RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424927.5

C10orf90-204, Transcript of chromosome 10 open reading frame 90, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene C10orf90, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf90-204ENST00000424927 NISCHQ9Y2I1 1504 aa23.84■■□□□ 1.41
C10orf90-204ENST00000424927 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
C10orf90-204ENST00000424927 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.6■■□□□ 1.05
C10orf90-204ENST00000424927 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa21.1■□□□□ 0.97
C10orf90-204ENST00000424927 ABCC9O60706 1549 aa20.58■□□□□ 0.88
C10orf90-204ENST00000424927 DCAF8L2P0C7V8 631 aa20.01■□□□□ 0.79
C10orf90-204ENST00000424927 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
C10orf90-204ENST00000424927 POTEDQ86YR6 584 aa19.94■□□□□ 0.78
C10orf90-204ENST00000424927 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
C10orf90-204ENST00000424927 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa19.8■□□□□ 0.76
C10orf90-204ENST00000424927 NACADO15069 1562 aa19.78■□□□□ 0.76
C10orf90-204ENST00000424927 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa19.65■□□□□ 0.74
C10orf90-204ENST00000424927 MYO15BQ96JP2 1530 aa19.65■□□□□ 0.74
C10orf90-204ENST00000424927 UNC13AQ9UPW8 1703 aa19.4■□□□□ 0.7
C10orf90-204ENST00000424927 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
C10orf90-204ENST00000424927 SCRIBQ14160 1630 aa19.38■□□□□ 0.69
C10orf90-204ENST00000424927 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP19.28■□□□□ 0.68
C10orf90-204ENST00000424927 BICRAQ9NZM4 1560 aa19.19■□□□□ 0.66
C10orf90-204ENST00000424927 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa19.1■□□□□ 0.65
C10orf90-204ENST00000424927 DNAJC5BQ9UF47 199 aa18.69■□□□□ 0.58
C10orf90-204ENST00000424927 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
C10orf90-204ENST00000424927 FOXD1Q16676 465 aa18.6■□□□□ 0.57
C10orf90-204ENST00000424927 CECR2Q9BXF3 1484 aa18.6■□□□□ 0.57
C10orf90-204ENST00000424927 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa18.59■□□□□ 0.57
C10orf90-204ENST00000424927 SMARCA4P51532 1647 aa18.48■□□□□ 0.55
C10orf90-204ENST00000424927 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
C10orf90-204ENST00000424927 MROH2BQ7Z745 1585 aa18.41■□□□□ 0.54
C10orf90-204ENST00000424927 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa18.32■□□□□ 0.52
C10orf90-204ENST00000424927 SMARCA2P51531 1590 aa18.3■□□□□ 0.52
C10orf90-204ENST00000424927 WIZO95785 1651 aa18.26■□□□□ 0.51
C10orf90-204ENST00000424927 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
C10orf90-204ENST00000424927 NCAPD3P42695 1498 aa18.24■□□□□ 0.51
C10orf90-204ENST00000424927 PEG3Q9GZU2 1588 aa18.22■□□□□ 0.51
C10orf90-204ENST00000424927 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
C10orf90-204ENST00000424927 HMGXB3Q12766 1538 aa18.18■□□□□ 0.5
C10orf90-204ENST00000424927 MSH5O43196 834 aa18.16■□□□□ 0.5
C10orf90-204ENST00000424927 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
C10orf90-204ENST00000424927 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.47
C10orf90-204ENST00000424927 NESP48681 1621 aa17.85■□□□□ 0.45
C10orf90-204ENST00000424927 CCDC88BA6NC98 1476 aa17.82■□□□□ 0.44
C10orf90-204ENST00000424927 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa17.76■□□□□ 0.43
C10orf90-204ENST00000424927 CADPSQ9ULU8 1353 aa17.75■□□□□ 0.43
C10orf90-204ENST00000424927 ERCC6Q03468 1493 aa17.72■□□□□ 0.43
C10orf90-204ENST00000424927 CFTRP13569 1480 aa17.67■□□□□ 0.42
C10orf90-204ENST00000424927 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa17.65■□□□□ 0.42
C10orf90-204ENST00000424927 PDS5BQ9NTI5 1447 aa17.64■□□□□ 0.42
C10orf90-204ENST00000424927 PRDM2Q13029 1718 aa17.59■□□□□ 0.41
C10orf90-204ENST00000424927 FANCD2Q9BXW9 1451 aa17.58■□□□□ 0.41
C10orf90-204ENST00000424927 CEP164Q9UPV0 1460 aa17.55■□□□□ 0.4
