RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000388782.8

GKAP1-204, Transcript of G kinase anchoring protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene GKAP1, Length 1,231 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1-204ENST00000388782 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.83■■■■■ 7.01
GKAP1-204ENST00000388782 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.06■■■■■ 5.92
GKAP1-204ENST00000388782 ABCC9O60706 1549 aa50.11■■■■■ 5.61
GKAP1-204ENST00000388782 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.19■■■■■ 5.47
GKAP1-204ENST00000388782 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.78■■■■■ 5.4
GKAP1-204ENST00000388782 NACADO15069 1562 aa48.75■■■■■ 5.39
GKAP1-204ENST00000388782 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.74■■■■■ 5.39
GKAP1-204ENST00000388782 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.72■■■■■ 5.39
GKAP1-204ENST00000388782 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.62■■■■■ 5.37
GKAP1-204ENST00000388782 SCRIBQ14160 1630 aa47.49■■■■■ 5.19
GKAP1-204ENST00000388782 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.47■■■■■ 5.19
GKAP1-204ENST00000388782 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.06■■■■■ 5.12
GKAP1-204ENST00000388782 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.89■■■■■ 5.1
GKAP1-204ENST00000388782 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.82■■■■■ 5.09
GKAP1-204ENST00000388782 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.73■■■■■ 5.07
GKAP1-204ENST00000388782 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.79■■■■■ 4.92
GKAP1-204ENST00000388782 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.68■■■■■ 4.9
GKAP1-204ENST00000388782 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.59■■■■■ 4.89
GKAP1-204ENST00000388782 SMARCA4P51532 1647 aa45.52■■■■■ 4.88
GKAP1-204ENST00000388782 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.41■■■■■ 4.86
GKAP1-204ENST00000388782 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.32■■■■■ 4.85
GKAP1-204ENST00000388782 SMARCA2P51531 1590 aa45.09■■■■■ 4.81
GKAP1-204ENST00000388782 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.08■■■■■ 4.81
GKAP1-204ENST00000388782 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.07■■■■■ 4.81
GKAP1-204ENST00000388782 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.05■■■■■ 4.8
GKAP1-204ENST00000388782 NCAPD3P42695 1498 aa44.93■■■■■ 4.78
GKAP1-204ENST00000388782 WIZO95785 1651 aa44.87■■■■■ 4.77
GKAP1-204ENST00000388782 HMGXB3Q12766 1538 aa44.83■■■■■ 4.77
GKAP1-204ENST00000388782 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.76■■■■■ 4.76
GKAP1-204ENST00000388782 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.5■■■■■ 4.71
GKAP1-204ENST00000388782 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.41■■■■■ 4.7
GKAP1-204ENST00000388782 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.91■■■■■ 4.62
GKAP1-204ENST00000388782 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.67■■■■■ 4.58
GKAP1-204ENST00000388782 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.65■■■■■ 4.58
GKAP1-204ENST00000388782 NESP48681 1621 aa43.56■■■■■ 4.56
GKAP1-204ENST00000388782 CFTRP13569 1480 aa43.56■■■■■ 4.56
GKAP1-204ENST00000388782 PRDM2Q13029 1718 aa43.36■■■■■ 4.53
GKAP1-204ENST00000388782 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.33■■■■■ 4.53
GKAP1-204ENST00000388782 ERCC6Q03468 1493 aa43.19■■■■■ 4.51
GKAP1-204ENST00000388782 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.16■■■■■ 4.5
GKAP1-204ENST00000388782 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.13■■■■■ 4.49
GKAP1-204ENST00000388782 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.09■■■■■ 4.49
GKAP1-204ENST00000388782 CUX2O14529 1486 aa43.07■■■■■ 4.49
GKAP1-204ENST00000388782 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.06■■■■■ 4.48
GKAP1-204ENST00000388782 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.85■■■■■ 4.45
GKAP1-204ENST00000388782 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.83■■■■■ 4.45
GKAP1-204ENST00000388782 WDR62O43379 1518 aa42.69■■■■■ 4.42
