RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.75■■■■■ 7.32
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.97■■■■■ 6.23
HTATSF1-202ENST00000425695 ABCC9O60706 1549 aa53.12■■■■■ 6.09
HTATSF1-202ENST00000425695 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.09■■■■■ 5.77
HTATSF1-202ENST00000425695 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.92■■■■■ 5.74
HTATSF1-202ENST00000425695 NACADO15069 1562 aa50.81■■■■■ 5.72
HTATSF1-202ENST00000425695 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.53■■■■■ 5.68
HTATSF1-202ENST00000425695 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.37■■■■■ 5.65
HTATSF1-202ENST00000425695 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.15■■■■■ 5.62
HTATSF1-202ENST00000425695 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.8■■■■■ 5.56
HTATSF1-202ENST00000425695 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.71■■■■■ 5.55
HTATSF1-202ENST00000425695 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.41■■■■■ 5.5
HTATSF1-202ENST00000425695 SCRIBQ14160 1630 aa49.38■■■■■ 5.5
HTATSF1-202ENST00000425695 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.93■■■■■ 5.42
HTATSF1-202ENST00000425695 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.71■■■■■ 5.39
HTATSF1-202ENST00000425695 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.11■■■■■ 5.29
HTATSF1-202ENST00000425695 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.98■■■■■ 5.27
HTATSF1-202ENST00000425695 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.69■■■■■ 5.22
HTATSF1-202ENST00000425695 SMARCA4P51532 1647 aa47.16■■■■■ 5.14
HTATSF1-202ENST00000425695 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.07■■■■■ 5.12
HTATSF1-202ENST00000425695 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.95■■■■■ 5.11
HTATSF1-202ENST00000425695 NCAPD3P42695 1498 aa46.91■■■■■ 5.1
HTATSF1-202ENST00000425695 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.86■■■■■ 5.09
HTATSF1-202ENST00000425695 SMARCA2P51531 1590 aa46.85■■■■■ 5.09
HTATSF1-202ENST00000425695 HMGXB3Q12766 1538 aa46.62■■■■■ 5.05
HTATSF1-202ENST00000425695 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.61■■■■■ 5.05
HTATSF1-202ENST00000425695 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.57■■■■■ 5.05
HTATSF1-202ENST00000425695 WIZO95785 1651 aa46.37■■■■■ 5.01
HTATSF1-202ENST00000425695 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.28■■■■■ 5
HTATSF1-202ENST00000425695 NESP48681 1621 aa45.93■■■■■ 4.94
HTATSF1-202ENST00000425695 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.79■■■■■ 4.92
HTATSF1-202ENST00000425695 ERCC6Q03468 1493 aa45.77■■■■■ 4.92
HTATSF1-202ENST00000425695 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.67■■■■■ 4.9
HTATSF1-202ENST00000425695 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.58■■■■■ 4.89
HTATSF1-202ENST00000425695 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.43■■■■■ 4.86
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.33■■■■■ 4.85
HTATSF1-202ENST00000425695 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.33■■■■■ 4.85
HTATSF1-202ENST00000425695 CFTRP13569 1480 aa45.25■■■■■ 4.83
HTATSF1-202ENST00000425695 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.22■■■■■ 4.83
HTATSF1-202ENST00000425695 CUX2O14529 1486 aa45.22■■■■■ 4.83
HTATSF1-202ENST00000425695 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.14■■■■■ 4.82
HTATSF1-202ENST00000425695 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.07■■■■■ 4.81
HTATSF1-202ENST00000425695 CEP164Q9UPV0 1460 aa45■■■■■ 4.79
HTATSF1-202ENST00000425695 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.96■■■■■ 4.79
HTATSF1-202ENST00000425695 PRDM2Q13029 1718 aa44.85■■■■■ 4.77
HTATSF1-202ENST00000425695 WDR62O43379 1518 aa44.77■■■■■ 4.76
HTATSF1-202ENST00000425695 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.63■■■■■ 4.73
HTATSF1-202ENST00000425695 TOPBP1Q92547 1522 aa44.33■■■■■ 4.69
HTATSF1-202ENST00000425695 ABCC8Q09428 1581 aa44.26■■■■■ 4.68
HTATSF1-202ENST00000425695 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.22■■■■■ 4.67
