RNA–Protein interactions for RNA: YNL093W

YPT53, Transcript of Stress-induced Rab family GTPase, yeast

Gene YPT53, Length 663 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YPT53	YNL093W	THI12	P42883	340 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YPT53	YNL093W	THI5	P43534	340 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YPT53	YNL093W	THI11	P47183	340 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YPT53	YNL093W	YGR021W	P53212	290 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YPT53	YNL093W	FOL1	P53848	824 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YPT53	YNL093W	YNL058C	P53947	316 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YPT53	YNL093W	VTC3	Q02725	835 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YPT53	YNL093W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YPT53	YNL093W	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YPT53	YNL093W	THI13	Q07748	340 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YPT53	YNL093W	GAS4	Q08271	471 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YPT53	YNL093W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.65	□□□□□ -1.67	not detected
YPT53	YNL093W	PUP1	P25043	261 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	RAD27	P26793	382 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	ANP1	P32629	500 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	LIP5	P32875	414 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	TOS1	P38288	455 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	HSE1	P38753	452 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	YHR218W	P38899	603 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	GIP2	P40036	548 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	KEL2	P50090	882 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	ATG1	P53104	897 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	YGR130C	P53278	816 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	RIA1	P53893	1110 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	ALD3	P54114	506 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	RPN4	Q03465	531 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	APC5	Q08683	685 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	CHD1	P32657	1468 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	HOM3	P10869	527 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	MTC2	P34246	357 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
YPT53	YNL093W	BSD2	P38356	321 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	VPS4	P52917	437 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	CAB1	Q04430	367 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	IRC3	Q06683	689 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	GAL2	P13181	574 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	RAD4	P14736	754 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	VMA3	P25515	160 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	MRC1	P25588	1096 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	RSC6	P25632	483 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	PIM1	P36775	1133 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	RXT2	P38255	430 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	MGE1	P38523	228 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	YHL050C	P38721	697 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	ERP5	P38819	212 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	YHR219W	P38900	624 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	DAS1	P47005	663 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	YJL049W	P47048	450 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	YLR352W	Q06479	807 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	NYV1	Q12255	253 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	MPH2	P0CD99	609 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
YPT53	YNL093W	PEX5	P35056	612 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	SAF1	P38352	637 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	APE4	P38821	490 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	AKR1	P39010	764 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	MXR1	P40029	184 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	BUD6	P41697	788 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	PEX8	P53248	589 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	CDC45	Q08032	650 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	YOR378W	Q08902	515 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	SLX4	Q12098	748 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	MAD1	P40957	749 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	LEM3	P42838	414 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	YJL181W	P46987	611 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	TCB2	P48231	1178 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	RSC1	P53236	928 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	ERO1	Q03103	563 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	BRE4	Q07660	1125 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
YPT53	YNL093W	YOR296W	Q08748	1289 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	SLP1	Q12232	587 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	MRPL33	P20084	86 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	SRM1	P21827	482 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	BTN2	P53286	410 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	PCL8	Q08966	492 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YPT53	YNL093W	REC8	Q12188	680 aa		4.6	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 42.3 ms