RNA–Protein interactions for RNA: YKL195W

MIA40, Transcript of Mitochondrial oxidoreductase, yeast

Gene MIA40, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MIA40	YKL195W	DID4	P36108	232 aa		7.5	□□□□□ -1.21
MIA40	YKL195W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
MIA40	YKL195W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
MIA40	YKL195W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
MIA40	YKL195W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
MIA40	YKL195W	LAM4	P38800	1345 aa		7.5	□□□□□ -1.21
MIA40	YKL195W	BIO2	P32451	375 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MIA40	YKL195W	ELM1	P32801	640 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MIA40	YKL195W	YIR042C	P40586	236 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MIA40	YKL195W	IOC3	P43596	787 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MIA40	YKL195W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
MIA40	YKL195W	YPL150W	Q12152	901 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MIA40	YKL195W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
MIA40	YKL195W	CYB2	P00175	591 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MIA40	YKL195W	MIC60	P36112	540 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MIA40	YKL195W	GRX7	P38068	203 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MIA40	YKL195W	RKM3	P38222	552 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MIA40	YKL195W	RFC5	P38251	354 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MIA40	YKL195W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	7.48	□□□□□ -1.21	not detected
MIA40	YKL195W	YJL007C	P47080	104 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MIA40	YKL195W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
MIA40	YKL195W	KAR5	Q04746	504 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MIA40	YKL195W	SRF1	Q12516	437 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MIA40	YKL195W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
MIA40	YKL195W	RDS1	P25611	832 aa		7.47	□□□□□ -1.21
MIA40	YKL195W	RER2	P35196	286 aa		7.47	□□□□□ -1.21
MIA40	YKL195W	GEF1	P37020	779 aa		7.47	□□□□□ -1.21
MIA40	YKL195W	MAL33	P38157	468 aa		7.47	□□□□□ -1.21
MIA40	YKL195W	YBL086C	P38177	466 aa		7.47	□□□□□ -1.21
MIA40	YKL195W	TOS1	P38288	455 aa		7.47	□□□□□ -1.21
MIA40	YKL195W	FIG4	P42837	879 aa		7.47	□□□□□ -1.21
MIA40	YKL195W	CTH1	P47976	325 aa		7.47	□□□□□ -1.21
MIA40	YKL195W	EST2	Q06163	884 aa		7.47	□□□□□ -1.21
MIA40	YKL195W	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.21
MIA40	YKL195W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.46	□□□□□ -1.22	not detected
MIA40	YKL195W	COQ1	P18900	473 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	KRE2	P27809	442 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	MNN4	P36044	1178 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	EPL1	P43572	832 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	OPT2	Q06593	877 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	PPM2	Q08282	695 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	TAF13	P11747	167 aa		7.45	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	MDL2	P33311	773 aa		7.45	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	UGA2	P38067	497 aa		7.45	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	SPL2	P38839	148 aa		7.45	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	NUP85	P46673	744 aa		7.45	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	IRC4	Q03036	179 aa		7.45	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	YLR407W	Q06070	228 aa		7.45	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	PSF3	Q12146	194 aa		7.45	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	TRS33	Q99394	268 aa		7.45	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	MBR1	P23493	339 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	PFF1	P38244	976 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	NPR3	P38742	1146 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	YFH7	P43591	353 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	JJJ2	P46997	583 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	YNL108C	P53929	270 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	UFD2	P54860	961 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	ECM23	Q02710	187 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	UBX2	Q04228	584 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	SGD1	Q06132	899 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	TEC1	P18412	486 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	AKR1	P39010	764 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	BIM1	P40013	344 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	YLR346C	Q06139	101 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	RTS1	P38903	757 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	ACO2	P39533	789 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	ATG32	P40458	529 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	PIP2	P52960	996 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	YPR084W	Q06821	456 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	MCM2	P29469	868 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	MRPL10	P36520	322 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	AAD14	P42884	376 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	ERO1	Q03103	563 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	ARG82	P07250	355 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	GPA1	P08539	472 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	RGP1	P16664	663 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	CBP3	P21560	335 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
MIA40	YKL195W	ISF1	P32488	338 aa		7.4	□□□□□ -1.22

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