RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462357.1

IMP4-209, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 5

Gene IMP4, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-209ENST00000462357 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.34■■■■■ 5.49
IMP4-209ENST00000462357 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.77■■■■■ 4.6
IMP4-209ENST00000462357 ABCC9O60706 1549 aa42.87■■■■■ 4.45
IMP4-209ENST00000462357 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.51■■■■■ 4.24
IMP4-209ENST00000462357 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.31■■■■■ 4.2
IMP4-209ENST00000462357 NACADO15069 1562 aa41.29■■■■■ 4.2
IMP4-209ENST00000462357 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.06■■■■■ 4.16
IMP4-209ENST00000462357 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.05■■■■■ 4.16
IMP4-209ENST00000462357 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.87■■■■■ 4.13
IMP4-209ENST00000462357 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.16■■■■■ 4.02
IMP4-209ENST00000462357 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.02■■■■■ 4
IMP4-209ENST00000462357 SCRIBQ14160 1630 aa39.92■■■■□ 3.98
IMP4-209ENST00000462357 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.83■■■■□ 3.97
IMP4-209ENST00000462357 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.7■■■■□ 3.95
IMP4-209ENST00000462357 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.26■■■■□ 3.88
IMP4-209ENST00000462357 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.91■■■■□ 3.82
IMP4-209ENST00000462357 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.71■■■■□ 3.79
IMP4-209ENST00000462357 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.58■■■■□ 3.77
IMP4-209ENST00000462357 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.29■■■■□ 3.72
IMP4-209ENST00000462357 SMARCA4P51532 1647 aa38.2■■■■□ 3.7
IMP4-209ENST00000462357 NCAPD3P42695 1498 aa38.11■■■■□ 3.69
IMP4-209ENST00000462357 SMARCA2P51531 1590 aa38.1■■■■□ 3.69
IMP4-209ENST00000462357 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.08■■■■□ 3.69
IMP4-209ENST00000462357 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.94■■■■□ 3.66
IMP4-209ENST00000462357 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.85■■■■□ 3.65
IMP4-209ENST00000462357 HMGXB3Q12766 1538 aa37.84■■■■□ 3.65
IMP4-209ENST00000462357 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.83■■■■□ 3.65
IMP4-209ENST00000462357 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.62■■■■□ 3.61
IMP4-209ENST00000462357 WIZO95785 1651 aa37.48■■■■□ 3.59
IMP4-209ENST00000462357 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.2■■■■□ 3.55
IMP4-209ENST00000462357 ERCC6Q03468 1493 aa37.1■■■■□ 3.53
IMP4-209ENST00000462357 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.06■■■■□ 3.52
IMP4-209ENST00000462357 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.05■■■■□ 3.52
IMP4-209ENST00000462357 NESP48681 1621 aa37.01■■■■□ 3.52
IMP4-209ENST00000462357 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.98■■■■□ 3.51
IMP4-209ENST00000462357 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.87■■■■□ 3.49
IMP4-209ENST00000462357 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.79■■■■□ 3.48
IMP4-209ENST00000462357 CFTRP13569 1480 aa36.76■■■■□ 3.48
IMP4-209ENST00000462357 CUX2O14529 1486 aa36.65■■■■□ 3.46
IMP4-209ENST00000462357 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.56■■■■□ 3.44
IMP4-209ENST00000462357 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.53■■■■□ 3.44
IMP4-209ENST00000462357 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.48■■■■□ 3.43
IMP4-209ENST00000462357 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.44■■■■□ 3.42
IMP4-209ENST00000462357 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.41
IMP4-209ENST00000462357 PRDM2Q13029 1718 aa36.26■■■■□ 3.4
IMP4-209ENST00000462357 WDR62O43379 1518 aa36.24■■■■□ 3.39
IMP4-209ENST00000462357 ABCC8Q09428 1581 aa36.14■■■■□ 3.38
IMP4-209ENST00000462357 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
