RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258403.7

SLC19A3-201, Transcript of solute carrier family 19 member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC19A3, Length 3,105 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A3-201ENST00000258403 NISCHQ9Y2I1 1504 aa20.85■□□□□ 0.93
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SLC19A3-201ENST00000258403 ABCC9O60706 1549 aa17.47■□□□□ 0.39
SLC19A3-201ENST00000258403 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
SLC19A3-201ENST00000258403 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa17.37■□□□□ 0.37
SLC19A3-201ENST00000258403 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa17.07■□□□□ 0.32
SLC19A3-201ENST00000258403 NACADO15069 1562 aa16.9■□□□□ 0.3
SLC19A3-201ENST00000258403 MYO15BQ96JP2 1530 aa16.86■□□□□ 0.29
SLC19A3-201ENST00000258403 SCRIBQ14160 1630 aa16.84■□□□□ 0.29
SLC19A3-201ENST00000258403 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa16.81■□□□□ 0.28
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SLC19A3-201ENST00000258403 CECR2Q9BXF3 1484 aa16.32■□□□□ 0.2
SLC19A3-201ENST00000258403 BICRAQ9NZM4 1560 aa16.27■□□□□ 0.2
SLC19A3-201ENST00000258403 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
SLC19A3-201ENST00000258403 MROH2BQ7Z745 1585 aa16.17■□□□□ 0.18
SLC19A3-201ENST00000258403 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
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SLC19A3-201ENST00000258403 SMARCA4P51532 1647 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC19A3-201ENST00000258403 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
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SLC19A3-201ENST00000258403 CHIC1Q5VXU3 224 aa15.81■□□□□ 0.12
SLC19A3-201ENST00000258403 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
SLC19A3-201ENST00000258403 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
SLC19A3-201ENST00000258403 SMARCA2P51531 1590 aa15.76■□□□□ 0.11
SLC19A3-201ENST00000258403 CCDC88BA6NC98 1476 aa15.72■□□□□ 0.11
SLC19A3-201ENST00000258403 PEG3Q9GZU2 1588 aa15.7■□□□□ 0.1
SLC19A3-201ENST00000258403 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa15.65■□□□□ 0.1
SLC19A3-201ENST00000258403 NCAPD3P42695 1498 aa15.64■□□□□ 0.1
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SLC19A3-201ENST00000258403 HMGXB3Q12766 1538 aa15.55■□□□□ 0.08
SLC19A3-201ENST00000258403 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
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SLC19A3-201ENST00000258403 ABCC8Q09428 1581 aa15.44■□□□□ 0.06
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SLC19A3-201ENST00000258403 CADPSQ9ULU8 1353 aa15.34■□□□□ 0.05
SLC19A3-201ENST00000258403 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP15.32■□□□□ 0.04
SLC19A3-201ENST00000258403 CFTRP13569 1480 aa15.31■□□□□ 0.04
SLC19A3-201ENST00000258403 NESP48681 1621 aa15.28■□□□□ 0.04
SLC19A3-201ENST00000258403 SYNJ1O43426 1573 aa15.18■□□□□ 0.02
SLC19A3-201ENST00000258403 FANCD2Q9BXW9 1451 aa15.17■□□□□ 0.02
SLC19A3-201ENST00000258403 SOGA1O94964 1423 aa15.17■□□□□ 0.02
SLC19A3-201ENST00000258403 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa15.11■□□□□ 0.01
SLC19A3-201ENST00000258403 PDS5BQ9NTI5 1447 aa15.1■□□□□ 0.01
SLC19A3-201ENST00000258403 CUX1P39880 1505 aa15.1■□□□□ 0.01
SLC19A3-201ENST00000258403 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa15.09■□□□□ 0.01
SLC19A3-201ENST00000258403 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.09■□□□□ 0.01
SLC19A3-201ENST00000258403 CEP164Q9UPV0 1460 aa15.07■□□□□ 0
SLC19A3-201ENST00000258403 TOP2BQ02880 1626 aa15.06■□□□□ 0
SLC19A3-201ENST00000258403 UBTFP17480 764 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
SLC19A3-201ENST00000258403 PRDM2Q13029 1718 aa15.03■□□□□ -0
SLC19A3-201ENST00000258403 ERCC6Q03468 1493 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC19A3-201ENST00000258403 FGD5Q6ZNL6 1462 aa14.99□□□□□ -0.01
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SLC19A3-201ENST00000258403 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC19A3-201ENST00000258403 EEA1Q15075 1411 aa14.97□□□□□ -0.01
SLC19A3-201ENST00000258403 TOPBP1Q92547 1522 aa14.96□□□□□ -0.01
SLC19A3-201ENST00000258403 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SLC19A3-201ENST00000258403 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC19A3-201ENST00000258403 CUX2O14529 1486 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC19A3-201ENST00000258403 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC19A3-201ENST00000258403 KIF27Q86VH2 1401 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC19A3-201ENST00000258403 DNMBPQ6XZF7 1577 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC19A3-201ENST00000258403 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SLC19A3-201ENST00000258403 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SLC19A3-201ENST00000258403 MRC2Q9UBG0 1479 aa14.86□□□□□ -0.03
SLC19A3-201ENST00000258403 GOLGA3Q08378 1498 aa14.84□□□□□ -0.03
SLC19A3-201ENST00000258403 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa14.83□□□□□ -0.04
SLC19A3-201ENST00000258403 IGF1RP08069 1367 aa14.81□□□□□ -0.04
SLC19A3-201ENST00000258403 TNIKQ9UKE5 1360 aa14.78□□□□□ -0.04
SLC19A3-201ENST00000258403 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa14.77□□□□□ -0.04
SLC19A3-201ENST00000258403 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
SLC19A3-201ENST00000258403 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa14.77□□□□□ -0.04
SLC19A3-201ENST00000258403 CEP162Q5TB80 1403 aa14.76□□□□□ -0.05
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SLC19A3-201ENST00000258403 PRXQ9BXM0 1461 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC19A3-201ENST00000258403 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SLC19A3-201ENST00000258403 KIF21BO75037 1637 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC19A3-201ENST00000258403 GAPVD1Q14C86 1478 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC19A3-201ENST00000258403 WDR62O43379 1518 aa14.71□□□□□ -0.06
SLC19A3-201ENST00000258403 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SLC19A3-201ENST00000258403 FBLN2P98095 1184 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC19A3-201ENST00000258403 CLIP1P30622 1438 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC19A3-201ENST00000258403 IFT140Q96RY7 1462 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC19A3-201ENST00000258403 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SLC19A3-201ENST00000258403 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SLC19A3-201ENST00000258403 ERICH3Q5RHP9 1530 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC19A3-201ENST00000258403 P3H3Q8IVL6 736 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC19A3-201ENST00000258403 PCGF6Q9BYE7 350 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC19A3-201ENST00000258403 WDR97A6NE52 1622 aa14.6□□□□□ -0.07
SLC19A3-201ENST00000258403 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa14.6□□□□□ -0.07
SLC19A3-201ENST00000258403 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SLC19A3-201ENST00000258403 GRIN2BQ13224 1484 aa14.58□□□□□ -0.08
SLC19A3-201ENST00000258403 APLP2Q06481 763 aa14.58□□□□□ -0.08
SLC19A3-201ENST00000258403 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SLC19A3-201ENST00000258403 CUL7Q14999 1698 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC19A3-201ENST00000258403 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa14.53□□□□□ -0.08
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