RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421056.2

LILRA4-202, Transcript of leukocyte immunoglobulin like receptor A4, humanhuman

TSL 3

Gene LILRA4, Length 549 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LILRA4-202ENST00000421056 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.96■■■□□ 2.39
LILRA4-202ENST00000421056 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.54■■□□□ 1.84
LILRA4-202ENST00000421056 ABCC9O60706 1549 aa26.29■■□□□ 1.8
LILRA4-202ENST00000421056 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.38■■□□□ 1.65
LILRA4-202ENST00000421056 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.1■■□□□ 1.61
LILRA4-202ENST00000421056 NACADO15069 1562 aa25.02■■□□□ 1.6
LILRA4-202ENST00000421056 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
LILRA4-202ENST00000421056 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.75■■□□□ 1.55
LILRA4-202ENST00000421056 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.66■■□□□ 1.54
LILRA4-202ENST00000421056 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.65■■□□□ 1.54
LILRA4-202ENST00000421056 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.5■■□□□ 1.51
LILRA4-202ENST00000421056 SCRIBQ14160 1630 aa24.42■■□□□ 1.5
LILRA4-202ENST00000421056 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.36■■□□□ 1.49
LILRA4-202ENST00000421056 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.23■■□□□ 1.47
LILRA4-202ENST00000421056 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.93■■□□□ 1.42
LILRA4-202ENST00000421056 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
LILRA4-202ENST00000421056 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.68■■□□□ 1.38
LILRA4-202ENST00000421056 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.57■■□□□ 1.36
LILRA4-202ENST00000421056 SMARCA4P51532 1647 aa23.25■■□□□ 1.31
LILRA4-202ENST00000421056 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
LILRA4-202ENST00000421056 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.17■■□□□ 1.3
LILRA4-202ENST00000421056 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.15■■□□□ 1.3
LILRA4-202ENST00000421056 NCAPD3P42695 1498 aa23.12■■□□□ 1.29
LILRA4-202ENST00000421056 SMARCA2P51531 1590 aa23.09■■□□□ 1.29
LILRA4-202ENST00000421056 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
LILRA4-202ENST00000421056 HMGXB3Q12766 1538 aa22.96■■□□□ 1.27
LILRA4-202ENST00000421056 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.93■■□□□ 1.26
LILRA4-202ENST00000421056 WIZO95785 1651 aa22.9■■□□□ 1.26
LILRA4-202ENST00000421056 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
LILRA4-202ENST00000421056 NESP48681 1621 aa22.72■■□□□ 1.23
LILRA4-202ENST00000421056 ERCC6Q03468 1493 aa22.65■■□□□ 1.22
LILRA4-202ENST00000421056 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
LILRA4-202ENST00000421056 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.5■■□□□ 1.19
LILRA4-202ENST00000421056 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.5■■□□□ 1.19
LILRA4-202ENST00000421056 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
LILRA4-202ENST00000421056 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.42■■□□□ 1.18
LILRA4-202ENST00000421056 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.39■■□□□ 1.17
LILRA4-202ENST00000421056 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.35■■□□□ 1.17
LILRA4-202ENST00000421056 CFTRP13569 1480 aa22.31■■□□□ 1.16
LILRA4-202ENST00000421056 CUX2O14529 1486 aa22.29■■□□□ 1.16
LILRA4-202ENST00000421056 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.26■■□□□ 1.15
LILRA4-202ENST00000421056 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
LILRA4-202ENST00000421056 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.22■■□□□ 1.15
LILRA4-202ENST00000421056 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.19■■□□□ 1.14
LILRA4-202ENST00000421056 WDR62O43379 1518 aa22.07■■□□□ 1.12
LILRA4-202ENST00000421056 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
LILRA4-202ENST00000421056 PRDM2Q13029 1718 aa22.03■■□□□ 1.12