IMP4-209ENST00000462357 TOPBP1Q92547 1522 aa35.93■■■■□ 3.34
IMP4-209ENST00000462357 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.88■■■■□ 3.33
IMP4-209ENST00000462357 IFT140Q96RY7 1462 aa35.8■■■■□ 3.32
IMP4-209ENST00000462357 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
IMP4-209ENST00000462357 SOGA1O94964 1423 aa35.61■■■■□ 3.29
IMP4-209ENST00000462357 CUX1P39880 1505 aa35.6■■■■□ 3.29
IMP4-209ENST00000462357 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.55■■■■□ 3.28
IMP4-209ENST00000462357 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.54■■■■□ 3.28
IMP4-209ENST00000462357 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.54■■■■□ 3.28
IMP4-209ENST00000462357 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.47■■■■□ 3.27
IMP4-209ENST00000462357 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.45■■■■□ 3.27
IMP4-209ENST00000462357 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.43■■■■□ 3.26
IMP4-209ENST00000462357 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.36■■■■□ 3.25
IMP4-209ENST00000462357 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
IMP4-209ENST00000462357 TOP2BQ02880 1626 aa35.34■■■■□ 3.25
IMP4-209ENST00000462357 WDR97A6NE52 1622 aa35.32■■■■□ 3.24
IMP4-209ENST00000462357 OSCARQ8IYS5 282 aa35.31■■■■□ 3.24
IMP4-209ENST00000462357 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
IMP4-209ENST00000462357 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.27■■■■□ 3.24
IMP4-209ENST00000462357 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.24■■■■□ 3.23
IMP4-209ENST00000462357 SYNJ1O43426 1573 aa35.24■■■■□ 3.23
IMP4-209ENST00000462357 GRIN2BQ13224 1484 aa35.16■■■■□ 3.22
IMP4-209ENST00000462357 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.16■■■■□ 3.22
IMP4-209ENST00000462357 FBLN2P98095 1184 aa35.15■■■■□ 3.22
IMP4-209ENST00000462357 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.09■■■■□ 3.21
IMP4-209ENST00000462357 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.05■■■■□ 3.2
IMP4-209ENST00000462357 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.02■■■■□ 3.2
IMP4-209ENST00000462357 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.95■■■■□ 3.19
IMP4-209ENST00000462357 TRIM41Q8WV44 630 aa34.92■■■■□ 3.18
IMP4-209ENST00000462357 SYNJ2O15056 1496 aa34.9■■■■□ 3.18
IMP4-209ENST00000462357 KIF27Q86VH2 1401 aa34.89■■■■□ 3.18
IMP4-209ENST00000462357 PBRM1Q86U86 1689 aa34.85■■■■□ 3.17
IMP4-209ENST00000462357 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.84■■■■□ 3.17
IMP4-209ENST00000462357 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.79■■■■□ 3.16
IMP4-209ENST00000462357 CHD1O14646 1710 aa34.77■■■■□ 3.16
IMP4-209ENST00000462357 IGF1RP08069 1367 aa34.67■■■■□ 3.14
IMP4-209ENST00000462357 GRIN2AQ12879 1464 aa34.65■■■■□ 3.14
IMP4-209ENST00000462357 ADAMTS12P58397 1594 aa34.64■■■■□ 3.14
IMP4-209ENST00000462357 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.52■■■■□ 3.12
IMP4-209ENST00000462357 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.48■■■■□ 3.11
IMP4-209ENST00000462357 CUL7Q14999 1698 aa34.47■■■■□ 3.11
IMP4-209ENST00000462357 NUP160Q12769 1436 aa34.47■■■■□ 3.11
IMP4-209ENST00000462357 ARHGEF11O15085 1522 aa34.46■■■■□ 3.11
IMP4-209ENST00000462357 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.39■■■■□ 3.1
IMP4-209ENST00000462357 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.39■■■■□ 3.1
IMP4-209ENST00000462357 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.39■■■■□ 3.1
IMP4-209ENST00000462357 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.36■■■■□ 3.09
IMP4-209ENST00000462357 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.35■■■■□ 3.09
IMP4-209ENST00000462357 CEP170Q5SW79 1584 aa34.34■■■■□ 3.09
IMP4-209ENST00000462357 JPH4Q96JJ6 628 aa34.32■■■■□ 3.08
IMP4-209ENST00000462357 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.31■■■■□ 3.08
IMP4-209ENST00000462357 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.28■■■■□ 3.08
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