RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429561.1

SHANK2-AS1-201, SHANK2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SHANK2-AS1, Length 2,252 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.03■■□□□ 1.76
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa22.98■■□□□ 1.27
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 ABCC9O60706 1549 aa22■■□□□ 1.11
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa21.65■■□□□ 1.06
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 MYO15BQ96JP2 1530 aa21.62■■□□□ 1.05
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 NACADO15069 1562 aa21.55■■□□□ 1.04
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 DCAF8L2P0C7V8 631 aa21.49■■□□□ 1.03
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.44■■□□□ 1.02
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 SCRIBQ14160 1630 aa20.89■□□□□ 0.93
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 UNC13AQ9UPW8 1703 aa20.82■□□□□ 0.92
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 BICRAQ9NZM4 1560 aa20.72■□□□□ 0.91
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa20.72■□□□□ 0.91
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP20.62■□□□□ 0.89
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SHANK2-AS1-201ENST00000429561 CECR2Q9BXF3 1484 aa20.16■□□□□ 0.82
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 SMARCA4P51532 1647 aa20.08■□□□□ 0.81
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 MROH2BQ7Z745 1585 aa20.01■□□□□ 0.79
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 PEG3Q9GZU2 1588 aa19.95■□□□□ 0.78
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa19.95■□□□□ 0.78
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 SMARCA2P51531 1590 aa19.94■□□□□ 0.78
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa19.9■□□□□ 0.78
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 NCAPD3P42695 1498 aa19.88■□□□□ 0.77
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 DNAJC5BQ9UF47 199 aa19.81■□□□□ 0.76
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 HMGXB3Q12766 1538 aa19.81■□□□□ 0.76
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 WIZO95785 1651 aa19.77■□□□□ 0.76
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 CCDC88BA6NC98 1476 aa19.43■□□□□ 0.7
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SHANK2-AS1-201ENST00000429561 CFTRP13569 1480 aa19.28■□□□□ 0.68
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa19.27■□□□□ 0.68
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 PDS5BQ9NTI5 1447 aa19.16■□□□□ 0.66
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 NESP48681 1621 aa19.14■□□□□ 0.65
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 PRDM2Q13029 1718 aa19.08■□□□□ 0.64
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 FANCD2Q9BXW9 1451 aa19.04■□□□□ 0.64
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 CEP164Q9UPV0 1460 aa19■□□□□ 0.63
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 ERCC6Q03468 1493 aa18.99■□□□□ 0.63
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa18.91■□□□□ 0.62
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 ABCC8Q09428 1581 aa18.91■□□□□ 0.62
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 MRC2Q9UBG0 1479 aa18.89■□□□□ 0.62
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP18.83■□□□□ 0.6
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 WDR62O43379 1518 aa18.81■□□□□ 0.6
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 DNMBPQ6XZF7 1577 aa18.81■□□□□ 0.6
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
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SHANK2-AS1-201ENST00000429561 TOPBP1Q92547 1522 aa18.78■□□□□ 0.6
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 CUX1P39880 1505 aa18.76■□□□□ 0.59
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 TOP2BQ02880 1626 aa18.74■□□□□ 0.59
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa18.72■□□□□ 0.59
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 CUX2O14529 1486 aa18.71■□□□□ 0.59
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 SYNJ1O43426 1573 aa18.69■□□□□ 0.58
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 CHIC1Q5VXU3 224 aa18.66■□□□□ 0.58
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 TRIM41Q8WV44 630 aa18.65■□□□□ 0.58
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 FGD5Q6ZNL6 1462 aa18.64■□□□□ 0.57
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 IFT140Q96RY7 1462 aa18.61■□□□□ 0.57
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 SOGA1O94964 1423 aa18.6■□□□□ 0.57
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa18.54■□□□□ 0.56
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 WDR97A6NE52 1622 aa18.52■□□□□ 0.56
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa18.51■□□□□ 0.55
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 KIF27Q86VH2 1401 aa18.44■□□□□ 0.54
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 EEA1Q15075 1411 aa18.41■□□□□ 0.54
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 GAPVD1Q14C86 1478 aa18.39■□□□□ 0.53
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa18.38■□□□□ 0.53
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP18.36■□□□□ 0.53
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 GRIN2BQ13224 1484 aa18.35■□□□□ 0.53
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 ERICH3Q5RHP9 1530 aa18.33■□□□□ 0.53
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 IGF1RP08069 1367 aa18.29■□□□□ 0.52
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa18.26■□□□□ 0.51
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 CSRNP3Q8WYN3 585 aa18.25■□□□□ 0.51
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 PBRM1Q86U86 1689 aa18.25■□□□□ 0.51
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 MYT1Q01538 1121 aa18.24■□□□□ 0.51
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 FHAD1B1AJZ9 1412 aa18.22■□□□□ 0.51
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 CUL7Q14999 1698 aa18.22■□□□□ 0.51
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa18.22■□□□□ 0.51
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa18.19■□□□□ 0.5
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 SYNJ2O15056 1496 aa18.18■□□□□ 0.5
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 PRXQ9BXM0 1461 aa18.17■□□□□ 0.5
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 ADAMTS12P58397 1594 aa18.17■□□□□ 0.5
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa18.13■□□□□ 0.49
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 KIF21BO75037 1637 aa18.1■□□□□ 0.49
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 GRIN2AQ12879 1464 aa18.09■□□□□ 0.49
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 FBLN2P98095 1184 aa18.05■□□□□ 0.48
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 GOLGA3Q08378 1498 aa18.04■□□□□ 0.48
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 NUP160Q12769 1436 aa18.02■□□□□ 0.48
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 OSCARQ8IYS5 282 aa18■□□□□ 0.47
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 CHD1O14646 1710 aa17.99■□□□□ 0.47
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa17.96■□□□□ 0.46
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