RNA–Protein interactions for RNA: YLR349W

YLR349W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR349W, Length 507 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR349WYLR349W ALD6P54115 500 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
YLR349WYLR349W NCB2Q92317 146 aa11.02□□□□□ -0.65
YLR349WYLR349W PDC1P06169 563 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
YLR349WYLR349W RAD18P10862 487 aa11.01□□□□□ -0.65
YLR349WYLR349W YUR1P26725 428 aa11.01□□□□□ -0.65
YLR349WYLR349W SHP1P34223 423 aa11.01□□□□□ -0.65
YLR349WYLR349W YHL050CP38721 697 aa11.01□□□□□ -0.65
YLR349WYLR349W YIL092WP40497 633 aa11.01□□□□□ -0.65
YLR349WYLR349W IRC8P47046 822 aa11.01□□□□□ -0.65
YLR349WYLR349W YGL242CP53066 181 aa11.01□□□□□ -0.65
YLR349WYLR349W YGL039WP53183 348 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
YLR349WYLR349W SLD5Q03406 294 aa11.01□□□□□ -0.65
YLR349WYLR349W MSC6Q08818 692 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
YLR349WYLR349W YKR018CP36114 725 aa11□□□□□ -0.65
YLR349WYLR349W STM1P39015 273 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
YLR349WYLR349W EPS1P40557 701 aa11□□□□□ -0.65
YLR349WYLR349W LDB19Q12502 818 aa11□□□□□ -0.65
YLR349WYLR349W GEF1P37020 779 aa10.99□□□□□ -0.65
YLR349WYLR349W VID27P40157 782 aa10.99□□□□□ -0.65
YLR349WYLR349W BDP1P46678 594 aa10.99□□□□□ -0.65
YLR349WYLR349W HGH1P48362 394 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
YLR349WYLR349W IRE1P32361 1115 aa10.98□□□□□ -0.65
YLR349WYLR349W PHO88P38264 188 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
YLR349WYLR349W IOC3P43596 787 aa10.98□□□□□ -0.65
YLR349WYLR349W POL32P47110 350 aa10.98□□□□□ -0.65
YLR349WYLR349W SOL4P53315 255 aa10.98□□□□□ -0.65
YLR349WYLR349W RVB2Q12464 471 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
YLR349WYLR349W ACE2P21192 770 aa10.97□□□□□ -0.65
YLR349WYLR349W VPS29P38759 282 aa10.97□□□□□ -0.65
YLR349WYLR349W PTK2P47116 818 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
YLR349WYLR349W ALO1P54783 526 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
YLR349WYLR349W DAK1P54838 584 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
YLR349WYLR349W KAR5Q04746 504 aa10.97□□□□□ -0.65
YLR349WYLR349W HAA1Q12753 694 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
YLR349WYLR349W POX1P13711 748 aa10.96□□□□□ -0.65
YLR349WYLR349W FPR3P38911 411 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
YLR349WYLR349W FOL2P51601 243 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
YLR349WYLR349W VPS72Q03388 795 aa10.96□□□□□ -0.65
YLR349WYLR349W TMA64Q04600 565 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
YLR349WYLR349W DUS3Q06053 668 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
YLR349WYLR349W HEM1P09950 548 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
YLR349WYLR349W CAD1P24813 409 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
YLR349WYLR349W CSC1Q06538 782 aa10.95□□□□□ -0.66
YLR349WYLR349W TOR1P35169 2470 aa10.95□□□□□ -0.66
YLR349WYLR349W MOT1P32333 1867 aa10.94□□□□□ -0.66
YLR349WYLR349W NOT3P06102 836 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
YLR349WYLR349W POT1P27796 417 aaKnown RBP RIP-Chip data10.94□□□□□ -0.66not detected
