RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427965.6

RRN3P2-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 2, humanhuman

TSL 2

Gene RRN3P2, Length 1,618 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P2-201ENST00000427965 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.03■■■□□ 2.56
RRN3P2-201ENST00000427965 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.14■■□□□ 1.94
RRN3P2-201ENST00000427965 ABCC9O60706 1549 aa26.15■■□□□ 1.78
RRN3P2-201ENST00000427965 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
RRN3P2-201ENST00000427965 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.97■■□□□ 1.75
RRN3P2-201ENST00000427965 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.54■■□□□ 1.68
RRN3P2-201ENST00000427965 NACADO15069 1562 aa25.37■■□□□ 1.65
RRN3P2-201ENST00000427965 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.33■■□□□ 1.65
RRN3P2-201ENST00000427965 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.33■■□□□ 1.64
RRN3P2-201ENST00000427965 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.27■■□□□ 1.64
RRN3P2-201ENST00000427965 SCRIBQ14160 1630 aa25.1■■□□□ 1.61
RRN3P2-201ENST00000427965 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.76■■□□□ 1.55
RRN3P2-201ENST00000427965 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.65■■□□□ 1.54
RRN3P2-201ENST00000427965 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.52■■□□□ 1.52
RRN3P2-201ENST00000427965 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.22■■□□□ 1.47
RRN3P2-201ENST00000427965 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
RRN3P2-201ENST00000427965 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.02■■□□□ 1.44
RRN3P2-201ENST00000427965 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
RRN3P2-201ENST00000427965 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
RRN3P2-201ENST00000427965 SMARCA4P51532 1647 aa23.94■■□□□ 1.42
RRN3P2-201ENST00000427965 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
RRN3P2-201ENST00000427965 WIZO95785 1651 aa23.82■■□□□ 1.4
RRN3P2-201ENST00000427965 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.62■■□□□ 1.37
RRN3P2-201ENST00000427965 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.58■■□□□ 1.37
RRN3P2-201ENST00000427965 SMARCA2P51531 1590 aa23.57■■□□□ 1.36
RRN3P2-201ENST00000427965 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.56■■□□□ 1.36
RRN3P2-201ENST00000427965 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
RRN3P2-201ENST00000427965 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
RRN3P2-201ENST00000427965 NCAPD3P42695 1498 aa23.42■■□□□ 1.34
RRN3P2-201ENST00000427965 HMGXB3Q12766 1538 aa23.36■■□□□ 1.33
RRN3P2-201ENST00000427965 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.36■■□□□ 1.33
RRN3P2-201ENST00000427965 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.3■■□□□ 1.32
RRN3P2-201ENST00000427965 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.86■■□□□ 1.25
RRN3P2-201ENST00000427965 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.85■■□□□ 1.25
RRN3P2-201ENST00000427965 NESP48681 1621 aa22.85■■□□□ 1.25
RRN3P2-201ENST00000427965 CFTRP13569 1480 aa22.84■■□□□ 1.25
RRN3P2-201ENST00000427965 ABCC8Q09428 1581 aa22.77■■□□□ 1.24
RRN3P2-201ENST00000427965 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.69■■□□□ 1.22
RRN3P2-201ENST00000427965 TRIM41Q8WV44 630 aa22.68■■□□□ 1.22
RRN3P2-201ENST00000427965 PRDM2Q13029 1718 aa22.66■■□□□ 1.22
RRN3P2-201ENST00000427965 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.63■■□□□ 1.21
RRN3P2-201ENST00000427965 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.6■■□□□ 1.21
RRN3P2-201ENST00000427965 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.56■■□□□ 1.2
RRN3P2-201ENST00000427965 SYNJ1O43426 1573 aa22.54■■□□□ 1.2
RRN3P2-201ENST00000427965 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.52■■□□□ 1.2
RRN3P2-201ENST00000427965 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.52■■□□□ 1.2
RRN3P2-201ENST00000427965 CUX1P39880 1505 aa22.47■■□□□ 1.19
RRN3P2-201ENST00000427965 ERCC6Q03468 1493 aa22.46■■□□□ 1.19
