RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458666.1

LMCD1-AS1-207, LMCD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene LMCD1-AS1, Length 581 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 NISCHQ9Y2I1 1504 aa25.51■■□□□ 1.67
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ABCC9O60706 1549 aa22.71■■□□□ 1.23
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa22.68■■□□□ 1.22
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 DCAF8L2P0C7V8 631 aa21.73■■□□□ 1.07
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.62■■□□□ 1.05
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 NACADO15069 1562 aa21.52■■□□□ 1.04
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP21.26■□□□□ 0.99
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 MYO15BQ96JP2 1530 aa21.25■□□□□ 0.99
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.13■□□□□ 0.97
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa21.04■□□□□ 0.96
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 BICRAQ9NZM4 1560 aa20.89■□□□□ 0.93
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 UNC13AQ9UPW8 1703 aa20.87■□□□□ 0.93
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SCRIBQ14160 1630 aa20.8■□□□□ 0.92
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa20.72■□□□□ 0.91
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CECR2Q9BXF3 1484 aa20.44■□□□□ 0.86
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.42■□□□□ 0.86
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 NCAPD3P42695 1498 aa19.9■□□□□ 0.78
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa19.86■□□□□ 0.77
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SMARCA2P51531 1590 aa19.81■□□□□ 0.76
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SMARCA4P51532 1647 aa19.8■□□□□ 0.76
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 HMGXB3Q12766 1538 aa19.71■□□□□ 0.75
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ERCC6Q03468 1493 aa19.67■□□□□ 0.74
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 MROH2BQ7Z745 1585 aa19.66■□□□□ 0.74
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PEG3Q9GZU2 1588 aa19.59■□□□□ 0.73
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 NESP48681 1621 aa19.51■□□□□ 0.71
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CUX2O14529 1486 aa19.48■□□□□ 0.71
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PDS5BQ9NTI5 1447 aa19.38■□□□□ 0.69
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 WIZO95785 1651 aa19.36■□□□□ 0.69
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa19.36■□□□□ 0.69
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CADPSQ9ULU8 1353 aa19.36■□□□□ 0.69
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa19.32■□□□□ 0.68
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 MRC2Q9UBG0 1479 aa19.15■□□□□ 0.66
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa19.12■□□□□ 0.65
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CFTRP13569 1480 aa19.12■□□□□ 0.65
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 FANCD2Q9BXW9 1451 aa19.12■□□□□ 0.65
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CEP164Q9UPV0 1460 aa19.12■□□□□ 0.65
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 WDR62O43379 1518 aa19.02■□□□□ 0.64
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CCDC88BA6NC98 1476 aa19.02■□□□□ 0.63
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ABCC8Q09428 1581 aa18.74■□□□□ 0.59
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 IFT140Q96RY7 1462 aa18.74■□□□□ 0.59
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 OSCARQ8IYS5 282 aa18.74■□□□□ 0.59
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 TOPBP1Q92547 1522 aa18.74■□□□□ 0.59
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PRDM2Q13029 1718 aa18.69■□□□□ 0.58
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 DNMBPQ6XZF7 1577 aa18.65■□□□□ 0.58
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 TRIM41Q8WV44 630 aa18.65■□□□□ 0.58
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SOGA1O94964 1423 aa18.56■□□□□ 0.56
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP18.55■□□□□ 0.56
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 FBLN2P98095 1184 aa18.55■□□□□ 0.56
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa18.52■□□□□ 0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 FGD5Q6ZNL6 1462 aa18.48■□□□□ 0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CUX1P39880 1505 aa18.45■□□□□ 0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 GRIN2BQ13224 1484 aa18.35■□□□□ 0.53
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa18.35■□□□□ 0.53
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP18.33■□□□□ 0.53
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 WDR97A6NE52 1622 aa18.31■□□□□ 0.52
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CYB5RLQ6IPT4 315 aa18.3■□□□□ 0.52
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 GAPVD1Q14C86 1478 aa18.3■□□□□ 0.52
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ARHGEF11O15085 1522 aa18.29■□□□□ 0.52
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa18.27■□□□□ 0.51
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa18.27■□□□□ 0.51
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa18.27■□□□□ 0.51
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa18.27■□□□□ 0.51
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SYNJ2O15056 1496 aa18.25■□□□□ 0.51
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CHD1O14646 1710 aa18.23■□□□□ 0.51
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SYNJ1O43426 1573 aa18.18■□□□□ 0.5
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 TOP2BQ02880 1626 aa18.18■□□□□ 0.5
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa18.13■□□□□ 0.49
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ARAP1Q96P48 1450 aa18.13■□□□□ 0.49
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa18.12■□□□□ 0.49
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CLASP1Q7Z460 1538 aa18.11■□□□□ 0.49
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 TRHP20396 242 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 FHAD1B1AJZ9 1412 aa18.09■□□□□ 0.49
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PBRM1Q86U86 1689 aa18.09■□□□□ 0.49
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 GRIN2AQ12879 1464 aa18.07■□□□□ 0.48
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ERICH3Q5RHP9 1530 aa18.03■□□□□ 0.48
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ADAMTS12P58397 1594 aa18.02■□□□□ 0.48
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 NUP160Q12769 1436 aa17.99■□□□□ 0.47
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 KIF27Q86VH2 1401 aa17.98■□□□□ 0.47
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CEP170Q5SW79 1584 aa17.94■□□□□ 0.46
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 JPH4Q96JJ6 628 aa17.93■□□□□ 0.46
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 IGF1RP08069 1367 aa17.92■□□□□ 0.46
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ERCC6L2Q5T890 1561 aa17.84■□□□□ 0.45
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms