RNA–Protein interactions for RNA: YAL003W

EFB1, Transcript of Translation elongation factor 1 beta, yeast

Gene EFB1, Length 621 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EFB1	YAL003W	YNL193W	P53870	558 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EFB1	YAL003W	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EFB1	YAL003W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EFB1	YAL003W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EFB1	YAL003W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	SHC1	P39000	512 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	MRPS35	P53292	345 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	RRI2	Q12348	645 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	FIG2	P25653	1609 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	CYB2	P00175	591 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	GEF1	P37020	779 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	IRC4	Q03036	179 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	OPI1	P21957	404 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	BRN1	P38170	754 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	YIR014W	P40570	242 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	YFH7	P43591	353 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	APL6	P46682	809 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	RMD1	Q03441	430 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	PBY1	P38254	753 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	JJJ2	P46997	583 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	PIB2	P53191	635 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	YNR014W	P53719	212 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	RIM20	Q12033	661 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	YDR215C	Q12240	137 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	TOP1	P04786	769 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	MSM1	P22438	575 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	GRX7	P38068	203 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	YIR042C	P40586	236 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	IOC3	P43596	787 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	CRF1	Q04930	467 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	INM2	Q05533	292 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	SNF3	P10870	884 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	UTR2	P32623	467 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	IRC8	P47046	822 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	KAR5	Q04746	504 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	TOS4	Q06266	489 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	GAS5	Q08193	484 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	TAH18	Q12181	623 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EFB1	YAL003W	AFG2	P32794	780 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	MET1	P36150	593 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	HXT13	P39924	564 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	GSM1	P42950	618 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	HXT17	P53631	564 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	LAM4	P38800	1345 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	GSC2	P40989	1895 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	SPO22	P40511	975 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	EMP47	P43555	445 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	PIP2	P52960	996 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	ISF1	P32488	338 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	MDL2	P33311	773 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
EFB1	YAL003W	RTS1	P38903	757 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	SUM1	P46676	1062 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	YGR117C	P53270	476 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	PPM2	Q08282	695 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	MCA1	Q08601	432 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	COQ1	P18900	473 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	FPS1	P23900	669 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	IRE1	P32361	1115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
EFB1	YAL003W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	TIM50	Q02776	476 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFB1	YAL003W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63

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