RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399492.6

CD27-AS1-201, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CD27-AS1, Length 1,094 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-201ENST00000399492 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.29■■■□□ 2.44
CD27-AS1-201ENST00000399492 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.85■■□□□ 1.89
CD27-AS1-201ENST00000399492 ABCC9O60706 1549 aa26.34■■□□□ 1.81
CD27-AS1-201ENST00000399492 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.46■■□□□ 1.67
CD27-AS1-201ENST00000399492 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.32■■□□□ 1.64
CD27-AS1-201ENST00000399492 NACADO15069 1562 aa25.31■■□□□ 1.64
CD27-AS1-201ENST00000399492 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CD27-AS1-201ENST00000399492 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.14■■□□□ 1.62
CD27-AS1-201ENST00000399492 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.04■■□□□ 1.6
CD27-AS1-201ENST00000399492 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.69■■□□□ 1.54
CD27-AS1-201ENST00000399492 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.69■■□□□ 1.54
CD27-AS1-201ENST00000399492 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.54■■□□□ 1.52
CD27-AS1-201ENST00000399492 SCRIBQ14160 1630 aa24.53■■□□□ 1.52
CD27-AS1-201ENST00000399492 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.26■■□□□ 1.47
CD27-AS1-201ENST00000399492 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.24■■□□□ 1.47
CD27-AS1-201ENST00000399492 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
CD27-AS1-201ENST00000399492 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.79■■□□□ 1.4
CD27-AS1-201ENST00000399492 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.66■■□□□ 1.38
CD27-AS1-201ENST00000399492 SMARCA4P51532 1647 aa23.46■■□□□ 1.35
CD27-AS1-201ENST00000399492 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CD27-AS1-201ENST00000399492 NCAPD3P42695 1498 aa23.38■■□□□ 1.33
CD27-AS1-201ENST00000399492 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.37■■□□□ 1.33
CD27-AS1-201ENST00000399492 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.35■■□□□ 1.33
CD27-AS1-201ENST00000399492 SMARCA2P51531 1590 aa23.33■■□□□ 1.33
CD27-AS1-201ENST00000399492 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.23■■□□□ 1.31
CD27-AS1-201ENST00000399492 HMGXB3Q12766 1538 aa23.19■■□□□ 1.3
CD27-AS1-201ENST00000399492 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
CD27-AS1-201ENST00000399492 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
CD27-AS1-201ENST00000399492 WIZO95785 1651 aa23.08■■□□□ 1.29
CD27-AS1-201ENST00000399492 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CD27-AS1-201ENST00000399492 NESP48681 1621 aa22.79■■□□□ 1.24
CD27-AS1-201ENST00000399492 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.72■■□□□ 1.23
CD27-AS1-201ENST00000399492 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.72■■□□□ 1.23
CD27-AS1-201ENST00000399492 ERCC6Q03468 1493 aa22.7■■□□□ 1.22
CD27-AS1-201ENST00000399492 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
CD27-AS1-201ENST00000399492 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.62■■□□□ 1.21
CD27-AS1-201ENST00000399492 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.61■■□□□ 1.21
CD27-AS1-201ENST00000399492 CFTRP13569 1480 aa22.55■■□□□ 1.2
CD27-AS1-201ENST00000399492 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.46■■□□□ 1.19
CD27-AS1-201ENST00000399492 CUX2O14529 1486 aa22.43■■□□□ 1.18
CD27-AS1-201ENST00000399492 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.42■■□□□ 1.18
CD27-AS1-201ENST00000399492 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.38■■□□□ 1.17
CD27-AS1-201ENST00000399492 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CD27-AS1-201ENST00000399492 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.34■■□□□ 1.17
CD27-AS1-201ENST00000399492 PRDM2Q13029 1718 aa22.29■■□□□ 1.16
CD27-AS1-201ENST00000399492 WDR62O43379 1518 aa22.23■■□□□ 1.15
CD27-AS1-201ENST00000399492 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CD27-AS1-201ENST00000399492 ABCC8Q09428 1581 aa22.1■■□□□ 1.13