LILRA4-202ENST00000421056 TOPBP1Q92547 1522 aa21.88■■□□□ 1.09
LILRA4-202ENST00000421056 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.81■■□□□ 1.08
LILRA4-202ENST00000421056 ABCC8Q09428 1581 aa21.79■■□□□ 1.08
LILRA4-202ENST00000421056 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.79■■□□□ 1.08
LILRA4-202ENST00000421056 IFT140Q96RY7 1462 aa21.73■■□□□ 1.07
LILRA4-202ENST00000421056 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
LILRA4-202ENST00000421056 CUX1P39880 1505 aa21.7■■□□□ 1.07
LILRA4-202ENST00000421056 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
LILRA4-202ENST00000421056 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.69■■□□□ 1.06
LILRA4-202ENST00000421056 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.66■■□□□ 1.06
LILRA4-202ENST00000421056 SOGA1O94964 1423 aa21.65■■□□□ 1.06
LILRA4-202ENST00000421056 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.62■■□□□ 1.05
LILRA4-202ENST00000421056 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
LILRA4-202ENST00000421056 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
LILRA4-202ENST00000421056 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.04
LILRA4-202ENST00000421056 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
LILRA4-202ENST00000421056 SYNJ1O43426 1573 aa21.5■■□□□ 1.03
LILRA4-202ENST00000421056 FBLN2P98095 1184 aa21.49■■□□□ 1.03
LILRA4-202ENST00000421056 OSCARQ8IYS5 282 aa21.49■■□□□ 1.03
LILRA4-202ENST00000421056 TOP2BQ02880 1626 aa21.44■■□□□ 1.02
LILRA4-202ENST00000421056 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.41■■□□□ 1.02
LILRA4-202ENST00000421056 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.38■■□□□ 1.01
LILRA4-202ENST00000421056 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.38■■□□□ 1.01
LILRA4-202ENST00000421056 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.37■■□□□ 1.01
LILRA4-202ENST00000421056 WDR97A6NE52 1622 aa21.36■■□□□ 1.01
LILRA4-202ENST00000421056 GRIN2BQ13224 1484 aa21.35■■□□□ 1.01
LILRA4-202ENST00000421056 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
LILRA4-202ENST00000421056 CHD1O14646 1710 aa21.3■■□□□ 1
LILRA4-202ENST00000421056 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.27■■□□□ 1
LILRA4-202ENST00000421056 PBRM1Q86U86 1689 aa21.27■■□□□ 1
LILRA4-202ENST00000421056 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
LILRA4-202ENST00000421056 TRIM41Q8WV44 630 aa21.24■□□□□ 0.99
LILRA4-202ENST00000421056 SYNJ2O15056 1496 aa21.2■□□□□ 0.98
LILRA4-202ENST00000421056 ADAMTS12P58397 1594 aa21.11■□□□□ 0.97
LILRA4-202ENST00000421056 KIF27Q86VH2 1401 aa21.11■□□□□ 0.97
LILRA4-202ENST00000421056 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.1■□□□□ 0.97
LILRA4-202ENST00000421056 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.09■□□□□ 0.97
LILRA4-202ENST00000421056 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.08■□□□□ 0.97
LILRA4-202ENST00000421056 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.08■□□□□ 0.97
LILRA4-202ENST00000421056 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.08■□□□□ 0.97
LILRA4-202ENST00000421056 ARHGEF11O15085 1522 aa21.08■□□□□ 0.96
LILRA4-202ENST00000421056 GRIN2AQ12879 1464 aa21.07■□□□□ 0.96
LILRA4-202ENST00000421056 IGF1RP08069 1367 aa21.05■□□□□ 0.96
LILRA4-202ENST00000421056 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.04■□□□□ 0.96
LILRA4-202ENST00000421056 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.04■□□□□ 0.96
LILRA4-202ENST00000421056 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.99■□□□□ 0.95
LILRA4-202ENST00000421056 CEP170Q5SW79 1584 aa20.98■□□□□ 0.95
LILRA4-202ENST00000421056 NUP160Q12769 1436 aa20.95■□□□□ 0.95
LILRA4-202ENST00000421056 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.94■□□□□ 0.94
LILRA4-202ENST00000421056 ARAP1Q96P48 1450 aa20.93■□□□□ 0.94
LILRA4-202ENST00000421056 CUL7Q14999 1698 aa20.88■□□□□ 0.93
LILRA4-202ENST00000421056 JPH4Q96JJ6 628 aa20.86■□□□□ 0.93
LILRA4-202ENST00000421056 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms