RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442666.1

PKP4-AS1-202, PKP4 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PKP4-AS1, Length 825 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-AS1-202ENST00000442666 NISCHQ9Y2I1 1504 aa14.61□□□□□ -0.07
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PKP4-AS1-202ENST00000442666 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
PKP4-AS1-202ENST00000442666 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa12.18□□□□□ -0.46
PKP4-AS1-202ENST00000442666 MYO15BQ96JP2 1530 aa12.18□□□□□ -0.46
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PKP4-AS1-202ENST00000442666 DCAF8L2P0C7V8 631 aa12.07□□□□□ -0.48
PKP4-AS1-202ENST00000442666 UNC13AQ9UPW8 1703 aa11.97□□□□□ -0.49
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PKP4-AS1-202ENST00000442666 CECR2Q9BXF3 1484 aa11.32□□□□□ -0.6
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PKP4-AS1-202ENST00000442666 PEG3Q9GZU2 1588 aa11.26□□□□□ -0.61
PKP4-AS1-202ENST00000442666 MROH2BQ7Z745 1585 aa11.24□□□□□ -0.61
PKP4-AS1-202ENST00000442666 NCAPD3P42695 1498 aa11.22□□□□□ -0.61
PKP4-AS1-202ENST00000442666 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa11.21□□□□□ -0.61
PKP4-AS1-202ENST00000442666 HMGXB3Q12766 1538 aa11.2□□□□□ -0.62
PKP4-AS1-202ENST00000442666 WIZO95785 1651 aa11.15□□□□□ -0.62
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PKP4-AS1-202ENST00000442666 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
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PKP4-AS1-202ENST00000442666 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa10.94□□□□□ -0.66
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PKP4-AS1-202ENST00000442666 PRDM2Q13029 1718 aa10.91□□□□□ -0.66
PKP4-AS1-202ENST00000442666 CCDC88BA6NC98 1476 aa10.87□□□□□ -0.67
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PKP4-AS1-202ENST00000442666 CADPSQ9ULU8 1353 aa10.87□□□□□ -0.67
PKP4-AS1-202ENST00000442666 NESP48681 1621 aa10.86□□□□□ -0.67
PKP4-AS1-202ENST00000442666 CFTRP13569 1480 aa10.84□□□□□ -0.67
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PKP4-AS1-202ENST00000442666 PDS5BQ9NTI5 1447 aa10.83□□□□□ -0.68
PKP4-AS1-202ENST00000442666 ERCC6Q03468 1493 aa10.81□□□□□ -0.68
PKP4-AS1-202ENST00000442666 FANCD2Q9BXW9 1451 aa10.74□□□□□ -0.69
PKP4-AS1-202ENST00000442666 CEP164Q9UPV0 1460 aa10.74□□□□□ -0.69
PKP4-AS1-202ENST00000442666 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
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PKP4-AS1-202ENST00000442666 MRC2Q9UBG0 1479 aa10.7□□□□□ -0.7
PKP4-AS1-202ENST00000442666 WDR62O43379 1518 aa10.68□□□□□ -0.7
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PKP4-AS1-202ENST00000442666 CUX1P39880 1505 aa10.53□□□□□ -0.72
PKP4-AS1-202ENST00000442666 TOP2BQ02880 1626 aa10.53□□□□□ -0.72
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PKP4-AS1-202ENST00000442666 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
PKP4-AS1-202ENST00000442666 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
PKP4-AS1-202ENST00000442666 WDR97A6NE52 1622 aa10.49□□□□□ -0.73
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PKP4-AS1-202ENST00000442666 SYNJ1O43426 1573 aa10.48□□□□□ -0.73
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PKP4-AS1-202ENST00000442666 PLPPR3Q6T4P5 718 aa10.44□□□□□ -0.74
PKP4-AS1-202ENST00000442666 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
PKP4-AS1-202ENST00000442666 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa10.42□□□□□ -0.74
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PKP4-AS1-202ENST00000442666 PBRM1Q86U86 1689 aa10.39□□□□□ -0.75
PKP4-AS1-202ENST00000442666 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa10.39□□□□□ -0.75
PKP4-AS1-202ENST00000442666 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP10.36□□□□□ -0.75
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PKP4-AS1-202ENST00000442666 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
PKP4-AS1-202ENST00000442666 CHD1O14646 1710 aa10.33□□□□□ -0.76
PKP4-AS1-202ENST00000442666 ERICH3Q5RHP9 1530 aa10.32□□□□□ -0.76
PKP4-AS1-202ENST00000442666 TRIM41Q8WV44 630 aa10.3□□□□□ -0.76
PKP4-AS1-202ENST00000442666 KIF27Q86VH2 1401 aa10.3□□□□□ -0.76
PKP4-AS1-202ENST00000442666 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa10.28□□□□□ -0.76
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PKP4-AS1-202ENST00000442666 MSH5O43196 834 aa10.27□□□□□ -0.77
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PKP4-AS1-202ENST00000442666 ADAMTS12P58397 1594 aa10.26□□□□□ -0.77
PKP4-AS1-202ENST00000442666 OSCARQ8IYS5 282 aa10.24□□□□□ -0.77
PKP4-AS1-202ENST00000442666 FHAD1B1AJZ9 1412 aa10.24□□□□□ -0.77
PKP4-AS1-202ENST00000442666 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
PKP4-AS1-202ENST00000442666 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa10.21□□□□□ -0.77
PKP4-AS1-202ENST00000442666 IGF1RP08069 1367 aa10.21□□□□□ -0.78
PKP4-AS1-202ENST00000442666 GRIN2AQ12879 1464 aa10.21□□□□□ -0.78
PKP4-AS1-202ENST00000442666 EEA1Q15075 1411 aa10.2□□□□□ -0.78
PKP4-AS1-202ENST00000442666 PPP6R1Q9UPN7 881 aa10.2□□□□□ -0.78
PKP4-AS1-202ENST00000442666 FBLN2P98095 1184 aa10.19□□□□□ -0.78
PKP4-AS1-202ENST00000442666 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa10.17□□□□□ -0.78
PKP4-AS1-202ENST00000442666 CLASP1Q7Z460 1538 aa10.17□□□□□ -0.78
PKP4-AS1-202ENST00000442666 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa10.16□□□□□ -0.78
PKP4-AS1-202ENST00000442666 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
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