RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441455.1

RPSAP20-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 20, humanhuman

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Gene RPSAP20, Length 890 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP20-201ENST00000441455 NISCHQ9Y2I1 1504 aa24.4■■□□□ 1.5
RPSAP20-201ENST00000441455 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa21.44■■□□□ 1.02
RPSAP20-201ENST00000441455 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
RPSAP20-201ENST00000441455 ABCC9O60706 1549 aa20.42■□□□□ 0.86
RPSAP20-201ENST00000441455 DCAF8L2P0C7V8 631 aa20.2■□□□□ 0.82
RPSAP20-201ENST00000441455 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa20.16■□□□□ 0.82
RPSAP20-201ENST00000441455 MYO15BQ96JP2 1530 aa19.98■□□□□ 0.79
RPSAP20-201ENST00000441455 NACADO15069 1562 aa19.96■□□□□ 0.79
RPSAP20-201ENST00000441455 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa19.87■□□□□ 0.77
RPSAP20-201ENST00000441455 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa19.78■□□□□ 0.76
RPSAP20-201ENST00000441455 SCRIBQ14160 1630 aa19.69■□□□□ 0.74
RPSAP20-201ENST00000441455 UNC13AQ9UPW8 1703 aa19.53■□□□□ 0.72
RPSAP20-201ENST00000441455 BICRAQ9NZM4 1560 aa19.25■□□□□ 0.67
RPSAP20-201ENST00000441455 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP19.16■□□□□ 0.66
RPSAP20-201ENST00000441455 CECR2Q9BXF3 1484 aa18.97■□□□□ 0.63
RPSAP20-201ENST00000441455 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 MROH2BQ7Z745 1585 aa18.85■□□□□ 0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 SMARCA4P51532 1647 aa18.84■□□□□ 0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
RPSAP20-201ENST00000441455 WIZO95785 1651 aa18.73■□□□□ 0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
RPSAP20-201ENST00000441455 PEG3Q9GZU2 1588 aa18.58■□□□□ 0.56
RPSAP20-201ENST00000441455 SMARCA2P51531 1590 aa18.54■□□□□ 0.56
RPSAP20-201ENST00000441455 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa18.53■□□□□ 0.56
RPSAP20-201ENST00000441455 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
RPSAP20-201ENST00000441455 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa18.49■□□□□ 0.55
RPSAP20-201ENST00000441455 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
RPSAP20-201ENST00000441455 HMGXB3Q12766 1538 aa18.39■□□□□ 0.54
RPSAP20-201ENST00000441455 NCAPD3P42695 1498 aa18.38■□□□□ 0.53
RPSAP20-201ENST00000441455 CCDC88BA6NC98 1476 aa18.27■□□□□ 0.52
RPSAP20-201ENST00000441455 DNAJC5BQ9UF47 199 aa18.09■□□□□ 0.49
RPSAP20-201ENST00000441455 PRDM2Q13029 1718 aa17.97■□□□□ 0.47
RPSAP20-201ENST00000441455 CHIC1Q5VXU3 224 aa17.94■□□□□ 0.46
RPSAP20-201ENST00000441455 CFTRP13569 1480 aa17.93■□□□□ 0.46
RPSAP20-201ENST00000441455 CADPSQ9ULU8 1353 aa17.9■□□□□ 0.46
RPSAP20-201ENST00000441455 ABCC8Q09428 1581 aa17.88■□□□□ 0.45
RPSAP20-201ENST00000441455 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa17.86■□□□□ 0.45
RPSAP20-201ENST00000441455 NESP48681 1621 aa17.85■□□□□ 0.45
RPSAP20-201ENST00000441455 TRIM41Q8WV44 630 aa17.76■□□□□ 0.43
RPSAP20-201ENST00000441455 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP17.75■□□□□ 0.43
RPSAP20-201ENST00000441455 FANCD2Q9BXW9 1451 aa17.74■□□□□ 0.43
RPSAP20-201ENST00000441455 SYNJ1O43426 1573 aa17.72■□□□□ 0.43
RPSAP20-201ENST00000441455 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa17.71■□□□□ 0.42
RPSAP20-201ENST00000441455 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa17.68■□□□□ 0.42
RPSAP20-201ENST00000441455 PDS5BQ9NTI5 1447 aa17.67■□□□□ 0.42
RPSAP20-201ENST00000441455 CEP164Q9UPV0 1460 aa17.67■□□□□ 0.42
RPSAP20-201ENST00000441455 TOP2BQ02880 1626 aa17.65■□□□□ 0.42
RPSAP20-201ENST00000441455 CUX1P39880 1505 aa17.64■□□□□ 0.41