CD27-AS1-201ENST00000399492 TOPBP1Q92547 1522 aa22.06■■□□□ 1.12
CD27-AS1-201ENST00000399492 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22■■□□□ 1.11
CD27-AS1-201ENST00000399492 IFT140Q96RY7 1462 aa21.92■■□□□ 1.1
CD27-AS1-201ENST00000399492 CUX1P39880 1505 aa21.89■■□□□ 1.09
CD27-AS1-201ENST00000399492 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CD27-AS1-201ENST00000399492 SOGA1O94964 1423 aa21.84■■□□□ 1.09
CD27-AS1-201ENST00000399492 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.83■■□□□ 1.09
CD27-AS1-201ENST00000399492 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.82■■□□□ 1.08
CD27-AS1-201ENST00000399492 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
CD27-AS1-201ENST00000399492 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.8■■□□□ 1.08
CD27-AS1-201ENST00000399492 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CD27-AS1-201ENST00000399492 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.08
CD27-AS1-201ENST00000399492 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
CD27-AS1-201ENST00000399492 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
CD27-AS1-201ENST00000399492 TOP2BQ02880 1626 aa21.69■■□□□ 1.06
CD27-AS1-201ENST00000399492 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.67■■□□□ 1.06
CD27-AS1-201ENST00000399492 SYNJ1O43426 1573 aa21.67■■□□□ 1.06
CD27-AS1-201ENST00000399492 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
CD27-AS1-201ENST00000399492 OSCARQ8IYS5 282 aa21.63■■□□□ 1.05
CD27-AS1-201ENST00000399492 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.6■■□□□ 1.05
CD27-AS1-201ENST00000399492 WDR97A6NE52 1622 aa21.6■■□□□ 1.05
CD27-AS1-201ENST00000399492 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.56■■□□□ 1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 GRIN2BQ13224 1484 aa21.54■■□□□ 1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 FBLN2P98095 1184 aa21.54■■□□□ 1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.48■■□□□ 1.03
CD27-AS1-201ENST00000399492 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CD27-AS1-201ENST00000399492 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.47■■□□□ 1.03
CD27-AS1-201ENST00000399492 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CD27-AS1-201ENST00000399492 PBRM1Q86U86 1689 aa21.43■■□□□ 1.02
CD27-AS1-201ENST00000399492 CHD1O14646 1710 aa21.41■■□□□ 1.02
CD27-AS1-201ENST00000399492 SYNJ2O15056 1496 aa21.39■■□□□ 1.01
CD27-AS1-201ENST00000399492 TRIM41Q8WV44 630 aa21.38■■□□□ 1.01
CD27-AS1-201ENST00000399492 KIF27Q86VH2 1401 aa21.35■■□□□ 1.01
CD27-AS1-201ENST00000399492 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.34■■□□□ 1.01
CD27-AS1-201ENST00000399492 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.31■■□□□ 1
CD27-AS1-201ENST00000399492 IGF1RP08069 1367 aa21.29■■□□□ 1
CD27-AS1-201ENST00000399492 ADAMTS12P58397 1594 aa21.26■□□□□ 0.99
CD27-AS1-201ENST00000399492 GRIN2AQ12879 1464 aa21.25■□□□□ 0.99
CD27-AS1-201ENST00000399492 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.18■□□□□ 0.98
CD27-AS1-201ENST00000399492 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.17■□□□□ 0.98
CD27-AS1-201ENST00000399492 ARHGEF11O15085 1522 aa21.15■□□□□ 0.98
CD27-AS1-201ENST00000399492 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.15■□□□□ 0.98
CD27-AS1-201ENST00000399492 NUP160Q12769 1436 aa21.15■□□□□ 0.98
CD27-AS1-201ENST00000399492 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.15■□□□□ 0.98
CD27-AS1-201ENST00000399492 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.15■□□□□ 0.98
CD27-AS1-201ENST00000399492 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.15■□□□□ 0.98
CD27-AS1-201ENST00000399492 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.13■□□□□ 0.97
CD27-AS1-201ENST00000399492 CUL7Q14999 1698 aa21.12■□□□□ 0.97
CD27-AS1-201ENST00000399492 CEP170Q5SW79 1584 aa21.11■□□□□ 0.97
CD27-AS1-201ENST00000399492 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.08■□□□□ 0.97
CD27-AS1-201ENST00000399492 JPH4Q96JJ6 628 aa21.05■□□□□ 0.96
CD27-AS1-201ENST00000399492 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.01■□□□□ 0.95
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