YLR349WYLR349W TGL1P34163 548 aa10.94□□□□□ -0.66
YLR349WYLR349W PBY1P38254 753 aa10.94□□□□□ -0.66
YLR349WYLR349W RTS1P38903 757 aa10.94□□□□□ -0.66
YLR349WYLR349W UBP9P39967 754 aa10.94□□□□□ -0.66
YLR349WYLR349W JHD1P40034 492 aa10.94□□□□□ -0.66
YLR349WYLR349W PIB2P53191 635 aa10.94□□□□□ -0.66
YLR349WYLR349W MRD1Q06106 887 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
YLR349WYLR349W CDC45Q08032 650 aa10.94□□□□□ -0.66
YLR349WYLR349W ERP3Q12403 225 aa10.94□□□□□ -0.66
YLR349WYLR349W RTP1Q12751 981 aa10.94□□□□□ -0.66
YLR349WYLR349W RAD61Q99359 647 aa10.94□□□□□ -0.66
YLR349WYLR349W PDR18P53756 1333 aa10.93□□□□□ -0.66
YLR349WYLR349W PRO3P32263 286 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
YLR349WYLR349W VPS53P47061 822 aa10.93□□□□□ -0.66
YLR349WYLR349W YNL115CP53925 644 aa10.93□□□□□ -0.66
YLR349WYLR349W NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data10.93□□□□□ -0.66not detected
YLR349WYLR349W YMR321CQ04898 105 aa10.93□□□□□ -0.66
YLR349WYLR349W CHO2P05374 869 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
YLR349WYLR349W COQ1P18900 473 aa10.92□□□□□ -0.66
YLR349WYLR349W VPS8P39702 1274 aa10.92□□□□□ -0.66
YLR349WYLR349W RSC8P43609 557 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
YLR349WYLR349W MLC1P53141 149 aa10.92□□□□□ -0.66
YLR349WYLR349W MYO1P08964 1928 aa10.92□□□□□ -0.66
YLR349WYLR349W DBP7P36120 742 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
YLR349WYLR349W GPT2P36148 743 aa10.91□□□□□ -0.66
YLR349WYLR349W SPH1Q06160 661 aa10.91□□□□□ -0.66
YLR349WYLR349W TRM11Q12463 433 aa10.91□□□□□ -0.66
YLR349WYLR349W MCM4P30665 933 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
YLR349WYLR349W SLN1P39928 1220 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
YLR349WYLR349W SGM1P47166 707 aa10.9□□□□□ -0.66
YLR349WYLR349W ENP2P48234 707 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
YLR349WYLR349W TFC8Q12308 588 aa10.9□□□□□ -0.66
YLR349WYLR349W RKM4Q12504 494 aa10.9□□□□□ -0.66
YLR349WYLR349W TFC4P33339 1025 aa10.89□□□□□ -0.67
YLR349WYLR349W MCR1P36060 302 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
YLR349WYLR349W FLR1P38124 548 aa10.89□□□□□ -0.67
YLR349WYLR349W MCM6P53091 1017 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
YLR349WYLR349W FAB1P34756 2278 aa10.89□□□□□ -0.67
YLR349WYLR349W LAM4P38800 1345 aa10.88□□□□□ -0.67
YLR349WYLR349W TKL1P23254 680 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
YLR349WYLR349W MRPL32P25348 183 aa10.88□□□□□ -0.67
YLR349WYLR349W ECM21P38167 1117 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
YLR349WYLR349W SUE1Q06524 206 aa10.88□□□□□ -0.67
YLR349WYLR349W REG2P38232 338 aa10.87□□□□□ -0.67
YLR349WYLR349W RRP8P38961 392 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
YLR349WYLR349W YCK3P39962 524 aa10.87□□□□□ -0.67
YLR349WYLR349W BBC1P47068 1157 aa10.87□□□□□ -0.67
YLR349WYLR349W CTR1P49573 406 aa10.87□□□□□ -0.67
YLR349WYLR349W YNR014WP53719 212 aa10.87□□□□□ -0.67
YLR349WYLR349W PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
YLR349WYLR349W MAS2P11914 482 aa10.86□□□□□ -0.67
YLR349WYLR349W NMD2P38798 1089 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
YLR349WYLR349W UTP4Q06679 776 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.1 ms