RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 NISCHQ9Y2I1 1504 aa23.58■■□□□ 1.37
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PRRX1-201ENST00000239461 SMARCA2P51531 1590 aa17.83■□□□□ 0.45
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PRRX1-201ENST00000239461 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
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PRRX1-201ENST00000239461 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
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PRRX1-201ENST00000239461 HRCP23327 699 aa16.26■□□□□ 0.19
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