RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461758.6

TLE4-213, Transcript of transducin like enhancer of split 4, human

TSL 5

Gene TLE4, Length 1,536 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TLE4-213	ENST00000461758	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		65.07	■■■■■ 8.01
TLE4-213	ENST00000461758	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		57.48	■■■■■ 6.79
TLE4-213	ENST00000461758	ABCC9	O60706	1549 aa		56.32	■■■■■ 6.61
TLE4-213	ENST00000461758	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	54.33	■■■■■ 6.29
TLE4-213	ENST00000461758	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		54.24	■■■■■ 6.27
TLE4-213	ENST00000461758	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		54.08	■■■■■ 6.25
TLE4-213	ENST00000461758	NACAD	O15069	1562 aa		53.94	■■■■■ 6.23
TLE4-213	ENST00000461758	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		53.89	■■■■■ 6.22
TLE4-213	ENST00000461758	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		53.84	■■■■■ 6.21
TLE4-213	ENST00000461758	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		53.08	■■■■■ 6.09
TLE4-213	ENST00000461758	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	52.52	■■■■■ 6
TLE4-213	ENST00000461758	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		52.51	■■■■■ 6
TLE4-213	ENST00000461758	SCRIB	Q14160	1630 aa		52.51	■■■■■ 6
TLE4-213	ENST00000461758	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		51.9	■■■■■ 5.9
TLE4-213	ENST00000461758	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		51.83	■■■■■ 5.89
TLE4-213	ENST00000461758	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	51.11	■■■■■ 5.77
TLE4-213	ENST00000461758	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		50.98	■■■■■ 5.75
TLE4-213	ENST00000461758	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		50.6	■■■■■ 5.69
TLE4-213	ENST00000461758	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	50.41	■■■■■ 5.66
TLE4-213	ENST00000461758	SMARCA4	P51532	1647 aa		50.29	■■■■■ 5.64
TLE4-213	ENST00000461758	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		50.12	■■■■■ 5.61
TLE4-213	ENST00000461758	SMARCA2	P51531	1590 aa		49.88	■■■■■ 5.58
TLE4-213	ENST00000461758	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	49.87	■■■■■ 5.57
TLE4-213	ENST00000461758	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		49.87	■■■■■ 5.57
TLE4-213	ENST00000461758	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		49.79	■■■■■ 5.56
TLE4-213	ENST00000461758	NCAPD3	P42695	1498 aa		49.75	■■■■■ 5.55
TLE4-213	ENST00000461758	WIZ	O95785	1651 aa		49.61	■■■■■ 5.53
TLE4-213	ENST00000461758	HMGXB3	Q12766	1538 aa		49.54	■■■■■ 5.52
TLE4-213	ENST00000461758	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	49.53	■■■■■ 5.52
TLE4-213	ENST00000461758	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	49.32	■■■■■ 5.49
TLE4-213	ENST00000461758	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	49.17	■■■■■ 5.46
TLE4-213	ENST00000461758	NES	P48681	1621 aa		48.71	■■■■■ 5.39
TLE4-213	ENST00000461758	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		48.61	■■■■■ 5.37
TLE4-213	ENST00000461758	ERCC6	Q03468	1493 aa		48.53	■■■■■ 5.36
TLE4-213	ENST00000461758	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		48.53	■■■■■ 5.36
TLE4-213	ENST00000461758	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		48.37	■■■■■ 5.33
TLE4-213	ENST00000461758	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		48.25	■■■■■ 5.31
TLE4-213	ENST00000461758	CFTR	P13569	1480 aa		48.2	■■■■■ 5.31
TLE4-213	ENST00000461758	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		48.12	■■■■■ 5.29
TLE4-213	ENST00000461758	CUX2	O14529	1486 aa		48.07	■■■■■ 5.29
TLE4-213	ENST00000461758	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	48.07	■■■■■ 5.29
TLE4-213	ENST00000461758	PRDM2	Q13029	1718 aa		47.82	■■■■■ 5.25
TLE4-213	ENST00000461758	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		47.79	■■■■■ 5.24
TLE4-213	ENST00000461758	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		47.73	■■■■■ 5.23
TLE4-213	ENST00000461758	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		47.7	■■■■■ 5.23
TLE4-213	ENST00000461758	WDR62	O43379	1518 aa		47.59	■■■■■ 5.21
TLE4-213	ENST00000461758	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	47.33	■■■■■ 5.17
TLE4-213	ENST00000461758	ABCC8	Q09428	1581 aa		47.22	■■■■■ 5.15
