RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380277.6

PXDC1-201, Transcript of PX domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene PXDC1, Length 1,538 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1-201ENST00000380277 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.77■■■■□ 3.32
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PXDC1-201ENST00000380277 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
PXDC1-201ENST00000380277 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.83■■■□□ 2.37
PXDC1-201ENST00000380277 NACADO15069 1562 aa29.79■■■□□ 2.36
PXDC1-201ENST00000380277 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.78■■■□□ 2.36
PXDC1-201ENST00000380277 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.67■■■□□ 2.34
PXDC1-201ENST00000380277 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.6■■■□□ 2.33
PXDC1-201ENST00000380277 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.04■■■□□ 2.24
PXDC1-201ENST00000380277 SCRIBQ14160 1630 aa28.96■■■□□ 2.23
PXDC1-201ENST00000380277 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.94■■■□□ 2.22
PXDC1-201ENST00000380277 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.88■■■□□ 2.21
PXDC1-201ENST00000380277 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.6■■■□□ 2.17
PXDC1-201ENST00000380277 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.26■■■□□ 2.11
PXDC1-201ENST00000380277 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
PXDC1-201ENST00000380277 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.95■■■□□ 2.07
PXDC1-201ENST00000380277 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.85■■■□□ 2.05
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PXDC1-201ENST00000380277 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.55■■■□□ 2
PXDC1-201ENST00000380277 NCAPD3P42695 1498 aa27.51■■□□□ 1.99
PXDC1-201ENST00000380277 SMARCA2P51531 1590 aa27.5■■□□□ 1.99
PXDC1-201ENST00000380277 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.44■■□□□ 1.98
PXDC1-201ENST00000380277 HMGXB3Q12766 1538 aa27.37■■□□□ 1.97
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PXDC1-201ENST00000380277 NESP48681 1621 aa26.8■■□□□ 1.88
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PXDC1-201ENST00000380277 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.73■■□□□ 1.87
PXDC1-201ENST00000380277 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.72■■□□□ 1.87
PXDC1-201ENST00000380277 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.68■■□□□ 1.86
PXDC1-201ENST00000380277 ERCC6Q03468 1493 aa26.64■■□□□ 1.85
PXDC1-201ENST00000380277 CFTRP13569 1480 aa26.59■■□□□ 1.85
PXDC1-201ENST00000380277 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.57■■□□□ 1.84
PXDC1-201ENST00000380277 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.43■■□□□ 1.82
PXDC1-201ENST00000380277 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.41■■□□□ 1.82
PXDC1-201ENST00000380277 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.35■■□□□ 1.81
PXDC1-201ENST00000380277 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
PXDC1-201ENST00000380277 CUX2O14529 1486 aa26.3■■□□□ 1.8
PXDC1-201ENST00000380277 PRDM2Q13029 1718 aa26.29■■□□□ 1.8
PXDC1-201ENST00000380277 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.28■■□□□ 1.8
PXDC1-201ENST00000380277 WDR62O43379 1518 aa26.19■■□□□ 1.78
PXDC1-201ENST00000380277 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
PXDC1-201ENST00000380277 ABCC8Q09428 1581 aa25.99■■□□□ 1.75
PXDC1-201ENST00000380277 TOPBP1Q92547 1522 aa25.99■■□□□ 1.75
PXDC1-201ENST00000380277 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.96■■□□□ 1.75
PXDC1-201ENST00000380277 CUX1P39880 1505 aa25.86■■□□□ 1.73
PXDC1-201ENST00000380277 IFT140Q96RY7 1462 aa25.8■■□□□ 1.72
PXDC1-201ENST00000380277 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
PXDC1-201ENST00000380277 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.76■■□□□ 1.71
PXDC1-201ENST00000380277 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.74■■□□□ 1.71
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PXDC1-201ENST00000380277 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.68■■□□□ 1.7
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PXDC1-201ENST00000380277 TOP2BQ02880 1626 aa25.66■■□□□ 1.7
PXDC1-201ENST00000380277 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.63■■□□□ 1.69
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PXDC1-201ENST00000380277 WDR97A6NE52 1622 aa25.48■■□□□ 1.67
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PXDC1-201ENST00000380277 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.37■■□□□ 1.65
PXDC1-201ENST00000380277 GRIN2BQ13224 1484 aa25.37■■□□□ 1.65
PXDC1-201ENST00000380277 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.34■■□□□ 1.65
PXDC1-201ENST00000380277 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.32■■□□□ 1.64
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PXDC1-201ENST00000380277 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.19■■□□□ 1.62
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PXDC1-201ENST00000380277 IGF1RP08069 1367 aa25.1■■□□□ 1.61
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PXDC1-201ENST00000380277 CEP170Q5SW79 1584 aa24.89■■□□□ 1.58
PXDC1-201ENST00000380277 ARHGEF11O15085 1522 aa24.83■■□□□ 1.57
PXDC1-201ENST00000380277 EEA1Q15075 1411 aa24.81■■□□□ 1.56
PXDC1-201ENST00000380277 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.8■■□□□ 1.56
PXDC1-201ENST00000380277 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.79■■□□□ 1.56
PXDC1-201ENST00000380277 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.79■■□□□ 1.56
PXDC1-201ENST00000380277 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.79■■□□□ 1.56
PXDC1-201ENST00000380277 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.76■■□□□ 1.55
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