEF11O15085 1522 aa38.63■■■■□ 3.77
SNX21-208ENST00000466252 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.61■■■■□ 3.77
SNX21-208ENST00000466252 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.61■■■■□ 3.77
SNX21-208ENST00000466252 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.61■■■■□ 3.77
SNX21-208ENST00000466252 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.59■■■■□ 3.77
SNX21-208ENST00000466252 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.55■■■■□ 3.76
SNX21-208ENST00000466252 EEA1Q15075 1411 aa38.53■■■■□ 3.76
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