RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412865.1

DUSP18-207, Transcript of dual specificity phosphatase 18, humanhuman

TSL 5

Gene DUSP18, Length 699 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP18-207ENST00000412865 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.69■■■■□ 3.14
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DUSP18-207ENST00000412865 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.16■■■□□ 2.58
DUSP18-207ENST00000412865 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.55■■■□□ 2.48
DUSP18-207ENST00000412865 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.98■■■□□ 2.39
DUSP18-207ENST00000412865 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.75■■■□□ 2.35
DUSP18-207ENST00000412865 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.68■■■□□ 2.34
DUSP18-207ENST00000412865 NACADO15069 1562 aa29.66■■■□□ 2.34
DUSP18-207ENST00000412865 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.28■■■□□ 2.28
DUSP18-207ENST00000412865 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.24■■■□□ 2.27
DUSP18-207ENST00000412865 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.05■■■□□ 2.24
DUSP18-207ENST00000412865 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.77■■■□□ 2.2
DUSP18-207ENST00000412865 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.72■■■□□ 2.19
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DUSP18-207ENST00000412865 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.6■■■□□ 2.17
DUSP18-207ENST00000412865 SCRIBQ14160 1630 aa28.55■■■□□ 2.16
DUSP18-207ENST00000412865 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
DUSP18-207ENST00000412865 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.52■■■□□ 2.16
DUSP18-207ENST00000412865 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.28■■■□□ 2.12
DUSP18-207ENST00000412865 CUX2O14529 1486 aa27.57■■■□□ 2
DUSP18-207ENST00000412865 ERCC6Q03468 1493 aa27.52■■■□□ 2
DUSP18-207ENST00000412865 NCAPD3P42695 1498 aa27.47■■□□□ 1.99
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DUSP18-207ENST00000412865 NESP48681 1621 aa27.31■■□□□ 1.96
DUSP18-207ENST00000412865 HMGXB3Q12766 1538 aa27.14■■□□□ 1.94
DUSP18-207ENST00000412865 SMARCA2P51531 1590 aa27.13■■□□□ 1.93
DUSP18-207ENST00000412865 SMARCA4P51532 1647 aa27.12■■□□□ 1.93
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DUSP18-207ENST00000412865 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.83■■□□□ 1.89
DUSP18-207ENST00000412865 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.79■■□□□ 1.88
DUSP18-207ENST00000412865 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.78■■□□□ 1.88
DUSP18-207ENST00000412865 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.77■■□□□ 1.88
DUSP18-207ENST00000412865 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.65■■□□□ 1.86
DUSP18-207ENST00000412865 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.58■■□□□ 1.85
DUSP18-207ENST00000412865 WDR62O43379 1518 aa26.51■■□□□ 1.83
DUSP18-207ENST00000412865 WIZO95785 1651 aa26.4■■□□□ 1.82
DUSP18-207ENST00000412865 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.36■■□□□ 1.81
DUSP18-207ENST00000412865 OSCARQ8IYS5 282 aa26.34■■□□□ 1.81
DUSP18-207ENST00000412865 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.34■■□□□ 1.81
DUSP18-207ENST00000412865 CFTRP13569 1480 aa26.22■■□□□ 1.79
DUSP18-207ENST00000412865 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
DUSP18-207ENST00000412865 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
DUSP18-207ENST00000412865 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.99■■□□□ 1.75
DUSP18-207ENST00000412865 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.99■■□□□ 1.75
DUSP18-207ENST00000412865 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.99■■□□□ 1.75
DUSP18-207ENST00000412865 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
DUSP18-207ENST00000412865 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
DUSP18-207ENST00000412865 ARHGEF11O15085 1522 aa25.89■■□□□ 1.74
DUSP18-207ENST00000412865 IFT140Q96RY7 1462 aa25.85■■□□□ 1.73
DUSP18-207ENST00000412865 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.84■■□□□ 1.73
DUSP18-207ENST00000412865 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.79■■□□□ 1.72
DUSP18-207ENST00000412865 TOPBP1Q92547 1522 aa25.78■■□□□ 1.72
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DUSP18-207ENST00000412865 ABCC8Q09428 1581 aa25.56■■□□□ 1.68
DUSP18-207ENST00000412865 CHD1O14646 1710 aa25.55■■□□□ 1.68
DUSP18-207ENST00000412865 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
DUSP18-207ENST00000412865 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
DUSP18-207ENST00000412865 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.49■■□□□ 1.67
DUSP18-207ENST00000412865 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
DUSP18-207ENST00000412865 SOGA1O94964 1423 aa25.38■■□□□ 1.65
DUSP18-207ENST00000412865 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.35■■□□□ 1.65
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DUSP18-207ENST00000412865 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.31■■□□□ 1.64
DUSP18-207ENST00000412865 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.27■■□□□ 1.64
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DUSP18-207ENST00000412865 GRIN2BQ13224 1484 aa25.16■■□□□ 1.62
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DUSP18-207ENST00000412865 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.99■■□□□ 1.59
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DUSP18-207ENST00000412865 CEP170Q5SW79 1584 aa24.81■■□□□ 1.56
DUSP18-207ENST00000412865 NUP160Q12769 1436 aa24.8■■□□□ 1.56
DUSP18-207ENST00000412865 ADAMTS12P58397 1594 aa24.74■■□□□ 1.55
DUSP18-207ENST00000412865 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.55
DUSP18-207ENST00000412865 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.69■■□□□ 1.54
DUSP18-207ENST00000412865 SHROOM2Q13796 1616 aa24.68■■□□□ 1.54
DUSP18-207ENST00000412865 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
DUSP18-207ENST00000412865 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
DUSP18-207ENST00000412865 JPH4Q96JJ6 628 aa24.61■■□□□ 1.53
DUSP18-207ENST00000412865 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.61■■□□□ 1.53
DUSP18-207ENST00000412865 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.6■■□□□ 1.53
DUSP18-207ENST00000412865 TOP2BQ02880 1626 aa24.55■■□□□ 1.52
DUSP18-207ENST00000412865 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.54■■□□□ 1.52
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