RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429159.6

MEG3-208, Transcript of maternally expressed 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MEG3, Length 1,608 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEG3-208ENST00000429159 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.02■■■■■ 4.32
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MEG3-208ENST00000429159 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.7■■■■□ 3.15
MEG3-208ENST00000429159 ABCC9O60706 1549 aa34.57■■■■□ 3.12
MEG3-208ENST00000429159 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.45■■■■□ 3.11
MEG3-208ENST00000429159 NACADO15069 1562 aa34.22■■■■□ 3.07
MEG3-208ENST00000429159 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.17■■■■□ 3.06
MEG3-208ENST00000429159 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.92■■■■□ 3.02
MEG3-208ENST00000429159 SCRIBQ14160 1630 aa33.64■■■□□ 2.98
MEG3-208ENST00000429159 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.06■■■□□ 2.88
MEG3-208ENST00000429159 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.96■■■□□ 2.87
MEG3-208ENST00000429159 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.71■■■□□ 2.83
MEG3-208ENST00000429159 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.58■■■□□ 2.81
MEG3-208ENST00000429159 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.56■■■□□ 2.8
MEG3-208ENST00000429159 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.53■■■□□ 2.8
MEG3-208ENST00000429159 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.52■■■□□ 2.8
MEG3-208ENST00000429159 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.38■■■□□ 2.77
MEG3-208ENST00000429159 SMARCA4P51532 1647 aa32.3■■■□□ 2.76
MEG3-208ENST00000429159 WIZO95785 1651 aa32.12■■■□□ 2.73
MEG3-208ENST00000429159 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.94■■■□□ 2.7
MEG3-208ENST00000429159 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
MEG3-208ENST00000429159 SMARCA2P51531 1590 aa31.85■■■□□ 2.69
MEG3-208ENST00000429159 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.81■■■□□ 2.68
MEG3-208ENST00000429159 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.76■■■□□ 2.68
MEG3-208ENST00000429159 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.64■■■□□ 2.66
MEG3-208ENST00000429159 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.55■■■□□ 2.64
MEG3-208ENST00000429159 NCAPD3P42695 1498 aa31.52■■■□□ 2.64
MEG3-208ENST00000429159 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.51■■■□□ 2.63
MEG3-208ENST00000429159 HMGXB3Q12766 1538 aa31.51■■■□□ 2.63
MEG3-208ENST00000429159 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.47■■■□□ 2.63
MEG3-208ENST00000429159 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.32■■■□□ 2.6
MEG3-208ENST00000429159 TRIM41Q8WV44 630 aa31.09■■■□□ 2.57
MEG3-208ENST00000429159 CFTRP13569 1480 aa30.82■■■□□ 2.52
MEG3-208ENST00000429159 ABCC8Q09428 1581 aa30.79■■■□□ 2.52
MEG3-208ENST00000429159 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.73■■■□□ 2.51
MEG3-208ENST00000429159 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.72■■■□□ 2.51
MEG3-208ENST00000429159 PRDM2Q13029 1718 aa30.7■■■□□ 2.5
MEG3-208ENST00000429159 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.49■■■□□ 2.47
MEG3-208ENST00000429159 SYNJ1O43426 1573 aa30.49■■■□□ 2.47
MEG3-208ENST00000429159 TOP2BQ02880 1626 aa30.45■■■□□ 2.47
MEG3-208ENST00000429159 EEA1Q15075 1411 aa30.42■■■□□ 2.46
MEG3-208ENST00000429159 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.42■■■□□ 2.46
MEG3-208ENST00000429159 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
MEG3-208ENST00000429159 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.36■■■□□ 2.45
MEG3-208ENST00000429159 CUX1P39880 1505 aa30.3■■■□□ 2.44
MEG3-208ENST00000429159 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.3■■■□□ 2.44
MEG3-208ENST00000429159 NESP48681 1621 aa30.29■■■□□ 2.44
MEG3-208ENST00000429159 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.26■■■□□ 2.44
MEG3-208ENST00000429159 SOGA1O94964 1423 aa30.23■■■□□ 2.43
MEG3-208ENST00000429159 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.22■■■□□ 2.43
MEG3-208ENST00000429159 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.14■■■□□ 2.42
MEG3-208ENST00000429159 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.12■■■□□ 2.41
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MEG3-208ENST00000429159 TOPBP1Q92547 1522 aa30.02■■■□□ 2.4
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MEG3-208ENST00000429159 KIF27Q86VH2 1401 aa30■■■□□ 2.39
MEG3-208ENST00000429159 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.99■■■□□ 2.39
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MEG3-208ENST00000429159 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.89■■■□□ 2.37
MEG3-208ENST00000429159 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
MEG3-208ENST00000429159 CUX2O14529 1486 aa29.84■■■□□ 2.37
MEG3-208ENST00000429159 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.84■■■□□ 2.37
MEG3-208ENST00000429159 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.81■■■□□ 2.36
MEG3-208ENST00000429159 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.79■■■□□ 2.36
MEG3-208ENST00000429159 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
MEG3-208ENST00000429159 ERCC6Q03468 1493 aa29.77■■■□□ 2.36
MEG3-208ENST00000429159 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.74■■■□□ 2.35
MEG3-208ENST00000429159 PRXQ9BXM0 1461 aa29.71■■■□□ 2.35
MEG3-208ENST00000429159 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.71■■■□□ 2.35
MEG3-208ENST00000429159 WDR62O43379 1518 aa29.66■■■□□ 2.34
MEG3-208ENST00000429159 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.65■■■□□ 2.34
MEG3-208ENST00000429159 IGF1RP08069 1367 aa29.63■■■□□ 2.33
MEG3-208ENST00000429159 WDR97A6NE52 1622 aa29.62■■■□□ 2.33
MEG3-208ENST00000429159 CEP162Q5TB80 1403 aa29.6■■■□□ 2.33
MEG3-208ENST00000429159 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.54■■■□□ 2.32
MEG3-208ENST00000429159 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
MEG3-208ENST00000429159 IFT140Q96RY7 1462 aa29.51■■■□□ 2.31
MEG3-208ENST00000429159 CUL7Q14999 1698 aa29.5■■■□□ 2.31
MEG3-208ENST00000429159 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
MEG3-208ENST00000429159 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.5■■■□□ 2.31
MEG3-208ENST00000429159 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.49■■■□□ 2.31
MEG3-208ENST00000429159 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
MEG3-208ENST00000429159 CLIP1P30622 1438 aa29.4■■■□□ 2.3
MEG3-208ENST00000429159 PBRM1Q86U86 1689 aa29.29■■■□□ 2.28
MEG3-208ENST00000429159 GRIN2BQ13224 1484 aa29.29■■■□□ 2.28
MEG3-208ENST00000429159 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.25■■■□□ 2.27
MEG3-208ENST00000429159 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.2■■■□□ 2.27
MEG3-208ENST00000429159 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
MEG3-208ENST00000429159 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
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MEG3-208ENST00000429159 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.15■■■□□ 2.26
MEG3-208ENST00000429159 ADAMTS12P58397 1594 aa29.13■■■□□ 2.25
MEG3-208ENST00000429159 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.13■■■□□ 2.25
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MEG3-208ENST00000429159 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
MEG3-208ENST00000429159 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.03■■■□□ 2.24
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