RRN3P2-201ENST00000427965 TOP2BQ02880 1626 aa22.4■■□□□ 1.18
RRN3P2-201ENST00000427965 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
RRN3P2-201ENST00000427965 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
RRN3P2-201ENST00000427965 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.37■■□□□ 1.17
RRN3P2-201ENST00000427965 TOPBP1Q92547 1522 aa22.34■■□□□ 1.17
RRN3P2-201ENST00000427965 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.33■■□□□ 1.17
RRN3P2-201ENST00000427965 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.31■■□□□ 1.16
RRN3P2-201ENST00000427965 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.29■■□□□ 1.16
RRN3P2-201ENST00000427965 SOGA1O94964 1423 aa22.25■■□□□ 1.15
RRN3P2-201ENST00000427965 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
RRN3P2-201ENST00000427965 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.21■■□□□ 1.15
RRN3P2-201ENST00000427965 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
RRN3P2-201ENST00000427965 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.2■■□□□ 1.14
RRN3P2-201ENST00000427965 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.19■■□□□ 1.14
RRN3P2-201ENST00000427965 WDR62O43379 1518 aa22.17■■□□□ 1.14
RRN3P2-201ENST00000427965 CUX2O14529 1486 aa22.11■■□□□ 1.13
RRN3P2-201ENST00000427965 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.06■■□□□ 1.12
RRN3P2-201ENST00000427965 KIF27Q86VH2 1401 aa22.04■■□□□ 1.12
RRN3P2-201ENST00000427965 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.02■■□□□ 1.12
RRN3P2-201ENST00000427965 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.02■■□□□ 1.12
RRN3P2-201ENST00000427965 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
RRN3P2-201ENST00000427965 EEA1Q15075 1411 aa22.02■■□□□ 1.11
RRN3P2-201ENST00000427965 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
RRN3P2-201ENST00000427965 IFT140Q96RY7 1462 aa21.97■■□□□ 1.11
RRN3P2-201ENST00000427965 WDR97A6NE52 1622 aa21.97■■□□□ 1.11
RRN3P2-201ENST00000427965 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
RRN3P2-201ENST00000427965 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.92■■□□□ 1.1
RRN3P2-201ENST00000427965 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.89■■□□□ 1.09
RRN3P2-201ENST00000427965 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.88■■□□□ 1.09
RRN3P2-201ENST00000427965 IGF1RP08069 1367 aa21.87■■□□□ 1.09
RRN3P2-201ENST00000427965 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
RRN3P2-201ENST00000427965 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.81■■□□□ 1.08
RRN3P2-201ENST00000427965 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
RRN3P2-201ENST00000427965 PBRM1Q86U86 1689 aa21.78■■□□□ 1.08
RRN3P2-201ENST00000427965 KIF21BO75037 1637 aa21.78■■□□□ 1.08
RRN3P2-201ENST00000427965 GOLGA3Q08378 1498 aa21.78■■□□□ 1.08
RRN3P2-201ENST00000427965 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.78■■□□□ 1.08
RRN3P2-201ENST00000427965 PRXQ9BXM0 1461 aa21.77■■□□□ 1.08
RRN3P2-201ENST00000427965 GRIN2BQ13224 1484 aa21.75■■□□□ 1.07
RRN3P2-201ENST00000427965 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.75■■□□□ 1.07
RRN3P2-201ENST00000427965 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.7■■□□□ 1.06
RRN3P2-201ENST00000427965 CUL7Q14999 1698 aa21.7■■□□□ 1.06
RRN3P2-201ENST00000427965 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
RRN3P2-201ENST00000427965 ADAMTS12P58397 1594 aa21.65■■□□□ 1.06
RRN3P2-201ENST00000427965 FBLN2P98095 1184 aa21.63■■□□□ 1.05
RRN3P2-201ENST00000427965 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.63■■□□□ 1.05
RRN3P2-201ENST00000427965 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.62■■□□□ 1.05
RRN3P2-201ENST00000427965 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
RRN3P2-201ENST00000427965 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
RRN3P2-201ENST00000427965 CEP162Q5TB80 1403 aa21.55■■□□□ 1.04
RRN3P2-201ENST00000427965 SYNJ2O15056 1496 aa21.52■■□□□ 1.04
RRN3P2-201ENST00000427965 GRIN2AQ12879 1464 aa21.49■■□□□ 1.03
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