RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462164.5

GLIS3-204, Transcript of GLIS family zinc finger 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GLIS3, Length 700 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS3-204ENST00000462164 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.74■■□□□ 1.23
GLIS3-204ENST00000462164 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
GLIS3-204ENST00000462164 NISCHQ9Y2I1 1504 aa21.86■■□□□ 1.09
GLIS3-204ENST00000462164 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
GLIS3-204ENST00000462164 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa19.52■□□□□ 0.72
GLIS3-204ENST00000462164 ABCC9O60706 1549 aa19.29■□□□□ 0.68
GLIS3-204ENST00000462164 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
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GLIS3-204ENST00000462164 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa18.04■□□□□ 0.48
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GLIS3-204ENST00000462164 BICRAQ9NZM4 1560 aa17.92■□□□□ 0.46
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GLIS3-204ENST00000462164 SCRIBQ14160 1630 aa17.83■□□□□ 0.45
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GLIS3-204ENST00000462164 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa17.44■□□□□ 0.38
GLIS3-204ENST00000462164 CECR2Q9BXF3 1484 aa17.31■□□□□ 0.36
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GLIS3-204ENST00000462164 SMARCA4P51532 1647 aa17.03■□□□□ 0.32
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GLIS3-204ENST00000462164 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa16.94■□□□□ 0.3
GLIS3-204ENST00000462164 SMARCA2P51531 1590 aa16.9■□□□□ 0.3
GLIS3-204ENST00000462164 MROH2BQ7Z745 1585 aa16.88■□□□□ 0.29
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GLIS3-204ENST00000462164 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
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GLIS3-204ENST00000462164 NESP48681 1621 aa16.66■□□□□ 0.26
GLIS3-204ENST00000462164 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa16.65■□□□□ 0.26
GLIS3-204ENST00000462164 ERCC6Q03468 1493 aa16.61■□□□□ 0.25
GLIS3-204ENST00000462164 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.55■□□□□ 0.24
GLIS3-204ENST00000462164 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa16.48■□□□□ 0.23
GLIS3-204ENST00000462164 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
GLIS3-204ENST00000462164 CUX2O14529 1486 aa16.46■□□□□ 0.23
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GLIS3-204ENST00000462164 PDS5BQ9NTI5 1447 aa16.42■□□□□ 0.22
GLIS3-204ENST00000462164 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
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GLIS3-204ENST00000462164 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa16.18■□□□□ 0.18
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GLIS3-204ENST00000462164 TOPBP1Q92547 1522 aa16■□□□□ 0.15
GLIS3-204ENST00000462164 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa16■□□□□ 0.15
GLIS3-204ENST00000462164 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
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GLIS3-204ENST00000462164 IFT140Q96RY7 1462 aa15.91■□□□□ 0.14
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GLIS3-204ENST00000462164 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.79■□□□□ 0.12
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GLIS3-204ENST00000462164 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
GLIS3-204ENST00000462164 CHD1O14646 1710 aa15.72■□□□□ 0.11
GLIS3-204ENST00000462164 WDR97A6NE52 1622 aa15.7■□□□□ 0.1
GLIS3-204ENST00000462164 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP15.68■□□□□ 0.1
GLIS3-204ENST00000462164 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.66■□□□□ 0.1
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GLIS3-204ENST00000462164 TOP2BQ02880 1626 aa15.65■□□□□ 0.1
GLIS3-204ENST00000462164 PBRM1Q86U86 1689 aa15.63■□□□□ 0.09
GLIS3-204ENST00000462164 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.63■□□□□ 0.09
GLIS3-204ENST00000462164 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa15.61■□□□□ 0.09
GLIS3-204ENST00000462164 GRIN2BQ13224 1484 aa15.6■□□□□ 0.09
GLIS3-204ENST00000462164 GAPVD1Q14C86 1478 aa15.6■□□□□ 0.09
GLIS3-204ENST00000462164 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa15.59■□□□□ 0.09
GLIS3-204ENST00000462164 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa15.58■□□□□ 0.09
GLIS3-204ENST00000462164 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa15.58■□□□□ 0.09
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