RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296733.5

CDC20B-201, Transcript of cell division cycle 20B, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CDC20B, Length 2,946 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC20B-201ENST00000296733 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.91■■■□□ 2.22
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CDC20B-201ENST00000296733 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.31■■□□□ 1.48
CDC20B-201ENST00000296733 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
CDC20B-201ENST00000296733 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.76■■□□□ 1.39
CDC20B-201ENST00000296733 NACADO15069 1562 aa23.64■■□□□ 1.38
CDC20B-201ENST00000296733 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.61■■□□□ 1.37
CDC20B-201ENST00000296733 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.59■■□□□ 1.37
CDC20B-201ENST00000296733 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.56■■□□□ 1.36
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CDC20B-201ENST00000296733 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.6■■□□□ 1.21
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CDC20B-201ENST00000296733 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.03■■□□□ 1.12
CDC20B-201ENST00000296733 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22■■□□□ 1.11
CDC20B-201ENST00000296733 SMARCA2P51531 1590 aa21.95■■□□□ 1.1
CDC20B-201ENST00000296733 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.94■■□□□ 1.1
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CDC20B-201ENST00000296733 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.15■□□□□ 0.98
CDC20B-201ENST00000296733 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.12■□□□□ 0.97
CDC20B-201ENST00000296733 TRIM41Q8WV44 630 aa21.11■□□□□ 0.97
CDC20B-201ENST00000296733 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.07■□□□□ 0.96
CDC20B-201ENST00000296733 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.04■□□□□ 0.96
CDC20B-201ENST00000296733 PRDM2Q13029 1718 aa21.01■□□□□ 0.95
CDC20B-201ENST00000296733 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.01■□□□□ 0.95
CDC20B-201ENST00000296733 ERCC6Q03468 1493 aa20.99■□□□□ 0.95
CDC20B-201ENST00000296733 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.99■□□□□ 0.95
CDC20B-201ENST00000296733 SYNJ1O43426 1573 aa20.96■□□□□ 0.95
CDC20B-201ENST00000296733 CUX1P39880 1505 aa20.93■□□□□ 0.94
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CDC20B-201ENST00000296733 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
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CDC20B-201ENST00000296733 KIF27Q86VH2 1401 aa20.52■□□□□ 0.88
CDC20B-201ENST00000296733 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.52■□□□□ 0.88
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CDC20B-201ENST00000296733 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
CDC20B-201ENST00000296733 IFT140Q96RY7 1462 aa20.49■□□□□ 0.87
CDC20B-201ENST00000296733 EEA1Q15075 1411 aa20.43■□□□□ 0.86
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CDC20B-201ENST00000296733 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CDC20B-201ENST00000296733 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.16■□□□□ 0.82
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CDC20B-201ENST00000296733 ADAMTS12P58397 1594 aa20.13■□□□□ 0.81
CDC20B-201ENST00000296733 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CDC20B-201ENST00000296733 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.08■□□□□ 0.8
CDC20B-201ENST00000296733 SYNJ2O15056 1496 aa20.08■□□□□ 0.8
CDC20B-201ENST00000296733 GRIN2AQ12879 1464 aa20.05■□□□□ 0.8
CDC20B-201ENST00000296733 CEP162Q5TB80 1403 aa20■□□□□ 0.79
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