RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446950.5

CCDC13-AS1-202, CCDC13 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene CCDC13-AS1, Length 554 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 NISCHQ9Y2I1 1504 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa12.84□□□□□ -0.35
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa12.27□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 MYO15BQ96JP2 1530 aa12.07□□□□□ -0.48
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 NACADO15069 1562 aa11.83□□□□□ -0.52
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa11.78□□□□□ -0.52
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 ABCC9O60706 1549 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 DCAF8L2P0C7V8 631 aa11.66□□□□□ -0.54
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 SCRIBQ14160 1630 aa11.57□□□□□ -0.56
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 UNC13AQ9UPW8 1703 aa11.35□□□□□ -0.59
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 SMARCA4P51532 1647 aa11.22□□□□□ -0.61
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 MROH2BQ7Z745 1585 aa11.21□□□□□ -0.61
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 CHIC1Q5VXU3 224 aa11.21□□□□□ -0.61
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 CECR2Q9BXF3 1484 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 PEG3Q9GZU2 1588 aa11.17□□□□□ -0.62
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 BICRAQ9NZM4 1560 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 WIZO95785 1651 aa11.14□□□□□ -0.63
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 SMARCA2P51531 1590 aa11.04□□□□□ -0.64
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 HMGXB3Q12766 1538 aa10.93□□□□□ -0.66
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 CCDC88BA6NC98 1476 aa10.93□□□□□ -0.66
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 TRIM41Q8WV44 630 aa10.91□□□□□ -0.66
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa10.91□□□□□ -0.66
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 EEA1Q15075 1411 aa10.87□□□□□ -0.67
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 NCAPD3P42695 1498 aa10.84□□□□□ -0.67
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP10.82□□□□□ -0.68
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 PRDM2Q13029 1718 aa10.78□□□□□ -0.68
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP10.74□□□□□ -0.69
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 ABCC8Q09428 1581 aa10.73□□□□□ -0.69
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa10.71□□□□□ -0.69
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 TOP2BQ02880 1626 aa10.69□□□□□ -0.7
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 KIF21BO75037 1637 aa10.67□□□□□ -0.7
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 SYNJ1O43426 1573 aa10.65□□□□□ -0.7
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 CFTRP13569 1480 aa10.65□□□□□ -0.7
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa10.63□□□□□ -0.71
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 GOLGA3Q08378 1498 aa10.62□□□□□ -0.71
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 CEP164Q9UPV0 1460 aa10.61□□□□□ -0.71
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 TNIKQ9UKE5 1360 aa10.6□□□□□ -0.71
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa10.58□□□□□ -0.72
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 ERICH3Q5RHP9 1530 aa10.58□□□□□ -0.72
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 CSRNP3Q8WYN3 585 aa10.55□□□□□ -0.72
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 SOGA1O94964 1423 aa10.55□□□□□ -0.72
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 CEP162Q5TB80 1403 aa10.52□□□□□ -0.73
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 CADPSQ9ULU8 1353 aa10.52□□□□□ -0.73
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 CUX1P39880 1505 aa10.5□□□□□ -0.73
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 HRCP23327 699 aa10.5□□□□□ -0.73
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa10.5□□□□□ -0.73
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 KIF27Q86VH2 1401 aa10.49□□□□□ -0.73
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 PCGF6Q9BYE7 350 aa10.48□□□□□ -0.73
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 PRXQ9BXM0 1461 aa10.45□□□□□ -0.74
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 DNMBPQ6XZF7 1577 aa10.44□□□□□ -0.74
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa10.43□□□□□ -0.74
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 FANCD2Q9BXW9 1451 aa10.4□□□□□ -0.74
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 CLIP1P30622 1438 aa10.4□□□□□ -0.75
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 VPS8Q8N3P4 1428 aa10.39□□□□□ -0.75
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa10.38□□□□□ -0.75
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 UBTFP17480 764 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 CUL7Q14999 1698 aa10.38□□□□□ -0.75
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 FGD5Q6ZNL6 1462 aa10.36□□□□□ -0.75
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa10.35□□□□□ -0.75
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 PDS5BQ9NTI5 1447 aa10.34□□□□□ -0.75
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 WDR97A6NE52 1622 aa10.34□□□□□ -0.75
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 TOPBP1Q92547 1522 aa10.32□□□□□ -0.76
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 CUX2O14529 1486 aa10.31□□□□□ -0.76
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 MAP3K1Q13233 1512 aa10.29□□□□□ -0.76
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 EFCAB5A4FU69 1503 aa10.28□□□□□ -0.76
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa10.26□□□□□ -0.77
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa10.26□□□□□ -0.77
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 IGF1RP08069 1367 aa10.26□□□□□ -0.77
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 ARAP1Q96P48 1450 aa10.24□□□□□ -0.77
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 APLP2Q06481 763 aa10.24□□□□□ -0.77
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa10.24□□□□□ -0.77
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa10.23□□□□□ -0.77
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 FHAD1B1AJZ9 1412 aa10.23□□□□□ -0.77
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 EHMT2Q96KQ7 1210 aa10.22□□□□□ -0.77
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 NESP48681 1621 aa10.2□□□□□ -0.78
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa10.2□□□□□ -0.78
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 CFAP43Q8NDM7 1665 aa10.19□□□□□ -0.78
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP10.19□□□□□ -0.78
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 MRC2Q9UBG0 1479 aa10.18□□□□□ -0.78
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 WDR62O43379 1518 aa10.16□□□□□ -0.78
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 GAPVD1Q14C86 1478 aa10.16□□□□□ -0.78
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 FYCO1Q9BQS8 1478 aa10.16□□□□□ -0.78
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 PBRM1Q86U86 1689 aa10.15□□□□□ -0.78
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 TIAM1Q13009 1591 aa10.15□□□□□ -0.78
CCDC13-AS1-202ENST00000446950 SAMD9Q5K651 1589 aa10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.5 ms