RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462275.5

TBXAS1-212, Transcript of thromboxane A synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TBXAS1, Length 1,773 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBXAS1-212ENST00000462275 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.6■■■■□ 3.13
TBXAS1-212ENST00000462275 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.55■■■□□ 2.48
TBXAS1-212ENST00000462275 ABCC9O60706 1549 aa29.4■■■□□ 2.3
TBXAS1-212ENST00000462275 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
TBXAS1-212ENST00000462275 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.78■■■□□ 2.2
TBXAS1-212ENST00000462275 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.66■■■□□ 2.18
TBXAS1-212ENST00000462275 NACADO15069 1562 aa28.61■■■□□ 2.17
TBXAS1-212ENST00000462275 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.6■■■□□ 2.17
TBXAS1-212ENST00000462275 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.52■■■□□ 2.16
TBXAS1-212ENST00000462275 SCRIBQ14160 1630 aa27.91■■■□□ 2.06
TBXAS1-212ENST00000462275 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.89■■■□□ 2.06
TBXAS1-212ENST00000462275 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.66■■■□□ 2.02
TBXAS1-212ENST00000462275 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.6■■■□□ 2.01
TBXAS1-212ENST00000462275 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.57■■■□□ 2
TBXAS1-212ENST00000462275 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.89■■□□□ 1.89
TBXAS1-212ENST00000462275 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
TBXAS1-212ENST00000462275 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
TBXAS1-212ENST00000462275 SMARCA4P51532 1647 aa26.74■■□□□ 1.87
TBXAS1-212ENST00000462275 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.67■■□□□ 1.86
TBXAS1-212ENST00000462275 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.62■■□□□ 1.85
TBXAS1-212ENST00000462275 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
TBXAS1-212ENST00000462275 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.51■■□□□ 1.83
TBXAS1-212ENST00000462275 SMARCA2P51531 1590 aa26.49■■□□□ 1.83
TBXAS1-212ENST00000462275 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.48■■□□□ 1.83
TBXAS1-212ENST00000462275 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.46■■□□□ 1.83
TBXAS1-212ENST00000462275 WIZO95785 1651 aa26.43■■□□□ 1.82
TBXAS1-212ENST00000462275 NCAPD3P42695 1498 aa26.38■■□□□ 1.81
TBXAS1-212ENST00000462275 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
TBXAS1-212ENST00000462275 HMGXB3Q12766 1538 aa26.3■■□□□ 1.8
TBXAS1-212ENST00000462275 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
TBXAS1-212ENST00000462275 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
TBXAS1-212ENST00000462275 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.85■■□□□ 1.73
TBXAS1-212ENST00000462275 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.66■■□□□ 1.7
TBXAS1-212ENST00000462275 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.63■■□□□ 1.69
TBXAS1-212ENST00000462275 CFTRP13569 1480 aa25.6■■□□□ 1.69
TBXAS1-212ENST00000462275 NESP48681 1621 aa25.58■■□□□ 1.69
TBXAS1-212ENST00000462275 PRDM2Q13029 1718 aa25.48■■□□□ 1.67
TBXAS1-212ENST00000462275 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.44■■□□□ 1.66
TBXAS1-212ENST00000462275 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.35■■□□□ 1.65
TBXAS1-212ENST00000462275 ERCC6Q03468 1493 aa25.34■■□□□ 1.65
TBXAS1-212ENST00000462275 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.32■■□□□ 1.64
TBXAS1-212ENST00000462275 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.28■■□□□ 1.64
TBXAS1-212ENST00000462275 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.12■■□□□ 1.61
TBXAS1-212ENST00000462275 ABCC8Q09428 1581 aa25.07■■□□□ 1.6
TBXAS1-212ENST00000462275 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
TBXAS1-212ENST00000462275 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.05■■□□□ 1.6