HTATSF1-202ENST00000425695 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.09■■■■■ 4.65
HTATSF1-202ENST00000425695 IFT140Q96RY7 1462 aa44.04■■■■■ 4.64
HTATSF1-202ENST00000425695 CUX1P39880 1505 aa43.96■■■■■ 4.63
HTATSF1-202ENST00000425695 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.94■■■■■ 4.62
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.94■■■■■ 4.62
HTATSF1-202ENST00000425695 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.83■■■■■ 4.61
HTATSF1-202ENST00000425695 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.83■■■■■ 4.61
HTATSF1-202ENST00000425695 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.82■■■■■ 4.61
HTATSF1-202ENST00000425695 SOGA1O94964 1423 aa43.81■■■■■ 4.6
HTATSF1-202ENST00000425695 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.7■■■■■ 4.592e-8■■■■■ 35.8
HTATSF1-202ENST00000425695 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.68■■■■■ 4.58
HTATSF1-202ENST00000425695 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.64■■■■■ 4.58
HTATSF1-202ENST00000425695 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.62■■■■■ 4.57
HTATSF1-202ENST00000425695 SYNJ1O43426 1573 aa43.53■■■■■ 4.56
HTATSF1-202ENST00000425695 TOP2BQ02880 1626 aa43.5■■■■■ 4.55
HTATSF1-202ENST00000425695 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.48■■■■■ 4.55
HTATSF1-202ENST00000425695 OSCARQ8IYS5 282 aa43.47■■■■■ 4.55
HTATSF1-202ENST00000425695 WDR97A6NE52 1622 aa43.39■■■■■ 4.54
HTATSF1-202ENST00000425695 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.35■■■■■ 4.53
HTATSF1-202ENST00000425695 FBLN2P98095 1184 aa43.3■■■■■ 4.52
HTATSF1-202ENST00000425695 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.27■■■■■ 4.52
HTATSF1-202ENST00000425695 GRIN2BQ13224 1484 aa43.25■■■■■ 4.51
HTATSF1-202ENST00000425695 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.24■■■■■ 4.51
HTATSF1-202ENST00000425695 CHD1O14646 1710 aa43.19■■■■■ 4.51
HTATSF1-202ENST00000425695 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.17■■■■■ 4.5
HTATSF1-202ENST00000425695 PBRM1Q86U86 1689 aa43.15■■■■■ 4.5
HTATSF1-202ENST00000425695 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.11■■■■■ 4.49
HTATSF1-202ENST00000425695 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.09■■■■■ 4.49
HTATSF1-202ENST00000425695 SYNJ2O15056 1496 aa42.97■■■■■ 4.47
HTATSF1-202ENST00000425695 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.81■■■■■ 4.44
HTATSF1-202ENST00000425695 ADAMTS12P58397 1594 aa42.78■■■■■ 4.44
HTATSF1-202ENST00000425695 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.74■■■■■ 4.43
HTATSF1-202ENST00000425695 TRIM41Q8WV44 630 aa42.74■■■■■ 4.43
HTATSF1-202ENST00000425695 KIF27Q86VH2 1401 aa42.73■■■■■ 4.43
HTATSF1-202ENST00000425695 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.71■■■■■ 4.43
HTATSF1-202ENST00000425695 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.71■■■■■ 4.43
HTATSF1-202ENST00000425695 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.71■■■■■ 4.43
HTATSF1-202ENST00000425695 GRIN2AQ12879 1464 aa42.7■■■■■ 4.43
HTATSF1-202ENST00000425695 ARHGEF11O15085 1522 aa42.68■■■■■ 4.42
HTATSF1-202ENST00000425695 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.66■■■■■ 4.42
HTATSF1-202ENST00000425695 IGF1RP08069 1367 aa42.61■■■■■ 4.41
HTATSF1-202ENST00000425695 CEP170Q5SW79 1584 aa42.49■■■■■ 4.39
HTATSF1-202ENST00000425695 NUP160Q12769 1436 aa42.49■■■■■ 4.39
HTATSF1-202ENST00000425695 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.45■■■■■ 4.39
HTATSF1-202ENST00000425695 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.41■■■■■ 4.38
HTATSF1-202ENST00000425695 CUL7Q14999 1698 aa42.39■■■■■ 4.38
HTATSF1-202ENST00000425695 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.36■■■■■ 4.37
HTATSF1-202ENST00000425695 ARAP1Q96P48 1450 aa42.34■■■■■ 4.37
HTATSF1-202ENST00000425695 JPH4Q96JJ6 628 aa42.17■■■■■ 4.34
HTATSF1-202ENST00000425695 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.17■■■■■ 4.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms