RNA–Protein interactions for RNA: YML013W

UBX2, Transcript of Bridging factor involved in ER-associated protein degradation (ERAD), yeast

Gene UBX2, Length 1,755 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX2	YML013W	INH1	P01097	85 aa		6.29	□□□□□ -1.4
UBX2	YML013W	SWI3	P32591	825 aa		6.29	□□□□□ -1.4
UBX2	YML013W	PEX21	P50091	288 aa		6.29	□□□□□ -1.4
UBX2	YML013W	YGR125W	P53273	1036 aa		6.29	□□□□□ -1.4
UBX2	YML013W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
UBX2	YML013W	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
UBX2	YML013W	REC8	Q12188	680 aa		6.29	□□□□□ -1.4
UBX2	YML013W	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
UBX2	YML013W	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
UBX2	YML013W	FOB1	O13329	566 aa		6.28	□□□□□ -1.4
UBX2	YML013W	DEP1	P31385	405 aa		6.28	□□□□□ -1.4
UBX2	YML013W	LTV1	P34078	463 aa		6.28	□□□□□ -1.4
UBX2	YML013W	HLJ1	P48353	224 aa		6.28	□□□□□ -1.4
UBX2	YML013W	RRI2	Q12348	645 aa		6.28	□□□□□ -1.4
UBX2	YML013W	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		6.27	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		6.27	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		6.27	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	LTE1	P07866	1435 aa		6.27	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	CDC34	P14682	295 aa		6.27	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	GUT2	P32191	649 aa		6.27	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	YKL069W	P36088	180 aa		6.27	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	BYE1	P36106	594 aa		6.27	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	JNM1	P36224	373 aa		6.27	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	CIN4	P39110	191 aa		6.27	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	TBF1	Q02457	562 aa		6.27	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	RNT1	Q02555	471 aa		6.27	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	LCD1	Q04377	747 aa		6.27	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	TOS4	Q06266	489 aa		6.27	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	ATG13	Q06628	738 aa		6.27	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	SRF1	Q12516	437 aa		6.27	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	TEC1	P18412	486 aa		6.26	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	MSH2	P25847	964 aa		6.26	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	CWH41	P53008	833 aa		6.26	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	UBX4	P54730	416 aa		6.26	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	GYP5	Q12344	894 aa		6.26	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	APL6	P46682	809 aa		6.26	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	YGR053C	P53234	283 aa		6.26	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	RSC1	P53236	928 aa		6.26	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	TUB4	P53378	473 aa		6.26	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	BDS1	Q08347	646 aa		6.26	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	OSH2	Q12451	1283 aa		6.26	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	CCP1	P00431	361 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	CYT1	P07143	309 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	RPB10	P22139	70 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	MUM2	P38236	366 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	SLI15	P38283	698 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	HSE1	P38753	452 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	FAA3	P39002	694 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	PRY3	P47033	881 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	SPO75	Q07798	868 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	AI4	P03878	556 aa		6.24	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	CAN1	P04817	590 aa		6.24	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	SSH4	P32343	579 aa		6.24	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	PMT3	P47190	753 aa		6.24	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	CDC55	Q00362	526 aa		6.24	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	TFB2	Q02939	513 aa		6.24	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	GRX3	Q03835	250 aa		6.24	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.24	□□□□□ -1.41	not detected
UBX2	YML013W	NUP145	P49687	1317 aa		6.24	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	SNT2	P53127	1403 aa		6.24	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	GDB1	Q06625	1536 aa		6.24	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	SLX5	P32828	619 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.23	□□□□□ -1.41	not detected
UBX2	YML013W	PEA2	P40091	420 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	MRPS18	P42847	217 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	YFL034W	P43564	1073 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	TGL2	P54857	326 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	COG8	Q04632	607 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	CDC73	Q06697	393 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	SAM3	Q08986	587 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	APC11	Q12157	165 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	RTP1	Q12751	981 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	MPD2	Q99316	277 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	RAD9	P14737	1309 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	ISC10	P32645	267 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	MAP2	P38174	421 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	STR2	P47164	639 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	SPC105	P53148	917 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	YDL144C	Q07589	356 aa		6.23	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	YBR184W	P38299	523 aa		6.22	□□□□□ -1.41
UBX2	YML013W	YBR197C	P38306	217 aa		6.22	□□□□□ -1.41

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