RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336070.11

FRMD1-202, Transcript of FERM domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene FRMD1, Length 1,600 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD1-202ENST00000336070 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.29■■■■■ 4.36
FRMD1-202ENST00000336070 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.05■■■■□ 3.52
FRMD1-202ENST00000336070 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.42■■■■□ 3.26
FRMD1-202ENST00000336070 ABCC9O60706 1549 aa35.34■■■■□ 3.25
FRMD1-202ENST00000336070 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.08■■■■□ 3.21
FRMD1-202ENST00000336070 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.01■■■■□ 3.19
FRMD1-202ENST00000336070 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.89■■■■□ 3.18
FRMD1-202ENST00000336070 NACADO15069 1562 aa34.71■■■■□ 3.15
FRMD1-202ENST00000336070 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.46■■■■□ 3.11
FRMD1-202ENST00000336070 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.99■■■■□ 3.03
FRMD1-202ENST00000336070 SCRIBQ14160 1630 aa33.87■■■■□ 3.01
FRMD1-202ENST00000336070 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.5■■■□□ 2.95
FRMD1-202ENST00000336070 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.33■■■□□ 2.93
FRMD1-202ENST00000336070 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.27■■■□□ 2.92
FRMD1-202ENST00000336070 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.81■■■□□ 2.84
FRMD1-202ENST00000336070 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.71■■■□□ 2.83
FRMD1-202ENST00000336070 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.64■■■□□ 2.82
FRMD1-202ENST00000336070 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.6■■■□□ 2.81
FRMD1-202ENST00000336070 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.57■■■□□ 2.8
FRMD1-202ENST00000336070 SMARCA4P51532 1647 aa32.53■■■□□ 2.8
FRMD1-202ENST00000336070 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.4■■■□□ 2.78
FRMD1-202ENST00000336070 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.26■■■□□ 2.75
FRMD1-202ENST00000336070 WIZO95785 1651 aa32.2■■■□□ 2.75
FRMD1-202ENST00000336070 SMARCA2P51531 1590 aa32.19■■■□□ 2.74
FRMD1-202ENST00000336070 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.19■■■□□ 2.74
FRMD1-202ENST00000336070 NCAPD3P42695 1498 aa32.07■■■□□ 2.72
FRMD1-202ENST00000336070 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.99■■■□□ 2.71
FRMD1-202ENST00000336070 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
FRMD1-202ENST00000336070 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.96■■■□□ 2.71
FRMD1-202ENST00000336070 HMGXB3Q12766 1538 aa31.92■■■□□ 2.7
FRMD1-202ENST00000336070 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.66■■■□□ 2.66
FRMD1-202ENST00000336070 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.6■■■□□ 2.65
FRMD1-202ENST00000336070 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.2■■■□□ 2.58
FRMD1-202ENST00000336070 CFTRP13569 1480 aa31.19■■■□□ 2.58
FRMD1-202ENST00000336070 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.05■■■□□ 2.56
FRMD1-202ENST00000336070 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.98■■■□□ 2.55
FRMD1-202ENST00000336070 NESP48681 1621 aa30.86■■■□□ 2.53
FRMD1-202ENST00000336070 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.83■■■□□ 2.53
FRMD1-202ENST00000336070 PRDM2Q13029 1718 aa30.81■■■□□ 2.52
FRMD1-202ENST00000336070 TRIM41Q8WV44 630 aa30.8■■■□□ 2.52
FRMD1-202ENST00000336070 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.77■■■□□ 2.52
FRMD1-202ENST00000336070 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.75■■■□□ 2.51
FRMD1-202ENST00000336070 ABCC8Q09428 1581 aa30.71■■■□□ 2.51
FRMD1-202ENST00000336070 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.63■■■□□ 2.49
FRMD1-202ENST00000336070 TOP2BQ02880 1626 aa30.5■■■□□ 2.47
FRMD1-202ENST00000336070 CUX1P39880 1505 aa30.49■■■□□ 2.47
FRMD1-202ENST00000336070 SYNJ1O43426 1573 aa30.49■■■□□ 2.47