RPSAP20-201ENST00000441455 DNMBPQ6XZF7 1577 aa17.57■□□□□ 0.4
RPSAP20-201ENST00000441455 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
RPSAP20-201ENST00000441455 TOPBP1Q92547 1522 aa17.53■□□□□ 0.4
RPSAP20-201ENST00000441455 ERCC6Q03468 1493 aa17.53■□□□□ 0.4
RPSAP20-201ENST00000441455 FGD5Q6ZNL6 1462 aa17.5■□□□□ 0.39
RPSAP20-201ENST00000441455 MRC2Q9UBG0 1479 aa17.5■□□□□ 0.39
RPSAP20-201ENST00000441455 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
RPSAP20-201ENST00000441455 SOGA1O94964 1423 aa17.45■□□□□ 0.38
RPSAP20-201ENST00000441455 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
RPSAP20-201ENST00000441455 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
RPSAP20-201ENST00000441455 WDR62O43379 1518 aa17.42■□□□□ 0.38
RPSAP20-201ENST00000441455 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa17.41■□□□□ 0.38
RPSAP20-201ENST00000441455 EEA1Q15075 1411 aa17.38■□□□□ 0.37
RPSAP20-201ENST00000441455 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa17.37■□□□□ 0.37
RPSAP20-201ENST00000441455 WDR97A6NE52 1622 aa17.36■□□□□ 0.37
RPSAP20-201ENST00000441455 CUX2O14529 1486 aa17.33■□□□□ 0.37
RPSAP20-201ENST00000441455 KIF27Q86VH2 1401 aa17.31■□□□□ 0.36
RPSAP20-201ENST00000441455 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa17.31■□□□□ 0.36
RPSAP20-201ENST00000441455 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
RPSAP20-201ENST00000441455 CSRNP3Q8WYN3 585 aa17.27■□□□□ 0.36
RPSAP20-201ENST00000441455 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa17.25■□□□□ 0.35
RPSAP20-201ENST00000441455 EHMT2Q96KQ7 1210 aa17.25■□□□□ 0.35
RPSAP20-201ENST00000441455 IFT140Q96RY7 1462 aa17.24■□□□□ 0.35
RPSAP20-201ENST00000441455 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa17.23■□□□□ 0.35
RPSAP20-201ENST00000441455 KIF21BO75037 1637 aa17.21■□□□□ 0.35
RPSAP20-201ENST00000441455 PBRM1Q86U86 1689 aa17.19■□□□□ 0.34
RPSAP20-201ENST00000441455 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
RPSAP20-201ENST00000441455 GAPVD1Q14C86 1478 aa17.17■□□□□ 0.34
RPSAP20-201ENST00000441455 GOLGA3Q08378 1498 aa17.16■□□□□ 0.34
RPSAP20-201ENST00000441455 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
RPSAP20-201ENST00000441455 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
RPSAP20-201ENST00000441455 CUL7Q14999 1698 aa17.13■□□□□ 0.33
RPSAP20-201ENST00000441455 IGF1RP08069 1367 aa17.13■□□□□ 0.33
RPSAP20-201ENST00000441455 PRXQ9BXM0 1461 aa17.12■□□□□ 0.33
RPSAP20-201ENST00000441455 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP17.12■□□□□ 0.33
RPSAP20-201ENST00000441455 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa17.12■□□□□ 0.33
RPSAP20-201ENST00000441455 ERICH3Q5RHP9 1530 aa17.11■□□□□ 0.33
RPSAP20-201ENST00000441455 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa17.07■□□□□ 0.32
RPSAP20-201ENST00000441455 GRIN2BQ13224 1484 aa17.06■□□□□ 0.32
RPSAP20-201ENST00000441455 UBTFP17480 764 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
RPSAP20-201ENST00000441455 ADAMTS12P58397 1594 aa17.03■□□□□ 0.32
RPSAP20-201ENST00000441455 TNIKQ9UKE5 1360 aa17.02■□□□□ 0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa17■□□□□ 0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.96■□□□□ 0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa16.96■□□□□ 0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
RPSAP20-201ENST00000441455 CEP162Q5TB80 1403 aa16.94■□□□□ 0.3
RPSAP20-201ENST00000441455 SYNJ2O15056 1496 aa16.87■□□□□ 0.29
RPSAP20-201ENST00000441455 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
RPSAP20-201ENST00000441455 GRIN2AQ12879 1464 aa16.86■□□□□ 0.29
RPSAP20-201ENST00000441455 CLIP1P30622 1438 aa16.86■□□□□ 0.29
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