RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357508.5

C1orf228-201, Transcript of Uncharacterized protein C1orf228, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C1orf228, Length 2,113 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf228-201ENST00000357508 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.11■■■■■ 6.73
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C1orf228-201ENST00000357508 ABCC9O60706 1549 aa47.51■■■■■ 5.2
C1orf228-201ENST00000357508 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.35■■■■■ 5.17
C1orf228-201ENST00000357508 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.27■■■■■ 5.16
C1orf228-201ENST00000357508 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.16■■■■■ 5.14
C1orf228-201ENST00000357508 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.7■■■■■ 5.07
C1orf228-201ENST00000357508 NACADO15069 1562 aa46.52■■■■■ 5.04
C1orf228-201ENST00000357508 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.19■■■■■ 4.98
C1orf228-201ENST00000357508 SCRIBQ14160 1630 aa45.89■■■■■ 4.94
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C1orf228-201ENST00000357508 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.25■■■■■ 4.83
C1orf228-201ENST00000357508 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.86■■■■■ 4.77
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C1orf228-201ENST00000357508 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.46■■■■■ 4.71
C1orf228-201ENST00000357508 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.35■■■■■ 4.69
C1orf228-201ENST00000357508 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.14■■■■■ 4.66
C1orf228-201ENST00000357508 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.09■■■■■ 4.65
C1orf228-201ENST00000357508 SMARCA4P51532 1647 aa43.94■■■■■ 4.62
C1orf228-201ENST00000357508 WIZO95785 1651 aa43.89■■■■■ 4.62
C1orf228-201ENST00000357508 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.52■■■■■ 4.56
C1orf228-201ENST00000357508 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.4■■■■■ 4.54
C1orf228-201ENST00000357508 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.33■■■■■ 4.53
C1orf228-201ENST00000357508 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.32■■■■■ 4.53
C1orf228-201ENST00000357508 SMARCA2P51531 1590 aa43.23■■■■■ 4.51
C1orf228-201ENST00000357508 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.04■■■■■ 4.48
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C1orf228-201ENST00000357508 TRIM41Q8WV44 630 aa42.98■■■■■ 4.47
C1orf228-201ENST00000357508 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.95■■■■■ 4.47
C1orf228-201ENST00000357508 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.94■■■■■ 4.46
C1orf228-201ENST00000357508 HMGXB3Q12766 1538 aa42.86■■■■■ 4.45
C1orf228-201ENST00000357508 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.76■■■■■ 4.44
C1orf228-201ENST00000357508 ABCC8Q09428 1581 aa42.42■■■■■ 4.38
C1orf228-201ENST00000357508 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.34■■■■■ 4.37
C1orf228-201ENST00000357508 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.23■■■■■ 4.35
C1orf228-201ENST00000357508 CFTRP13569 1480 aa41.96■■■■■ 4.31
C1orf228-201ENST00000357508 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.92■■■■■ 4.3
C1orf228-201ENST00000357508 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.88■■■■■ 4.3
C1orf228-201ENST00000357508 SYNJ1O43426 1573 aa41.81■■■■■ 4.28
C1orf228-201ENST00000357508 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.79■■■■■ 4.28
C1orf228-201ENST00000357508 SOGA1O94964 1423 aa41.76■■■■■ 4.27
C1orf228-201ENST00000357508 PCGF6Q9BYE7 350 aa41.72■■■■■ 4.27
C1orf228-201ENST00000357508 EEA1Q15075 1411 aa41.7■■■■■ 4.27
C1orf228-201ENST00000357508 NESP48681 1621 aa41.64■■■■■ 4.26
C1orf228-201ENST00000357508 PRDM2Q13029 1718 aa41.61■■■■■ 4.25
C1orf228-201ENST00000357508 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.6■■■■■ 4.25
C1orf228-201ENST00000357508 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.52■■■■■ 4.24
C1orf228-201ENST00000357508 TOP2BQ02880 1626 aa41.5■■■■■ 4.23
C1orf228-201ENST00000357508 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.46■■■■■ 4.23
C1orf228-201ENST00000357508 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.45■■■■■ 4.23
C1orf228-201ENST00000357508 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.41■■■■■ 4.22
C1orf228-201ENST00000357508 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP41.41■■■■■ 4.22
C1orf228-201ENST00000357508 CUX1P39880 1505 aa41.28■■■■■ 4.2
C1orf228-201ENST00000357508 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.27■■■■■ 4.2
C1orf228-201ENST00000357508 GOLGA3Q08378 1498 aa41.24■■■■■ 4.19
C1orf228-201ENST00000357508 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.24■■■■■ 4.19
C1orf228-201ENST00000357508 KIF21BO75037 1637 aa41.22■■■■■ 4.19
C1orf228-201ENST00000357508 HRCP23327 699 aa41.21■■■■■ 4.19
C1orf228-201ENST00000357508 CEP162Q5TB80 1403 aa41.17■■■■■ 4.18
C1orf228-201ENST00000357508 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.15■■■■■ 4.18
C1orf228-201ENST00000357508 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.06■■■■■ 4.16
C1orf228-201ENST00000357508 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
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C1orf228-201ENST00000357508 TOPBP1Q92547 1522 aa40.93■■■■■ 4.14
C1orf228-201ENST00000357508 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
C1orf228-201ENST00000357508 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.87■■■■■ 4.13
C1orf228-201ENST00000357508 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.86■■■■■ 4.13
C1orf228-201ENST00000357508 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.74■■■■■ 4.11
C1orf228-201ENST00000357508 KIF27Q86VH2 1401 aa40.74■■■■■ 4.11
C1orf228-201ENST00000357508 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.73■■■■■ 4.11
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C1orf228-201ENST00000357508 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.72■■■■■ 4.11
C1orf228-201ENST00000357508 ERCC6Q03468 1493 aa40.72■■■■■ 4.11
C1orf228-201ENST00000357508 PRXQ9BXM0 1461 aa40.72■■■■■ 4.11
C1orf228-201ENST00000357508 CLIP1P30622 1438 aa40.63■■■■■ 4.09
C1orf228-201ENST00000357508 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.62■■■■■ 4.09
C1orf228-201ENST00000357508 CUX2O14529 1486 aa40.56■■■■■ 4.08
C1orf228-201ENST00000357508 WDR62O43379 1518 aa40.52■■■■■ 4.08
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C1orf228-201ENST00000357508 WDR97A6NE52 1622 aa40.34■■■■■ 4.05
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C1orf228-201ENST00000357508 IGF1RP08069 1367 aa40.31■■■■■ 4.04
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C1orf228-201ENST00000357508 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.24■■■■■ 4.03
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C1orf228-201ENST00000357508 ARAP1Q96P48 1450 aa40.17■■■■■ 4.02
C1orf228-201ENST00000357508 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.16■■■■■ 4.02
C1orf228-201ENST00000357508 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP40.13■■■■■ 4.02
C1orf228-201ENST00000357508 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.12■■■■■ 4.01
C1orf228-201ENST00000357508 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.12■■■■■ 4.01
C1orf228-201ENST00000357508 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.04■■■■■ 4
C1orf228-201ENST00000357508 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.04■■■■■ 4
C1orf228-201ENST00000357508 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.98■■■■□ 3.99
C1orf228-201ENST00000357508 APLP2Q06481 763 aa39.95■■■■□ 3.99
C1orf228-201ENST00000357508 CUL7Q14999 1698 aa39.94■■■■□ 3.98
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