TBXAS1-212ENST00000462275 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
TBXAS1-212ENST00000462275 WDR62O43379 1518 aa25.02■■□□□ 1.6
TBXAS1-212ENST00000462275 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.01■■□□□ 1.59
TBXAS1-212ENST00000462275 TOPBP1Q92547 1522 aa25■■□□□ 1.59
TBXAS1-212ENST00000462275 CUX1P39880 1505 aa24.98■■□□□ 1.59
TBXAS1-212ENST00000462275 TOP2BQ02880 1626 aa24.93■■□□□ 1.58
TBXAS1-212ENST00000462275 SYNJ1O43426 1573 aa24.93■■□□□ 1.58
TBXAS1-212ENST00000462275 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.91■■□□□ 1.58
TBXAS1-212ENST00000462275 CUX2O14529 1486 aa24.86■■□□□ 1.57
TBXAS1-212ENST00000462275 TRIM41Q8WV44 630 aa24.85■■□□□ 1.57
TBXAS1-212ENST00000462275 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.83■■□□□ 1.57
TBXAS1-212ENST00000462275 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.83■■□□□ 1.57
TBXAS1-212ENST00000462275 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
TBXAS1-212ENST00000462275 SOGA1O94964 1423 aa24.75■■□□□ 1.55
TBXAS1-212ENST00000462275 IFT140Q96RY7 1462 aa24.72■■□□□ 1.55
TBXAS1-212ENST00000462275 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.7■■□□□ 1.54
TBXAS1-212ENST00000462275 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
TBXAS1-212ENST00000462275 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.62■■□□□ 1.53
TBXAS1-212ENST00000462275 WDR97A6NE52 1622 aa24.59■■□□□ 1.53
TBXAS1-212ENST00000462275 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
TBXAS1-212ENST00000462275 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
TBXAS1-212ENST00000462275 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.5■■□□□ 1.51
TBXAS1-212ENST00000462275 KIF27Q86VH2 1401 aa24.49■■□□□ 1.51
TBXAS1-212ENST00000462275 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
TBXAS1-212ENST00000462275 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.47■■□□□ 1.51
TBXAS1-212ENST00000462275 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.47■■□□□ 1.51
TBXAS1-212ENST00000462275 GRIN2BQ13224 1484 aa24.39■■□□□ 1.49
TBXAS1-212ENST00000462275 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.38■■□□□ 1.49
TBXAS1-212ENST00000462275 PBRM1Q86U86 1689 aa24.38■■□□□ 1.49
TBXAS1-212ENST00000462275 EEA1Q15075 1411 aa24.36■■□□□ 1.49
TBXAS1-212ENST00000462275 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.35■■□□□ 1.49
TBXAS1-212ENST00000462275 IGF1RP08069 1367 aa24.31■■□□□ 1.48
TBXAS1-212ENST00000462275 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
TBXAS1-212ENST00000462275 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
TBXAS1-212ENST00000462275 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.27■■□□□ 1.48
TBXAS1-212ENST00000462275 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.26■■□□□ 1.47
TBXAS1-212ENST00000462275 CUL7Q14999 1698 aa24.24■■□□□ 1.47
TBXAS1-212ENST00000462275 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.2■■□□□ 1.46
TBXAS1-212ENST00000462275 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.19■■□□□ 1.46
TBXAS1-212ENST00000462275 ADAMTS12P58397 1594 aa24.19■■□□□ 1.46
TBXAS1-212ENST00000462275 SYNJ2O15056 1496 aa24.18■■□□□ 1.46
TBXAS1-212ENST00000462275 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
TBXAS1-212ENST00000462275 FBLN2P98095 1184 aa24.16■■□□□ 1.46
TBXAS1-212ENST00000462275 PRXQ9BXM0 1461 aa24.12■■□□□ 1.45
TBXAS1-212ENST00000462275 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.1■■□□□ 1.45
TBXAS1-212ENST00000462275 CHD1O14646 1710 aa24.1■■□□□ 1.45
TBXAS1-212ENST00000462275 GRIN2AQ12879 1464 aa24.07■■□□□ 1.44
TBXAS1-212ENST00000462275 KIF21BO75037 1637 aa24.05■■□□□ 1.44
TBXAS1-212ENST00000462275 OSCARQ8IYS5 282 aa23.98■■□□□ 1.43
TBXAS1-212ENST00000462275 GOLGA3Q08378 1498 aa23.95■■□□□ 1.43
TBXAS1-212ENST00000462275 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.94■■□□□ 1.42
TBXAS1-212ENST00000462275 NUP160Q12769 1436 aa23.93■■□□□ 1.42
TBXAS1-212ENST00000462275 CEP170Q5SW79 1584 aa23.92■■□□□ 1.42
TBXAS1-212ENST00000462275 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.1 ms