C10orf90-204ENST00000424927 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
C10orf90-204ENST00000424927 MRC2Q9UBG0 1479 aa17.47■□□□□ 0.39
C10orf90-204ENST00000424927 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.38
C10orf90-204ENST00000424927 WDR62O43379 1518 aa17.39■□□□□ 0.37
C10orf90-204ENST00000424927 CUX2O14529 1486 aa17.38■□□□□ 0.37
C10orf90-204ENST00000424927 TOPBP1Q92547 1522 aa17.31■□□□□ 0.36
C10orf90-204ENST00000424927 DNMBPQ6XZF7 1577 aa17.3■□□□□ 0.36
C10orf90-204ENST00000424927 ABCC8Q09428 1581 aa17.28■□□□□ 0.36
C10orf90-204ENST00000424927 CUX1P39880 1505 aa17.27■□□□□ 0.35
C10orf90-204ENST00000424927 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP17.21■□□□□ 0.35
C10orf90-204ENST00000424927 SYNJ1O43426 1573 aa17.19■□□□□ 0.34
C10orf90-204ENST00000424927 FGD5Q6ZNL6 1462 aa17.19■□□□□ 0.34
C10orf90-204ENST00000424927 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
C10orf90-204ENST00000424927 IFT140Q96RY7 1462 aa17.14■□□□□ 0.34
C10orf90-204ENST00000424927 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa17.14■□□□□ 0.34
C10orf90-204ENST00000424927 TOP2BQ02880 1626 aa17.14■□□□□ 0.33
C10orf90-204ENST00000424927 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa17.14■□□□□ 0.33
C10orf90-204ENST00000424927 SOGA1O94964 1423 aa17.12■□□□□ 0.33
C10orf90-204ENST00000424927 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
C10orf90-204ENST00000424927 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
C10orf90-204ENST00000424927 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
C10orf90-204ENST00000424927 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
C10orf90-204ENST00000424927 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP17.03■□□□□ 0.32
C10orf90-204ENST00000424927 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
C10orf90-204ENST00000424927 WDR97A6NE52 1622 aa17.01■□□□□ 0.31
C10orf90-204ENST00000424927 TRIM41Q8WV44 630 aa16.99■□□□□ 0.31
C10orf90-204ENST00000424927 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa16.97■□□□□ 0.31
C10orf90-204ENST00000424927 GAPVD1Q14C86 1478 aa16.93■□□□□ 0.3
C10orf90-204ENST00000424927 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa16.91■□□□□ 0.3
C10orf90-204ENST00000424927 PBRM1Q86U86 1689 aa16.91■□□□□ 0.3
C10orf90-204ENST00000424927 GRIN2BQ13224 1484 aa16.89■□□□□ 0.29
C10orf90-204ENST00000424927 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.87■□□□□ 0.29
C10orf90-204ENST00000424927 FBLN2P98095 1184 aa16.86■□□□□ 0.29
C10orf90-204ENST00000424927 KIF27Q86VH2 1401 aa16.83■□□□□ 0.29
C10orf90-204ENST00000424927 CHD1O14646 1710 aa16.81■□□□□ 0.28
C10orf90-204ENST00000424927 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
C10orf90-204ENST00000424927 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa16.79■□□□□ 0.28
C10orf90-204ENST00000424927 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
C10orf90-204ENST00000424927 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16.78■□□□□ 0.28
C10orf90-204ENST00000424927 ADAMTS12P58397 1594 aa16.75■□□□□ 0.27
C10orf90-204ENST00000424927 SYNJ2O15056 1496 aa16.75■□□□□ 0.27
C10orf90-204ENST00000424927 OSCARQ8IYS5 282 aa16.74■□□□□ 0.27
C10orf90-204ENST00000424927 IGF1RP08069 1367 aa16.73■□□□□ 0.27
C10orf90-204ENST00000424927 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.72■□□□□ 0.27
C10orf90-204ENST00000424927 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
C10orf90-204ENST00000424927 CUL7Q14999 1698 aa16.69■□□□□ 0.26
C10orf90-204ENST00000424927 GRIN2AQ12879 1464 aa16.67■□□□□ 0.26
C10orf90-204ENST00000424927 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa16.66■□□□□ 0.26
C10orf90-204ENST00000424927 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa16.65■□□□□ 0.26
C10orf90-204ENST00000424927 CEP170Q5SW79 1584 aa16.6■□□□□ 0.25
C10orf90-204ENST00000424927 CSRNP3Q8WYN3 585 aa16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms