RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373793.3

GGTA1P-201, Transcript of glycoprotein, alpha-galactosyltransferase 1 pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GGTA1P, Length 1,544 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTA1P-201ENST00000373793 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.71■■■■■ 7.63
GGTA1P-201ENST00000373793 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.35■■■■■ 6.45
GGTA1P-201ENST00000373793 ABCC9O60706 1549 aa53.37■■■■■ 6.13
GGTA1P-201ENST00000373793 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.42■■■■■ 5.98
GGTA1P-201ENST00000373793 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.15■■■■■ 5.94
GGTA1P-201ENST00000373793 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.87■■■■■ 5.89
GGTA1P-201ENST00000373793 NACADO15069 1562 aa51.82■■■■■ 5.89
GGTA1P-201ENST00000373793 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.75■■■■■ 5.87
GGTA1P-201ENST00000373793 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.67■■■■■ 5.86
GGTA1P-201ENST00000373793 SCRIBQ14160 1630 aa50.65■■■■■ 5.7
GGTA1P-201ENST00000373793 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.59■■■■■ 5.69
GGTA1P-201ENST00000373793 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.19■■■■■ 5.63
GGTA1P-201ENST00000373793 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.09■■■■■ 5.61
GGTA1P-201ENST00000373793 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.04■■■■■ 5.6
GGTA1P-201ENST00000373793 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.78■■■■■ 5.4
GGTA1P-201ENST00000373793 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.71■■■■■ 5.39
GGTA1P-201ENST00000373793 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.54■■■■■ 5.36
GGTA1P-201ENST00000373793 SMARCA4P51532 1647 aa48.49■■■■■ 5.35
GGTA1P-201ENST00000373793 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.37■■■■■ 5.33
GGTA1P-201ENST00000373793 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.31■■■■■ 5.32
GGTA1P-201ENST00000373793 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.17■■■■■ 5.3
GGTA1P-201ENST00000373793 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.12■■■■■ 5.29
GGTA1P-201ENST00000373793 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.98■■■■■ 5.27
GGTA1P-201ENST00000373793 SMARCA2P51531 1590 aa47.96■■■■■ 5.27
GGTA1P-201ENST00000373793 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.95■■■■■ 5.27
GGTA1P-201ENST00000373793 WIZO95785 1651 aa47.93■■■■■ 5.26
GGTA1P-201ENST00000373793 NCAPD3P42695 1498 aa47.79■■■■■ 5.24
GGTA1P-201ENST00000373793 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.66■■■■■ 5.22
GGTA1P-201ENST00000373793 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.66■■■■■ 5.22
GGTA1P-201ENST00000373793 HMGXB3Q12766 1538 aa47.65■■■■■ 5.22
GGTA1P-201ENST00000373793 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.42■■■■■ 5.18
GGTA1P-201ENST00000373793 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.87■■■■■ 5.09
GGTA1P-201ENST00000373793 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.47■■■■■ 5.03
GGTA1P-201ENST00000373793 NESP48681 1621 aa46.45■■■■■ 5.03
GGTA1P-201ENST00000373793 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.42■■■■■ 5.02
GGTA1P-201ENST00000373793 CFTRP13569 1480 aa46.38■■■■■ 5.01
GGTA1P-201ENST00000373793 PRDM2Q13029 1718 aa46.16■■■■■ 4.98
GGTA1P-201ENST00000373793 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.07■■■■■ 4.97
GGTA1P-201ENST00000373793 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.96■■■■■ 4.95
GGTA1P-201ENST00000373793 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.94■■■■■ 4.95
GGTA1P-201ENST00000373793 ERCC6Q03468 1493 aa45.93■■■■■ 4.94
GGTA1P-201ENST00000373793 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.82■■■■■ 4.93
GGTA1P-201ENST00000373793 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.55■■■■■ 4.88
GGTA1P-201ENST00000373793 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.52■■■■■ 4.88
GGTA1P-201ENST00000373793 ABCC8Q09428 1581 aa45.48■■■■■ 4.87
GGTA1P-201ENST00000373793 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.45■■■■■ 4.87
GGTA1P-201ENST00000373793 WDR62O43379 1518 aa45.37■■■■■ 4.85