TLE4-213	ENST00000461758	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		47.09	■■■■■ 5.13
TLE4-213	ENST00000461758	TOPBP1	Q92547	1522 aa		47.09	■■■■■ 5.13
TLE4-213	ENST00000461758	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	47.05	■■■■■ 5.12
TLE4-213	ENST00000461758	CUX1	P39880	1505 aa		46.98	■■■■■ 5.11
TLE4-213	ENST00000461758	TOP2B	Q02880	1626 aa		46.8	■■■■■ 5.08
TLE4-213	ENST00000461758	SYNJ1	O43426	1573 aa		46.79	■■■■■ 5.08
TLE4-213	ENST00000461758	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		46.78	■■■■■ 5.08
TLE4-213	ENST00000461758	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		46.76	■■■■■ 5.08
TLE4-213	ENST00000461758	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	46.74	■■■■■ 5.07
TLE4-213	ENST00000461758	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		46.74	■■■■■ 5.07
TLE4-213	ENST00000461758	IFT140	Q96RY7	1462 aa		46.71	■■■■■ 5.07
TLE4-213	ENST00000461758	SOGA1	O94964	1423 aa		46.63	■■■■■ 5.05
TLE4-213	ENST00000461758	TRIM41	Q8WV44	630 aa		46.59	■■■■■ 5.05
TLE4-213	ENST00000461758	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	46.57	■■■■■ 5.05
TLE4-213	ENST00000461758	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	46.56	■■■■■ 5.04
TLE4-213	ENST00000461758	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		46.52	■■■■■ 5.04
TLE4-213	ENST00000461758	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	46.46	■■■■■ 5.03
TLE4-213	ENST00000461758	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		46.44	■■■■■ 5.02
TLE4-213	ENST00000461758	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		46.34	■■■■■ 5.01
TLE4-213	ENST00000461758	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	46.25	■■■■■ 4.99
TLE4-213	ENST00000461758	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	46.25	■■■■■ 4.99
TLE4-213	ENST00000461758	WDR97	A6NE52	1622 aa		46.21	■■■■■ 4.99
TLE4-213	ENST00000461758	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		46.08	■■■■■ 4.97
TLE4-213	ENST00000461758	KIF27	Q86VH2	1401 aa		46.05	■■■■■ 4.96
TLE4-213	ENST00000461758	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		46.02	■■■■■ 4.96
TLE4-213	ENST00000461758	CHD1	O14646	1710 aa		45.98	■■■■■ 4.95
TLE4-213	ENST00000461758	GRIN2B	Q13224	1484 aa		45.97	■■■■■ 4.95
TLE4-213	ENST00000461758	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		45.97	■■■■■ 4.95
TLE4-213	ENST00000461758	PBRM1	Q86U86	1689 aa		45.92	■■■■■ 4.94
TLE4-213	ENST00000461758	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		45.85	■■■■■ 4.93
TLE4-213	ENST00000461758	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		45.81	■■■■■ 4.92
TLE4-213	ENST00000461758	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	45.76	■■■■■ 4.92
TLE4-213	ENST00000461758	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		45.74	■■■■■ 4.91
TLE4-213	ENST00000461758	IGF1R	P08069	1367 aa		45.72	■■■■■ 4.91
TLE4-213	ENST00000461758	EEA1	Q15075	1411 aa		45.7	■■■■■ 4.91
TLE4-213	ENST00000461758	FBLN2	P98095	1184 aa		45.68	■■■■■ 4.9
TLE4-213	ENST00000461758	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	45.6	■■■■■ 4.89
TLE4-213	ENST00000461758	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		45.59	■■■■■ 4.89
TLE4-213	ENST00000461758	SYNJ2	O15056	1496 aa		45.57	■■■■■ 4.89
TLE4-213	ENST00000461758	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	45.55	■■■■■ 4.88
TLE4-213	ENST00000461758	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		45.55	■■■■■ 4.88
TLE4-213	ENST00000461758	ADAMTS12	P58397	1594 aa		45.53	■■■■■ 4.88
TLE4-213	ENST00000461758	CUL7	Q14999	1698 aa		45.53	■■■■■ 4.88
TLE4-213	ENST00000461758	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		45.5	■■■■■ 4.87
TLE4-213	ENST00000461758	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		45.45	■■■■■ 4.87
TLE4-213	ENST00000461758	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		45.45	■■■■■ 4.87
TLE4-213	ENST00000461758	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		45.45	■■■■■ 4.87
TLE4-213	ENST00000461758	ARHGEF11	O15085	1522 aa		45.36	■■■■■ 4.85
TLE4-213	ENST00000461758	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		45.36	■■■■■ 4.85
TLE4-213	ENST00000461758	GRIN2A	Q12879	1464 aa		45.35	■■■■■ 4.85
TLE4-213	ENST00000461758	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		45.3	■■■■■ 4.84
TLE4-213	ENST00000461758	PRX	Q9BXM0	1461 aa		45.28	■■■■■ 4.84

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