RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418161.1

CCDC13-AS1-201, CCDC13 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCDC13-AS1, Length 2,049 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 NISCHQ9Y2I1 1504 aa23.02■■□□□ 1.28
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CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
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CCDC13-AS1-201ENST00000418161 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa19■□□□□ 0.63
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa18.97■□□□□ 0.63
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 MYO15BQ96JP2 1530 aa18.95■□□□□ 0.62
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 SCRIBQ14160 1630 aa18.64■□□□□ 0.57
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 UNC13AQ9UPW8 1703 aa18.58■□□□□ 0.56
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CCDC13-AS1-201ENST00000418161 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP18.45■□□□□ 0.54
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CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CECR2Q9BXF3 1484 aa17.95■□□□□ 0.46
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CCDC13-AS1-201ENST00000418161 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
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CCDC13-AS1-201ENST00000418161 MROH2BQ7Z745 1585 aa17.78■□□□□ 0.44
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CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa17.76■□□□□ 0.43
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
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CCDC13-AS1-201ENST00000418161 WIZO95785 1651 aa17.62■□□□□ 0.41
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 SMARCA2P51531 1590 aa17.61■□□□□ 0.41
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 PEG3Q9GZU2 1588 aa17.58■□□□□ 0.4
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CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CCDC88BA6NC98 1476 aa17.23■□□□□ 0.35
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 NESP48681 1621 aa17.11■□□□□ 0.33
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CADPSQ9ULU8 1353 aa17.07■□□□□ 0.32
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa17.03■□□□□ 0.32
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CFTRP13569 1480 aa17.03■□□□□ 0.32
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 PDS5BQ9NTI5 1447 aa16.92■□□□□ 0.3
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ERCC6Q03468 1493 aa16.92■□□□□ 0.3
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 PRDM2Q13029 1718 aa16.91■□□□□ 0.3
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 FANCD2Q9BXW9 1451 aa16.9■□□□□ 0.3
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa16.89■□□□□ 0.3
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CEP164Q9UPV0 1460 aa16.84■□□□□ 0.29
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ABCC8Q09428 1581 aa16.74■□□□□ 0.27
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 MRC2Q9UBG0 1479 aa16.74■□□□□ 0.27
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP16.67■□□□□ 0.26
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 WDR62O43379 1518 aa16.66■□□□□ 0.26
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CUX1P39880 1505 aa16.66■□□□□ 0.26
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 TOPBP1Q92547 1522 aa16.66■□□□□ 0.26
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CCDC13-AS1-201ENST00000418161 SYNJ1O43426 1573 aa16.62■□□□□ 0.25
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 TOP2BQ02880 1626 aa16.57■□□□□ 0.24
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CCDC13-AS1-201ENST00000418161 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa16.55■□□□□ 0.24
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CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CUX2O14529 1486 aa16.54■□□□□ 0.24
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 TRIM41Q8WV44 630 aa16.53■□□□□ 0.24
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CHIC1Q5VXU3 224 aa16.52■□□□□ 0.24
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa16.5■□□□□ 0.23
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 SOGA1O94964 1423 aa16.48■□□□□ 0.23
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 IFT140Q96RY7 1462 aa16.45■□□□□ 0.22
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CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
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CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa16.38■□□□□ 0.21
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 WDR97A6NE52 1622 aa16.37■□□□□ 0.21
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP16.36■□□□□ 0.21
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 GAPVD1Q14C86 1478 aa16.3■□□□□ 0.2
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa16.29■□□□□ 0.2
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa16.29■□□□□ 0.2
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 KIF27Q86VH2 1401 aa16.29■□□□□ 0.2
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CCDC13-AS1-201ENST00000418161 GRIN2BQ13224 1484 aa16.24■□□□□ 0.19
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 PBRM1Q86U86 1689 aa16.23■□□□□ 0.19
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.2■□□□□ 0.18
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 IGF1RP08069 1367 aa16.18■□□□□ 0.18
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16.18■□□□□ 0.18
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 FBLN2P98095 1184 aa16.16■□□□□ 0.18
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 EEA1Q15075 1411 aa16.14■□□□□ 0.17
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CSRNP3Q8WYN3 585 aa16.13■□□□□ 0.17
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ADAMTS12P58397 1594 aa16.12■□□□□ 0.17
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa16.1■□□□□ 0.17
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.1■□□□□ 0.17
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CUL7Q14999 1698 aa16.09■□□□□ 0.17
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 SYNJ2O15056 1496 aa16.09■□□□□ 0.17
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 EHMT2Q96KQ7 1210 aa16.08■□□□□ 0.16
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CHD1O14646 1710 aa16.07■□□□□ 0.16
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 GRIN2AQ12879 1464 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 PRXQ9BXM0 1461 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 KIF21BO75037 1637 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 OSCARQ8IYS5 282 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CEP170Q5SW79 1584 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 NUP160Q12769 1436 aa15.93■□□□□ 0.14
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 GOLGA3Q08378 1498 aa15.92■□□□□ 0.14
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