GGTA1P-201ENST00000373793 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.36■■■■■ 4.85
GGTA1P-201ENST00000373793 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.35■■■■■ 4.85
GGTA1P-201ENST00000373793 TOPBP1Q92547 1522 aa45.33■■■■■ 4.85
GGTA1P-201ENST00000373793 CUX1P39880 1505 aa45.32■■■■■ 4.85
GGTA1P-201ENST00000373793 SYNJ1O43426 1573 aa45.22■■■■■ 4.83
GGTA1P-201ENST00000373793 TOP2BQ02880 1626 aa45.16■■■■■ 4.82
GGTA1P-201ENST00000373793 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.15■■■■■ 4.82
GGTA1P-201ENST00000373793 CUX2O14529 1486 aa45.05■■■■■ 4.8
GGTA1P-201ENST00000373793 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.04■■■■■ 4.8
GGTA1P-201ENST00000373793 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45■■■■■ 4.79
GGTA1P-201ENST00000373793 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.96■■■■■ 4.79
GGTA1P-201ENST00000373793 TRIM41Q8WV44 630 aa44.95■■■■■ 4.79
GGTA1P-201ENST00000373793 SOGA1O94964 1423 aa44.83■■■■■ 4.77
GGTA1P-201ENST00000373793 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.82■■■■■ 4.77
GGTA1P-201ENST00000373793 IFT140Q96RY7 1462 aa44.8■■■■■ 4.76
GGTA1P-201ENST00000373793 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.76■■■■■ 4.76
GGTA1P-201ENST00000373793 WDR97A6NE52 1622 aa44.61■■■■■ 4.73
GGTA1P-201ENST00000373793 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.61■■■■■ 4.73
GGTA1P-201ENST00000373793 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.56■■■■■ 4.72
GGTA1P-201ENST00000373793 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.49■■■■■ 4.71
GGTA1P-201ENST00000373793 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.43■■■■■ 4.7
GGTA1P-201ENST00000373793 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.42■■■■■ 4.7
GGTA1P-201ENST00000373793 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.37■■■■■ 4.69
GGTA1P-201ENST00000373793 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.34■■■■■ 4.69
GGTA1P-201ENST00000373793 KIF27Q86VH2 1401 aa44.34■■■■■ 4.69
GGTA1P-201ENST00000373793 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.25■■■■■ 4.67
GGTA1P-201ENST00000373793 PBRM1Q86U86 1689 aa44.22■■■■■ 4.67
GGTA1P-201ENST00000373793 GRIN2BQ13224 1484 aa44.19■■■■■ 4.66
GGTA1P-201ENST00000373793 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.09■■■■■ 4.65
GGTA1P-201ENST00000373793 EEA1Q15075 1411 aa44.05■■■■■ 4.64
GGTA1P-201ENST00000373793 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.04■■■■■ 4.64
GGTA1P-201ENST00000373793 IGF1RP08069 1367 aa44.04■■■■■ 4.64
GGTA1P-201ENST00000373793 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.03■■■■■ 4.64
GGTA1P-201ENST00000373793 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.97■■■■■ 4.63
GGTA1P-201ENST00000373793 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.91■■■■■ 4.62
GGTA1P-201ENST00000373793 ADAMTS12P58397 1594 aa43.89■■■■■ 4.62
GGTA1P-201ENST00000373793 CUL7Q14999 1698 aa43.89■■■■■ 4.62
GGTA1P-201ENST00000373793 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.84■■■■■ 4.61
GGTA1P-201ENST00000373793 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.81■■■■■ 4.6
GGTA1P-201ENST00000373793 SYNJ2O15056 1496 aa43.8■■■■■ 4.6
GGTA1P-201ENST00000373793 FBLN2P98095 1184 aa43.77■■■■■ 4.6
GGTA1P-201ENST00000373793 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.75■■■■■ 4.59
GGTA1P-201ENST00000373793 CHD1O14646 1710 aa43.73■■■■■ 4.59
GGTA1P-201ENST00000373793 PRXQ9BXM0 1461 aa43.7■■■■■ 4.59
GGTA1P-201ENST00000373793 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.64■■■■■ 4.58
GGTA1P-201ENST00000373793 GRIN2AQ12879 1464 aa43.64■■■■■ 4.58
GGTA1P-201ENST00000373793 KIF21BO75037 1637 aa43.56■■■■■ 4.56
GGTA1P-201ENST00000373793 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.46■■■■■ 4.55
GGTA1P-201ENST00000373793 CEP170Q5SW79 1584 aa43.4■■■■■ 4.54
GGTA1P-201ENST00000373793 OSCARQ8IYS5 282 aa43.39■■■■■ 4.54
GGTA1P-201ENST00000373793 GOLGA3Q08378 1498 aa43.38■■■■■ 4.54
GGTA1P-201ENST00000373793 NUP160Q12769 1436 aa43.38■■■■■ 4.53
GGTA1P-201ENST00000373793 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.24■■■■■ 4.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms