RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424192.6

LMO3-206, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LMO3, Length 983 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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