RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443900.1

SMYD5-204, Transcript of SMYD family member 5, humanhuman

TSL 4

Gene SMYD5, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD5-204ENST00000443900 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.62■■■■■ 5.53
SMYD5-204ENST00000443900 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.12■■■■■ 4.65
SMYD5-204ENST00000443900 ABCC9O60706 1549 aa43.55■■■■■ 4.56
SMYD5-204ENST00000443900 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.76■■■■■ 4.28
SMYD5-204ENST00000443900 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.71■■■■■ 4.27
SMYD5-204ENST00000443900 NACADO15069 1562 aa41.59■■■■■ 4.25
SMYD5-204ENST00000443900 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
SMYD5-204ENST00000443900 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.23■■■■■ 4.19
SMYD5-204ENST00000443900 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.98■■■■■ 4.15
SMYD5-204ENST00000443900 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.74■■■■■ 4.11
SMYD5-204ENST00000443900 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.7■■■■■ 4.11
SMYD5-204ENST00000443900 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.45■■■■■ 4.07
SMYD5-204ENST00000443900 SCRIBQ14160 1630 aa40.34■■■■■ 4.05
SMYD5-204ENST00000443900 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.24■■■■■ 4.03
SMYD5-204ENST00000443900 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.94■■■■□ 3.98
SMYD5-204ENST00000443900 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.42■■■■□ 3.9
SMYD5-204ENST00000443900 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.32■■■■□ 3.89
SMYD5-204ENST00000443900 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.14■■■■□ 3.86
SMYD5-204ENST00000443900 SMARCA4P51532 1647 aa38.52■■■■□ 3.76
SMYD5-204ENST00000443900 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.46■■■■□ 3.75
SMYD5-204ENST00000443900 NCAPD3P42695 1498 aa38.41■■■■□ 3.74
SMYD5-204ENST00000443900 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.41■■■■□ 3.74
SMYD5-204ENST00000443900 SMARCA2P51531 1590 aa38.32■■■■□ 3.73
SMYD5-204ENST00000443900 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.26■■■■□ 3.72
SMYD5-204ENST00000443900 HMGXB3Q12766 1538 aa38.15■■■■□ 3.7
SMYD5-204ENST00000443900 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.11■■■■□ 3.69
SMYD5-204ENST00000443900 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.09■■■■□ 3.69
SMYD5-204ENST00000443900 WIZO95785 1651 aa37.82■■■■□ 3.65
SMYD5-204ENST00000443900 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.76■■■■□ 3.63
SMYD5-204ENST00000443900 NESP48681 1621 aa37.61■■■■□ 3.61
SMYD5-204ENST00000443900 ERCC6Q03468 1493 aa37.55■■■■□ 3.6
SMYD5-204ENST00000443900 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.4■■■■□ 3.58
SMYD5-204ENST00000443900 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.37■■■■□ 3.57
SMYD5-204ENST00000443900 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.32■■■■□ 3.57
SMYD5-204ENST00000443900 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.23■■■■□ 3.55
SMYD5-204ENST00000443900 CUX2O14529 1486 aa37.17■■■■□ 3.54
SMYD5-204ENST00000443900 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.09■■■■□ 3.53
SMYD5-204ENST00000443900 CFTRP13569 1480 aa37.01■■■■□ 3.52
SMYD5-204ENST00000443900 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.01■■■■□ 3.51
SMYD5-204ENST00000443900 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37■■■■□ 3.51
SMYD5-204ENST00000443900 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.88■■■■□ 3.5
SMYD5-204ENST00000443900 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.84■■■■□ 3.49
SMYD5-204ENST00000443900 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.83■■■■□ 3.49
SMYD5-204ENST00000443900 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.76■■■■□ 3.48
SMYD5-204ENST00000443900 WDR62O43379 1518 aa36.69■■■■□ 3.46
SMYD5-204ENST00000443900 PRDM2Q13029 1718 aa36.6■■■■□ 3.45
SMYD5-204ENST00000443900 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.52■■■■□ 3.44
