RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380277.6

PXDC1-201, Transcript of PX domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene PXDC1, Length 1,538 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1-201ENST00000380277 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.77■■■■□ 3.32
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PXDC1-201ENST00000380277 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.83■■■□□ 2.37
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PXDC1-201ENST00000380277 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.78■■■□□ 2.36
PXDC1-201ENST00000380277 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.67■■■□□ 2.34
PXDC1-201ENST00000380277 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.6■■■□□ 2.33
PXDC1-201ENST00000380277 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.04■■■□□ 2.24
PXDC1-201ENST00000380277 SCRIBQ14160 1630 aa28.96■■■□□ 2.23
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PXDC1-201ENST00000380277 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.6■■■□□ 2.17
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PXDC1-201ENST00000380277 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
PXDC1-201ENST00000380277 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.95■■■□□ 2.07
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PXDC1-201ENST00000380277 HMGXB3Q12766 1538 aa27.37■■□□□ 1.97
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PXDC1-201ENST00000380277 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.57■■□□□ 1.84
PXDC1-201ENST00000380277 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.43■■□□□ 1.82
PXDC1-201ENST00000380277 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.41■■□□□ 1.82
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PXDC1-201ENST00000380277 PRDM2Q13029 1718 aa26.29■■□□□ 1.8
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PXDC1-201ENST00000380277 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.8■■□□□ 1.56
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PXDC1-201ENST00000380277 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.79■■□□□ 1.56
PXDC1-201ENST00000380277 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.79■■□□□ 1.56
PXDC1-201ENST00000380277 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.76■■□□□ 1.55
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