RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430985.1

TSPAN12-204, Transcript of tetraspanin 12, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN12, Length 693 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN12-204ENST00000430985 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.39■■■■■ 5.5
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TSPAN12-204ENST00000430985 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.93■■■■■ 4.14
TSPAN12-204ENST00000430985 NACADO15069 1562 aa40.87■■■■■ 4.13
TSPAN12-204ENST00000430985 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.78■■■■■ 4.12
TSPAN12-204ENST00000430985 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.71■■■■■ 4.11
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TSPAN12-204ENST00000430985 SCRIBQ14160 1630 aa39.75■■■■□ 3.95
TSPAN12-204ENST00000430985 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.46■■■■□ 3.91
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TSPAN12-204ENST00000430985 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.34■■■■□ 3.73
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TSPAN12-204ENST00000430985 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.85■■■■□ 3.65
TSPAN12-204ENST00000430985 SMARCA2P51531 1590 aa37.8■■■■□ 3.64
TSPAN12-204ENST00000430985 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.79■■■■□ 3.64
TSPAN12-204ENST00000430985 NCAPD3P42695 1498 aa37.71■■■■□ 3.63
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TSPAN12-204ENST00000430985 HMGXB3Q12766 1538 aa37.58■■■■□ 3.61
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TSPAN12-204ENST00000430985 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.58■■■■□ 3.45
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TSPAN12-204ENST00000430985 NESP48681 1621 aa36.48■■■■□ 3.43
TSPAN12-204ENST00000430985 PRDM2Q13029 1718 aa36.31■■■■□ 3.4
TSPAN12-204ENST00000430985 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.3■■■■□ 3.4
TSPAN12-204ENST00000430985 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.16■■■■□ 3.38
TSPAN12-204ENST00000430985 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.08■■■■□ 3.37
TSPAN12-204ENST00000430985 ERCC6Q03468 1493 aa36.08■■■■□ 3.37
TSPAN12-204ENST00000430985 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.05■■■■□ 3.36
TSPAN12-204ENST00000430985 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.88■■■■□ 3.33
TSPAN12-204ENST00000430985 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
TSPAN12-204ENST00000430985 ABCC8Q09428 1581 aa35.76■■■■□ 3.32
TSPAN12-204ENST00000430985 WDR62O43379 1518 aa35.76■■■■□ 3.31
TSPAN12-204ENST00000430985 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.31
TSPAN12-204ENST00000430985 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.71■■■■□ 3.31
TSPAN12-204ENST00000430985 TOPBP1Q92547 1522 aa35.67■■■■□ 3.3
TSPAN12-204ENST00000430985 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.66■■■■□ 3.3
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TSPAN12-204ENST00000430985 CUX2O14529 1486 aa35.56■■■■□ 3.28
TSPAN12-204ENST00000430985 TOP2BQ02880 1626 aa35.54■■■■□ 3.28
TSPAN12-204ENST00000430985 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.54■■■■□ 3.28
TSPAN12-204ENST00000430985 SYNJ1O43426 1573 aa35.53■■■■□ 3.28
TSPAN12-204ENST00000430985 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
TSPAN12-204ENST00000430985 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.41■■■■□ 3.26
TSPAN12-204ENST00000430985 IFT140Q96RY7 1462 aa35.3■■■■□ 3.24
TSPAN12-204ENST00000430985 SOGA1O94964 1423 aa35.26■■■■□ 3.24
TSPAN12-204ENST00000430985 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.26■■■■□ 3.24
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TSPAN12-204ENST00000430985 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.2■■■■□ 3.23
TSPAN12-204ENST00000430985 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.15■■■■□ 3.22
TSPAN12-204ENST00000430985 WDR97A6NE52 1622 aa35.12■■■■□ 3.21
TSPAN12-204ENST00000430985 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.02■■■■□ 3.2
TSPAN12-204ENST00000430985 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.94■■■■□ 3.18
TSPAN12-204ENST00000430985 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.94■■■■□ 3.18
TSPAN12-204ENST00000430985 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.93■■■■□ 3.18
TSPAN12-204ENST00000430985 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.9■■■■□ 3.18
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TSPAN12-204ENST00000430985 GRIN2BQ13224 1484 aa34.8■■■■□ 3.16
TSPAN12-204ENST00000430985 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.75■■■■□ 3.15
TSPAN12-204ENST00000430985 PBRM1Q86U86 1689 aa34.74■■■■□ 3.15
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TSPAN12-204ENST00000430985 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.71■■■■□ 3.15
TSPAN12-204ENST00000430985 IGF1RP08069 1367 aa34.66■■■■□ 3.14
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TSPAN12-204ENST00000430985 NUP160Q12769 1436 aa34.21■■■■□ 3.07
TSPAN12-204ENST00000430985 OSCARQ8IYS5 282 aa34.14■■■■□ 3.06
TSPAN12-204ENST00000430985 CEP170Q5SW79 1584 aa34.12■■■■□ 3.05
TSPAN12-204ENST00000430985 GOLGA3Q08378 1498 aa34.1■■■■□ 3.05
TSPAN12-204ENST00000430985 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.05■■■■□ 3.04
TSPAN12-204ENST00000430985 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.03■■■■□ 3.04
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