FRMD1-202ENST00000336070 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.44■■■□□ 2.46
FRMD1-202ENST00000336070 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.43■■■□□ 2.46
FRMD1-202ENST00000336070 ERCC6Q03468 1493 aa30.43■■■□□ 2.46
FRMD1-202ENST00000336070 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.4■■■□□ 2.46
FRMD1-202ENST00000336070 TOPBP1Q92547 1522 aa30.37■■■□□ 2.45
FRMD1-202ENST00000336070 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.36■■■□□ 2.45
FRMD1-202ENST00000336070 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
FRMD1-202ENST00000336070 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.24■■■□□ 2.43
FRMD1-202ENST00000336070 WDR62O43379 1518 aa30.21■■■□□ 2.43
FRMD1-202ENST00000336070 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
FRMD1-202ENST00000336070 EEA1Q15075 1411 aa30.19■■■□□ 2.42
FRMD1-202ENST00000336070 SOGA1O94964 1423 aa30.15■■■□□ 2.42
FRMD1-202ENST00000336070 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
FRMD1-202ENST00000336070 KIF27Q86VH2 1401 aa30.05■■■□□ 2.4
FRMD1-202ENST00000336070 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
FRMD1-202ENST00000336070 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.04■■■□□ 2.4
FRMD1-202ENST00000336070 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.03■■■□□ 2.4
FRMD1-202ENST00000336070 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.02■■■□□ 2.4
FRMD1-202ENST00000336070 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.99■■■□□ 2.39
FRMD1-202ENST00000336070 CUX2O14529 1486 aa29.98■■■□□ 2.39
FRMD1-202ENST00000336070 IFT140Q96RY7 1462 aa29.97■■■□□ 2.39
FRMD1-202ENST00000336070 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
FRMD1-202ENST00000336070 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
FRMD1-202ENST00000336070 IGF1RP08069 1367 aa29.83■■■□□ 2.37
FRMD1-202ENST00000336070 WDR97A6NE52 1622 aa29.83■■■□□ 2.37
FRMD1-202ENST00000336070 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.79■■■□□ 2.36
FRMD1-202ENST00000336070 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.75■■■□□ 2.35
FRMD1-202ENST00000336070 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.74■■■□□ 2.35
FRMD1-202ENST00000336070 PRXQ9BXM0 1461 aa29.71■■■□□ 2.35
FRMD1-202ENST00000336070 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.7■■■□□ 2.35
FRMD1-202ENST00000336070 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.7■■■□□ 2.34
FRMD1-202ENST00000336070 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
FRMD1-202ENST00000336070 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.67■■■□□ 2.34
FRMD1-202ENST00000336070 KIF21BO75037 1637 aa29.66■■■□□ 2.34
FRMD1-202ENST00000336070 GRIN2BQ13224 1484 aa29.65■■■□□ 2.34
FRMD1-202ENST00000336070 GOLGA3Q08378 1498 aa29.63■■■□□ 2.33
FRMD1-202ENST00000336070 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.57■■■□□ 2.32
FRMD1-202ENST00000336070 CUL7Q14999 1698 aa29.56■■■□□ 2.32
FRMD1-202ENST00000336070 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
FRMD1-202ENST00000336070 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
FRMD1-202ENST00000336070 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.52■■■□□ 2.32
FRMD1-202ENST00000336070 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.52■■■□□ 2.32
FRMD1-202ENST00000336070 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.51■■■□□ 2.31
FRMD1-202ENST00000336070 PBRM1Q86U86 1689 aa29.48■■■□□ 2.31
FRMD1-202ENST00000336070 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
FRMD1-202ENST00000336070 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.41■■■□□ 2.3
FRMD1-202ENST00000336070 ADAMTS12P58397 1594 aa29.38■■■□□ 2.29
FRMD1-202ENST00000336070 SYNJ2O15056 1496 aa29.33■■■□□ 2.29
FRMD1-202ENST00000336070 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
FRMD1-202ENST00000336070 GRIN2AQ12879 1464 aa29.24■■■□□ 2.27
FRMD1-202ENST00000336070 CEP162Q5TB80 1403 aa29.23■■■□□ 2.27
FRMD1-202ENST00000336070 FBLN2P98095 1184 aa29.2■■■□□ 2.27
FRMD1-202ENST00000336070 CLIP1P30622 1438 aa29.13■■■□□ 2.25
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