GKAP1-204ENST00000388782 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.66■■■■■ 4.42
GKAP1-204ENST00000388782 ABCC8Q09428 1581 aa42.65■■■■■ 4.42
GKAP1-204ENST00000388782 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.6■■■■■ 4.41
GKAP1-204ENST00000388782 TOPBP1Q92547 1522 aa42.55■■■■■ 4.4
GKAP1-204ENST00000388782 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.51■■■■■ 4.4
GKAP1-204ENST00000388782 CUX1P39880 1505 aa42.49■■■■■ 4.39
GKAP1-204ENST00000388782 TOP2BQ02880 1626 aa42.36■■■■■ 4.37
GKAP1-204ENST00000388782 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.36■■■■■ 4.37
GKAP1-204ENST00000388782 SYNJ1O43426 1573 aa42.35■■■■■ 4.37
GKAP1-204ENST00000388782 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.24■■■■■ 4.35
GKAP1-204ENST00000388782 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.23■■■■■ 4.35
GKAP1-204ENST00000388782 IFT140Q96RY7 1462 aa42.13■■■■■ 4.34
GKAP1-204ENST00000388782 SOGA1O94964 1423 aa42.05■■■■■ 4.32
GKAP1-204ENST00000388782 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.03■■■■■ 4.32
GKAP1-204ENST00000388782 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.99■■■■■ 4.31
GKAP1-204ENST00000388782 TRIM41Q8WV44 630 aa41.96■■■■■ 4.31
GKAP1-204ENST00000388782 WDR97A6NE52 1622 aa41.9■■■■■ 4.3
GKAP1-204ENST00000388782 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.89■■■■■ 4.3
GKAP1-204ENST00000388782 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.88■■■■■ 4.29
GKAP1-204ENST00000388782 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.8■■■■■ 4.28
GKAP1-204ENST00000388782 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.75■■■■■ 4.27
GKAP1-204ENST00000388782 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.69■■■■■ 4.26
GKAP1-204ENST00000388782 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.67■■■■■ 4.26
GKAP1-204ENST00000388782 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.66■■■■■ 4.26
GKAP1-204ENST00000388782 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.61■■■■■ 4.25
GKAP1-204ENST00000388782 KIF27Q86VH2 1401 aa41.58■■■■■ 4.25
GKAP1-204ENST00000388782 GRIN2BQ13224 1484 aa41.52■■■■■ 4.24
GKAP1-204ENST00000388782 PBRM1Q86U86 1689 aa41.51■■■■■ 4.24
GKAP1-204ENST00000388782 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.43■■■■■ 4.22
GKAP1-204ENST00000388782 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.36■■■■■ 4.21
GKAP1-204ENST00000388782 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.35■■■■■ 4.21
GKAP1-204ENST00000388782 EEA1Q15075 1411 aa41.32■■■■■ 4.21
GKAP1-204ENST00000388782 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.32■■■■■ 4.2
GKAP1-204ENST00000388782 IGF1RP08069 1367 aa41.25■■■■■ 4.19
GKAP1-204ENST00000388782 ADAMTS12P58397 1594 aa41.23■■■■■ 4.19
GKAP1-204ENST00000388782 CUL7Q14999 1698 aa41.22■■■■■ 4.19
GKAP1-204ENST00000388782 OSCARQ8IYS5 282 aa41.18■■■■■ 4.18
GKAP1-204ENST00000388782 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.18■■■■■ 4.18
GKAP1-204ENST00000388782 SYNJ2O15056 1496 aa41.16■■■■■ 4.18
GKAP1-204ENST00000388782 CHD1O14646 1710 aa41.07■■■■■ 4.16
GKAP1-204ENST00000388782 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.05■■■■■ 4.16
GKAP1-204ENST00000388782 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.04■■■■■ 4.16
GKAP1-204ENST00000388782 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.04■■■■■ 4.16
GKAP1-204ENST00000388782 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.01■■■■■ 4.16
GKAP1-204ENST00000388782 FBLN2P98095 1184 aa41■■■■■ 4.15
GKAP1-204ENST00000388782 GRIN2AQ12879 1464 aa40.98■■■■■ 4.15
GKAP1-204ENST00000388782 PRXQ9BXM0 1461 aa40.94■■■■■ 4.14
GKAP1-204ENST00000388782 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.92■■■■■ 4.14
GKAP1-204ENST00000388782 KIF21BO75037 1637 aa40.82■■■■■ 4.12
GKAP1-204ENST00000388782 NUP160Q12769 1436 aa40.77■■■■■ 4.12
GKAP1-204ENST00000388782 CEP170Q5SW79 1584 aa40.74■■■■■ 4.11
GKAP1-204ENST00000388782 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.64■■■■■ 4.1
GKAP1-204ENST00000388782 GOLGA3Q08378 1498 aa40.62■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms