RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000238091.8

ITGB1BP1-201, Transcript of integrin subunit beta 1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ITGB1BP1, Length 1,772 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1BP1-201ENST00000238091 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.04■■■□□ 2.56
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ITGB1BP1-201ENST00000238091 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
ITGB1BP1-201ENST00000238091 ABCC9O60706 1549 aa25.82■■□□□ 1.72
ITGB1BP1-201ENST00000238091 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.71■■□□□ 1.71
ITGB1BP1-201ENST00000238091 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.66■■□□□ 1.7
ITGB1BP1-201ENST00000238091 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.41■■□□□ 1.66
ITGB1BP1-201ENST00000238091 NACADO15069 1562 aa25.29■■□□□ 1.64
ITGB1BP1-201ENST00000238091 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.21■■□□□ 1.63
ITGB1BP1-201ENST00000238091 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.1■■□□□ 1.61
ITGB1BP1-201ENST00000238091 SCRIBQ14160 1630 aa24.9■■□□□ 1.58
ITGB1BP1-201ENST00000238091 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.57■■□□□ 1.52
ITGB1BP1-201ENST00000238091 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.39■■□□□ 1.5
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ITGB1BP1-201ENST00000238091 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
ITGB1BP1-201ENST00000238091 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.17■■□□□ 1.46
ITGB1BP1-201ENST00000238091 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
ITGB1BP1-201ENST00000238091 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.99■■□□□ 1.43
ITGB1BP1-201ENST00000238091 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
ITGB1BP1-201ENST00000238091 SMARCA4P51532 1647 aa23.86■■□□□ 1.41
ITGB1BP1-201ENST00000238091 WIZO95785 1651 aa23.75■■□□□ 1.39
ITGB1BP1-201ENST00000238091 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
ITGB1BP1-201ENST00000238091 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.59■■□□□ 1.37
ITGB1BP1-201ENST00000238091 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.56■■□□□ 1.36
ITGB1BP1-201ENST00000238091 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
ITGB1BP1-201ENST00000238091 SMARCA2P51531 1590 aa23.49■■□□□ 1.35
ITGB1BP1-201ENST00000238091 NCAPD3P42695 1498 aa23.39■■□□□ 1.33
ITGB1BP1-201ENST00000238091 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
ITGB1BP1-201ENST00000238091 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.34■■□□□ 1.33
ITGB1BP1-201ENST00000238091 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.3■■□□□ 1.32
ITGB1BP1-201ENST00000238091 HMGXB3Q12766 1538 aa23.29■■□□□ 1.32
ITGB1BP1-201ENST00000238091 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.1■■□□□ 1.29
ITGB1BP1-201ENST00000238091 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.02■■□□□ 1.28
ITGB1BP1-201ENST00000238091 CFTRP13569 1480 aa22.81■■□□□ 1.24
ITGB1BP1-201ENST00000238091 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.78■■□□□ 1.24
ITGB1BP1-201ENST00000238091 TRIM41Q8WV44 630 aa22.74■■□□□ 1.23
ITGB1BP1-201ENST00000238091 ABCC8Q09428 1581 aa22.72■■□□□ 1.23
ITGB1BP1-201ENST00000238091 NESP48681 1621 aa22.63■■□□□ 1.21
ITGB1BP1-201ENST00000238091 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.6■■□□□ 1.21
ITGB1BP1-201ENST00000238091 PRDM2Q13029 1718 aa22.57■■□□□ 1.2
ITGB1BP1-201ENST00000238091 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.57■■□□□ 1.2
ITGB1BP1-201ENST00000238091 SYNJ1O43426 1573 aa22.5■■□□□ 1.19
ITGB1BP1-201ENST00000238091 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.5■■□□□ 1.19
ITGB1BP1-201ENST00000238091 CUX1P39880 1505 aa22.43■■□□□ 1.18
ITGB1BP1-201ENST00000238091 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.42■■□□□ 1.18
ITGB1BP1-201ENST00000238091 TOP2BQ02880 1626 aa22.41■■□□□ 1.18
ITGB1BP1-201ENST00000238091 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.38■■□□□ 1.17
ITGB1BP1-201ENST00000238091 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.35■■□□□ 1.17
ITGB1BP1-201ENST00000238091 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
ITGB1BP1-201ENST00000238091 SOGA1O94964 1423 aa22.3■■□□□ 1.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.28■■□□□ 1.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 TOPBP1Q92547 1522 aa22.24■■□□□ 1.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.24■■□□□ 1.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.24■■□□□ 1.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.22■■□□□ 1.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.2■■□□□ 1.14
ITGB1BP1-201ENST00000238091 EEA1Q15075 1411 aa22.17■■□□□ 1.14
ITGB1BP1-201ENST00000238091 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.14■■□□□ 1.13
ITGB1BP1-201ENST00000238091 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.13■■□□□ 1.13
ITGB1BP1-201ENST00000238091 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
ITGB1BP1-201ENST00000238091 ERCC6Q03468 1493 aa22.1■■□□□ 1.13
ITGB1BP1-201ENST00000238091 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.07■■□□□ 1.12
ITGB1BP1-201ENST00000238091 KIF27Q86VH2 1401 aa22.04■■□□□ 1.12
ITGB1BP1-201ENST00000238091 CUX2O14529 1486 aa22.02■■□□□ 1.12
ITGB1BP1-201ENST00000238091 WDR62O43379 1518 aa22.02■■□□□ 1.12
ITGB1BP1-201ENST00000238091 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.02■■□□□ 1.11
ITGB1BP1-201ENST00000238091 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.01■■□□□ 1.11
ITGB1BP1-201ENST00000238091 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
ITGB1BP1-201ENST00000238091 IGF1RP08069 1367 aa21.92■■□□□ 1.1
ITGB1BP1-201ENST00000238091 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
ITGB1BP1-201ENST00000238091 WDR97A6NE52 1622 aa21.9■■□□□ 1.1
ITGB1BP1-201ENST00000238091 PRXQ9BXM0 1461 aa21.88■■□□□ 1.09
ITGB1BP1-201ENST00000238091 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
ITGB1BP1-201ENST00000238091 KIF21BO75037 1637 aa21.88■■□□□ 1.09
ITGB1BP1-201ENST00000238091 GOLGA3Q08378 1498 aa21.85■■□□□ 1.09
ITGB1BP1-201ENST00000238091 IFT140Q96RY7 1462 aa21.85■■□□□ 1.09
ITGB1BP1-201ENST00000238091 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.83■■□□□ 1.09
ITGB1BP1-201ENST00000238091 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.81■■□□□ 1.08
ITGB1BP1-201ENST00000238091 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.8■■□□□ 1.08
ITGB1BP1-201ENST00000238091 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.8■■□□□ 1.08
ITGB1BP1-201ENST00000238091 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
ITGB1BP1-201ENST00000238091 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.78■■□□□ 1.08
ITGB1BP1-201ENST00000238091 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.77■■□□□ 1.08
ITGB1BP1-201ENST00000238091 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
ITGB1BP1-201ENST00000238091 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.76■■□□□ 1.07
ITGB1BP1-201ENST00000238091 CUL7Q14999 1698 aa21.65■■□□□ 1.06
ITGB1BP1-201ENST00000238091 GRIN2BQ13224 1484 aa21.65■■□□□ 1.06
ITGB1BP1-201ENST00000238091 CEP162Q5TB80 1403 aa21.64■■□□□ 1.05
ITGB1BP1-201ENST00000238091 PBRM1Q86U86 1689 aa21.62■■□□□ 1.05
ITGB1BP1-201ENST00000238091 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
ITGB1BP1-201ENST00000238091 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.57■■□□□ 1.04
ITGB1BP1-201ENST00000238091 ADAMTS12P58397 1594 aa21.53■■□□□ 1.04
ITGB1BP1-201ENST00000238091 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.53■■□□□ 1.04
ITGB1BP1-201ENST00000238091 CLIP1P30622 1438 aa21.51■■□□□ 1.03
ITGB1BP1-201ENST00000238091 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
ITGB1BP1-201ENST00000238091 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
ITGB1BP1-201ENST00000238091 SYNJ2O15056 1496 aa21.4■■□□□ 1.02
ITGB1BP1-201ENST00000238091 GRIN2AQ12879 1464 aa21.38■■□□□ 1.01
ITGB1BP1-201ENST00000238091 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
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