SMYD5-204ENST00000443900 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.41■■■■□ 3.42
SMYD5-204ENST00000443900 TOPBP1Q92547 1522 aa36.25■■■■□ 3.39
SMYD5-204ENST00000443900 ABCC8Q09428 1581 aa36.22■■■■□ 3.39
SMYD5-204ENST00000443900 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.16■■■■□ 3.38
SMYD5-204ENST00000443900 IFT140Q96RY7 1462 aa36.08■■■■□ 3.37
SMYD5-204ENST00000443900 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.97■■■■□ 3.35
SMYD5-204ENST00000443900 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
SMYD5-204ENST00000443900 CUX1P39880 1505 aa35.89■■■■□ 3.34
SMYD5-204ENST00000443900 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
SMYD5-204ENST00000443900 SOGA1O94964 1423 aa35.83■■■■□ 3.33
SMYD5-204ENST00000443900 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.83■■■■□ 3.33
SMYD5-204ENST00000443900 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.82■■■■□ 3.32
SMYD5-204ENST00000443900 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.76■■■■□ 3.32
SMYD5-204ENST00000443900 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.75■■■■□ 3.31
SMYD5-204ENST00000443900 OSCARQ8IYS5 282 aa35.71■■■■□ 3.31
SMYD5-204ENST00000443900 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.69■■■■□ 3.3
SMYD5-204ENST00000443900 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.6■■■■□ 3.29
SMYD5-204ENST00000443900 SYNJ1O43426 1573 aa35.49■■■■□ 3.27
SMYD5-204ENST00000443900 WDR97A6NE52 1622 aa35.49■■■■□ 3.27
SMYD5-204ENST00000443900 TOP2BQ02880 1626 aa35.49■■■■□ 3.27
SMYD5-204ENST00000443900 FBLN2P98095 1184 aa35.47■■■■□ 3.27
SMYD5-204ENST00000443900 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.46■■■■□ 3.27
SMYD5-204ENST00000443900 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.43■■■■□ 3.26
SMYD5-204ENST00000443900 GRIN2BQ13224 1484 aa35.4■■■■□ 3.26
SMYD5-204ENST00000443900 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.39■■■■□ 3.26
SMYD5-204ENST00000443900 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.39■■■■□ 3.26
SMYD5-204ENST00000443900 CHD1O14646 1710 aa35.34■■■■□ 3.25
SMYD5-204ENST00000443900 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
SMYD5-204ENST00000443900 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
SMYD5-204ENST00000443900 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.28■■■■□ 3.24
SMYD5-204ENST00000443900 PBRM1Q86U86 1689 aa35.24■■■■□ 3.23
SMYD5-204ENST00000443900 TRIM41Q8WV44 630 aa35.19■■■■□ 3.22
SMYD5-204ENST00000443900 SYNJ2O15056 1496 aa35.18■■■■□ 3.22
SMYD5-204ENST00000443900 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.06■■■■□ 3.2
SMYD5-204ENST00000443900 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.06■■■■□ 3.2
SMYD5-204ENST00000443900 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.06■■■■□ 3.2
SMYD5-204ENST00000443900 ARHGEF11O15085 1522 aa35.04■■■■□ 3.2
SMYD5-204ENST00000443900 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35■■■■□ 3.19
SMYD5-204ENST00000443900 ADAMTS12P58397 1594 aa34.97■■■■□ 3.19
SMYD5-204ENST00000443900 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.96■■■■□ 3.19
SMYD5-204ENST00000443900 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.96■■■■□ 3.19
SMYD5-204ENST00000443900 GRIN2AQ12879 1464 aa34.93■■■■□ 3.18
SMYD5-204ENST00000443900 KIF27Q86VH2 1401 aa34.89■■■■□ 3.18
SMYD5-204ENST00000443900 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.85■■■■□ 3.17
SMYD5-204ENST00000443900 IGF1RP08069 1367 aa34.8■■■■□ 3.16
SMYD5-204ENST00000443900 NUP160Q12769 1436 aa34.77■■■■□ 3.16
SMYD5-204ENST00000443900 ARAP1Q96P48 1450 aa34.75■■■■□ 3.15
SMYD5-204ENST00000443900 CEP170Q5SW79 1584 aa34.74■■■■□ 3.15
SMYD5-204ENST00000443900 CUL7Q14999 1698 aa34.6■■■■□ 3.13
SMYD5-204ENST00000443900 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.59■■■■□ 3.13
SMYD5-204ENST00000443900 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.53■■■■□ 3.12
SMYD5-204ENST00000443900 JPH4Q96JJ6 628 aa34.52■■■■□ 3.12
SMYD5-204ENST00000443900 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.51■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 107 ms