RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414832.2

PTRH1-202, Transcript of peptidyl-tRNA hydrolase 1 homolog, humanhuman

TSL 3

Gene PTRH1, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTRH1-202ENST00000414832 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.78■■■■■ 6.36
PTRH1-202ENST00000414832 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.66■■■■■ 5.38
PTRH1-202ENST00000414832 ABCC9O60706 1549 aa47.12■■■■■ 5.13
PTRH1-202ENST00000414832 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.73■■■■■ 4.91
PTRH1-202ENST00000414832 NACADO15069 1562 aa45.61■■■■■ 4.89
PTRH1-202ENST00000414832 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.57■■■■■ 4.89
PTRH1-202ENST00000414832 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.48■■■■■ 4.87
PTRH1-202ENST00000414832 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.42■■■■■ 4.86
PTRH1-202ENST00000414832 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.41■■■■■ 4.86
PTRH1-202ENST00000414832 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.61■■■■■ 4.73
PTRH1-202ENST00000414832 SCRIBQ14160 1630 aa44.32■■■■■ 4.68
PTRH1-202ENST00000414832 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.18■■■■■ 4.66
PTRH1-202ENST00000414832 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.01■■■■■ 4.64
PTRH1-202ENST00000414832 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.81■■■■■ 4.6
PTRH1-202ENST00000414832 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.98■■■■■ 4.47
PTRH1-202ENST00000414832 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.87■■■■■ 4.45
PTRH1-202ENST00000414832 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.71■■■■■ 4.43
PTRH1-202ENST00000414832 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.59■■■■■ 4.41
PTRH1-202ENST00000414832 SMARCA4P51532 1647 aa42.46■■■■■ 4.39
PTRH1-202ENST00000414832 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.46■■■■■ 4.39
PTRH1-202ENST00000414832 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.2■■■■■ 4.35
PTRH1-202ENST00000414832 SMARCA2P51531 1590 aa42.11■■■■■ 4.33
PTRH1-202ENST00000414832 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.11■■■■■ 4.33
PTRH1-202ENST00000414832 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.08■■■■■ 4.33
PTRH1-202ENST00000414832 NCAPD3P42695 1498 aa42.04■■■■■ 4.32
PTRH1-202ENST00000414832 HMGXB3Q12766 1538 aa41.92■■■■■ 4.3
PTRH1-202ENST00000414832 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.82■■■■■ 4.29
PTRH1-202ENST00000414832 WIZO95785 1651 aa41.78■■■■■ 4.28
PTRH1-202ENST00000414832 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.78■■■■■ 4.28
PTRH1-202ENST00000414832 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.39■■■■■ 4.22
PTRH1-202ENST00000414832 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.92■■■■■ 4.14
PTRH1-202ENST00000414832 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
PTRH1-202ENST00000414832 NESP48681 1621 aa40.89■■■■■ 4.14
PTRH1-202ENST00000414832 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.83■■■■■ 4.13
PTRH1-202ENST00000414832 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.8■■■■■ 4.12
PTRH1-202ENST00000414832 CFTRP13569 1480 aa40.66■■■■■ 4.1
PTRH1-202ENST00000414832 ERCC6Q03468 1493 aa40.6■■■■■ 4.09
PTRH1-202ENST00000414832 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.57■■■■■ 4.08
PTRH1-202ENST00000414832 PRDM2Q13029 1718 aa40.52■■■■■ 4.08
PTRH1-202ENST00000414832 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.5■■■■■ 4.07
PTRH1-202ENST00000414832 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.34■■■■■ 4.05
PTRH1-202ENST00000414832 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.29■■■■■ 4.04
PTRH1-202ENST00000414832 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.28■■■■■ 4.04
PTRH1-202ENST00000414832 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.16■■■■■ 4.02
PTRH1-202ENST00000414832 CUX2O14529 1486 aa40.11■■■■■ 4.01
PTRH1-202ENST00000414832 WDR62O43379 1518 aa40.06■■■■■ 4
PTRH1-202ENST00000414832 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.93■■■■□ 3.98
