RNA–Protein interactions for RNA: YJL011C

RPC17, Transcript of RNA polymerase III subunit C17, yeast

Gene RPC17, Length 486 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC17	YJL011C	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	RRM3	P38766	723 aa		6.2	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	TYW3	P53177	273 aa		6.2	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	YMR074C	Q04773	145 aa		6.2	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	NSE3	Q05541	303 aa		6.2	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	SEA4	P38164	1038 aa		6.19	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	BOI2	P39969	1040 aa		6.19	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	FAR11	P53917	953 aa		6.19	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	RKM2	Q03942	479 aa		6.19	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	YNR014W	P53719	212 aa		6.18	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	YNR063W	P53749	607 aa		6.18	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	NSG2	P53898	299 aa		6.18	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	SPO20	Q04359	397 aa		6.18	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	6.18	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	AOS1	Q06624	347 aa		6.18	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	BDF2	Q07442	638 aa		6.18	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	GAS5	Q08193	484 aa		6.18	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	AI1	P03875	834 aa		6.17	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	INO1	P11986	533 aa		6.17	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	RAD4	P14736	754 aa		6.17	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	6.17	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	YAR028W	P39548	234 aa		6.17	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	YGR045C	P53229	120 aa		6.17	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	DSE4	P53753	1117 aa		6.17	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	6.17	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	6.17	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	THI72	Q08579	599 aa		6.17	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	6.17	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	AGP1	P25376	633 aa		6.16	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	6.16	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	6.16	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	ALG3	P38179	458 aa		6.16	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	CNN1	P43618	361 aa		6.16	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	6.16	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	YOR223W	Q12015	292 aa		6.16	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	6.16	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	YPL066W	Q12194	479 aa		6.16	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	YLL054C	Q12244	843 aa		6.16	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	6.15	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	STE5	P32917	917 aa		6.15	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	YFL066C	P43538	392 aa		6.15	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	6.15	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	6.15	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.14	□□□□□ -1.43	not detected
RPC17	YJL011C	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.14	□□□□□ -1.43	not detected
RPC17	YJL011C	ATG14	P38270	344 aa		6.14	□□□□□ -1.43
RPC17	YJL011C	MPH1	P40562	993 aa		6.14	□□□□□ -1.43
RPC17	YJL011C	NCE103	P53615	221 aa		6.14	□□□□□ -1.43
RPC17	YJL011C	AVO1	Q08236	1176 aa		6.14	□□□□□ -1.43
RPC17	YJL011C	VBA5	P36172	582 aa		6.13	□□□□□ -1.43
RPC17	YJL011C	MCM7	P38132	845 aa		6.13	□□□□□ -1.43
RPC17	YJL011C	TIM54	P47045	478 aa		6.13	□□□□□ -1.43
RPC17	YJL011C	HUL5	P53119	910 aa		6.13	□□□□□ -1.43
RPC17	YJL011C	BUD9	P53226	547 aa		6.13	□□□□□ -1.43
RPC17	YJL011C	RPN4	Q03465	531 aa		6.13	□□□□□ -1.43
RPC17	YJL011C	SHE9	Q04172	456 aa		6.13	□□□□□ -1.43
RPC17	YJL011C	TDA6	Q06466	467 aa		6.13	□□□□□ -1.43
RPC17	YJL011C	RKM4	Q12504	494 aa		6.13	□□□□□ -1.43
RPC17	YJL011C	PTC5	Q12511	572 aa		6.13	□□□□□ -1.43
RPC17	YJL011C	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.12	□□□□□ -1.43	not detected
RPC17	YJL011C	YBR184W	P38299	523 aa		6.12	□□□□□ -1.43
RPC17	YJL011C	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
RPC17	YJL011C	LAP2	Q10740	671 aa		6.12	□□□□□ -1.43
RPC17	YJL011C	CIT2	P08679	460 aa		6.11	□□□□□ -1.43
RPC17	YJL011C	MLS1	P30952	554 aa		6.11	□□□□□ -1.43
RPC17	YJL011C	SFA1	P32771	386 aa		6.11	□□□□□ -1.43
RPC17	YJL011C	YKL107W	P34251	309 aa		6.11	□□□□□ -1.43
RPC17	YJL011C	MRP8	P35719	219 aa		6.11	□□□□□ -1.43
RPC17	YJL011C	GPT2	P36148	743 aa		6.11	□□□□□ -1.43
RPC17	YJL011C	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	6.11	□□□□□ -1.43
RPC17	YJL011C	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
RPC17	YJL011C	HNT2	P49775	206 aa		6.11	□□□□□ -1.43
RPC17	YJL011C	AI3	P03877	415 aa		6.1	□□□□□ -1.43
RPC17	YJL011C	RGD1	P38339	666 aa		6.1	□□□□□ -1.43
RPC17	YJL011C	HSE1	P38753	452 aa		6.1	□□□□□ -1.43
RPC17	YJL011C	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	6.1	□□□□□ -1.43
RPC17	YJL011C	BUD6	P41697	788 aa		6.1	□□□□□ -1.43
RPC17	YJL011C	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
RPC17	YJL011C	YGL176C	P46945	554 aa		6.1	□□□□□ -1.43
RPC17	YJL011C	PFD1	P46988	109 aa		6.1	□□□□□ -1.43
RPC17	YJL011C	VPS53	P47061	822 aa		6.1	□□□□□ -1.43
RPC17	YJL011C	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
RPC17	YJL011C	FMP25	Q08023	583 aa		6.1	□□□□□ -1.43
RPC17	YJL011C	PPM2	Q08282	695 aa		6.1	□□□□□ -1.43
RPC17	YJL011C	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
RPC17	YJL011C	PRY1	P47032	299 aa		6.09	□□□□□ -1.43
RPC17	YJL011C	YDR215C	Q12240	137 aa		6.09	□□□□□ -1.43
RPC17	YJL011C	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	MBP1	P39678	833 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	GPB2	P39717	880 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	IRR1	P40541	1150 aa		6.08	□□□□□ -1.44

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