RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NISCHQ9Y2I1 1504 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ABCC9O60706 1549 aa23.17■■□□□ 1.3
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP21.27■■□□□ 1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UNC13AQ9UPW8 1703 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NACADO15069 1562 aa20.91■□□□□ 0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BICRAQ9NZM4 1560 aa20.88■□□□□ 0.93
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CUX2O14529 1486 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DCAF8L2P0C7V8 631 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MYO15BQ96JP2 1530 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ERCC6Q03468 1493 aa20.12■□□□□ 0.81
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SCRIBQ14160 1630 aa19.68■□□□□ 0.74
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP19.43■□□□□ 0.7
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa19.39■□□□□ 0.69
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa19.39■□□□□ 0.69
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa19.39■□□□□ 0.69
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NCAPD3P42695 1498 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRHP20396 242 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SMARCA2P51531 1590 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa19.2■□□□□ 0.66
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARHGEF11O15085 1522 aa19.16■□□□□ 0.66
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa19.14■□□□□ 0.66
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HMGXB3Q12766 1538 aa19.05■□□□□ 0.64
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CYB5RLQ6IPT4 315 aa19.03■□□□□ 0.64
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WDR62O43379 1518 aa19.02■□□□□ 0.64
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa19.01■□□□□ 0.63
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MRC2Q9UBG0 1479 aa18.99■□□□□ 0.63
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARAP1Q96P48 1450 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CADPSQ9ULU8 1353 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SMARCA4P51532 1647 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CEP164Q9UPV0 1460 aa18.58■□□□□ 0.56
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PEG3Q9GZU2 1588 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FANCD2Q9BXW9 1451 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CHD1O14646 1710 aa18.4■□□□□ 0.54
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LMTK3Q96Q04 1460 aa18.38■□□□□ 0.53
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IFT140Q96RY7 1462 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HECW2Q9P2P5 1572 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CLASP1Q7Z460 1538 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KIF13AQ9H1H9 1805 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FBLN2P98095 1184 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ILDR2Q71H61 639 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CFTRP13569 1480 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GAPVD1Q14C86 1478 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SYNJ1O43426 1573 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MROH2BQ7Z745 1585 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP17.99■□□□□ 0.47
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SYNJ2O15056 1496 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KDM6BO15054 1643 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ADGRL1O94910 1474 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DISP3Q9P2K9 1392 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TOPBP1Q92547 1522 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PRDM2Q13029 1718 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ABCC8Q09428 1581 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ABCC10Q5T3U5 1492 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM69CQ0P6D2 419 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DNMBPQ6XZF7 1577 aa17.71■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WIZO95785 1651 aa17.7■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DIP2BQ9P265 1576 aa17.69■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa17.64■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WDR97A6NE52 1622 aa17.64■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TSPOAP1O95153 1857 aa17.6■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MAPKBP1O60336 1514 aa17.6■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CEP170Q5SW79 1584 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa17.54■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GRIN2BQ13224 1484 aa17.53■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TOP2BQ02880 1626 aa17.49■□□□□ 0.39
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SOGA1O94964 1423 aa17.47■□□□□ 0.39
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SHROOM2Q13796 1616 aa17.46■□□□□ 0.39
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP17.42■□□□□ 0.38
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