PTRH1-202ENST00000414832 ABCC8Q09428 1581 aa39.79■■■■□ 3.96
PTRH1-202ENST00000414832 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.78■■■■□ 3.96
PTRH1-202ENST00000414832 TOPBP1Q92547 1522 aa39.75■■■■□ 3.95
PTRH1-202ENST00000414832 CUX1P39880 1505 aa39.58■■■■□ 3.93
PTRH1-202ENST00000414832 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.43■■■■□ 3.9
PTRH1-202ENST00000414832 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.43■■■■□ 3.9
PTRH1-202ENST00000414832 IFT140Q96RY7 1462 aa39.43■■■■□ 3.9
PTRH1-202ENST00000414832 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.4■■■■□ 3.9
PTRH1-202ENST00000414832 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.39■■■■□ 3.9
PTRH1-202ENST00000414832 TOP2BQ02880 1626 aa39.37■■■■□ 3.89
PTRH1-202ENST00000414832 SYNJ1O43426 1573 aa39.36■■■■□ 3.89
PTRH1-202ENST00000414832 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.34■■■■□ 3.89
PTRH1-202ENST00000414832 SOGA1O94964 1423 aa39.23■■■■□ 3.87
PTRH1-202ENST00000414832 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.22■■■■□ 3.87
PTRH1-202ENST00000414832 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.19■■■■□ 3.86
PTRH1-202ENST00000414832 WDR97A6NE52 1622 aa39.14■■■■□ 3.86
PTRH1-202ENST00000414832 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.12■■■■□ 3.85
PTRH1-202ENST00000414832 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.05■■■■□ 3.84
PTRH1-202ENST00000414832 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.98■■■■□ 3.83
PTRH1-202ENST00000414832 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.95■■■■□ 3.83
PTRH1-202ENST00000414832 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.9■■■■□ 3.82
PTRH1-202ENST00000414832 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.82■■■■□ 3.81
PTRH1-202ENST00000414832 PBRM1Q86U86 1689 aa38.81■■■■□ 3.8
PTRH1-202ENST00000414832 GRIN2BQ13224 1484 aa38.78■■■■□ 3.8
PTRH1-202ENST00000414832 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.67■■■■□ 3.78
PTRH1-202ENST00000414832 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.66■■■■□ 3.78
PTRH1-202ENST00000414832 TRIM41Q8WV44 630 aa38.64■■■■□ 3.78
PTRH1-202ENST00000414832 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.6■■■■□ 3.77
PTRH1-202ENST00000414832 KIF27Q86VH2 1401 aa38.58■■■■□ 3.77
PTRH1-202ENST00000414832 CHD1O14646 1710 aa38.58■■■■□ 3.77
PTRH1-202ENST00000414832 ADAMTS12P58397 1594 aa38.5■■■■□ 3.75
PTRH1-202ENST00000414832 SYNJ2O15056 1496 aa38.5■■■■□ 3.75
PTRH1-202ENST00000414832 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.4■■■■□ 3.74
PTRH1-202ENST00000414832 OSCARQ8IYS5 282 aa38.4■■■■□ 3.74
PTRH1-202ENST00000414832 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.39■■■■□ 3.74
PTRH1-202ENST00000414832 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.39■■■■□ 3.74
PTRH1-202ENST00000414832 FBLN2P98095 1184 aa38.37■■■■□ 3.73
PTRH1-202ENST00000414832 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.36■■■■□ 3.73
PTRH1-202ENST00000414832 CUL7Q14999 1698 aa38.36■■■■□ 3.73
PTRH1-202ENST00000414832 IGF1RP08069 1367 aa38.35■■■■□ 3.73
PTRH1-202ENST00000414832 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.3■■■■□ 3.72
PTRH1-202ENST00000414832 GRIN2AQ12879 1464 aa38.29■■■■□ 3.72
PTRH1-202ENST00000414832 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.16■■■■□ 3.7
PTRH1-202ENST00000414832 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.13■■■■□ 3.69
PTRH1-202ENST00000414832 NUP160Q12769 1436 aa38.12■■■■□ 3.69
PTRH1-202ENST00000414832 CEP170Q5SW79 1584 aa38.1■■■■□ 3.69
PTRH1-202ENST00000414832 EEA1Q15075 1411 aa38.1■■■■□ 3.69
PTRH1-202ENST00000414832 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.98■■■■□ 3.67
PTRH1-202ENST00000414832 PRXQ9BXM0 1461 aa37.95■■■■□ 3.67
PTRH1-202ENST00000414832 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.9■■■■□ 3.66
PTRH1-202ENST00000414832 ARHGEF11O15085 1522 aa37.87■■■■□ 3.65
PTRH1-202ENST00000414832 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.85■■■■□ 3.65
PTRH1-202ENST00000414832 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.85■■■■□ 3.65
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