RNA–Protein interactions for RNA: YHR160C

PEX18, Transcript of Peroxin, yeast

Gene PEX18, Length 852 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEX18	YHR160C	YOR223W	Q12015	292 aa		5.91	□□□□□ -1.46
PEX18	YHR160C	GPT2	P36148	743 aa		5.9	□□□□□ -1.46
PEX18	YHR160C	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
PEX18	YHR160C	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
PEX18	YHR160C	YCS4	Q06156	1176 aa		5.9	□□□□□ -1.46
PEX18	YHR160C	MED7	Q08278	222 aa		5.9	□□□□□ -1.46
PEX18	YHR160C	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
PEX18	YHR160C	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		5.89	□□□□□ -1.47
PEX18	YHR160C	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		5.89	□□□□□ -1.47
PEX18	YHR160C	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		5.89	□□□□□ -1.47
PEX18	YHR160C	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		5.89	□□□□□ -1.47
PEX18	YHR160C	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		5.89	□□□□□ -1.47
PEX18	YHR160C	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		5.89	□□□□□ -1.47
PEX18	YHR160C	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		5.89	□□□□□ -1.47
PEX18	YHR160C	UGA4	P32837	571 aa		5.89	□□□□□ -1.47
PEX18	YHR160C	PPX1	P38698	397 aa		5.89	□□□□□ -1.47
PEX18	YHR160C	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
PEX18	YHR160C	IPL1	P38991	367 aa		5.89	□□□□□ -1.47
PEX18	YHR160C	THI12	P42883	340 aa		5.89	□□□□□ -1.47
PEX18	YHR160C	THI5	P43534	340 aa		5.89	□□□□□ -1.47
PEX18	YHR160C	THI11	P47183	340 aa		5.89	□□□□□ -1.47
PEX18	YHR160C	MEC3	Q02574	474 aa		5.89	□□□□□ -1.47
PEX18	YHR160C	TOS4	Q06266	489 aa		5.89	□□□□□ -1.47
PEX18	YHR160C	THI13	Q07748	340 aa		5.89	□□□□□ -1.47
PEX18	YHR160C	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		5.89	□□□□□ -1.47
PEX18	YHR160C	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
PEX18	YHR160C	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
PEX18	YHR160C	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
PEX18	YHR160C	DAK2	P43550	591 aa		5.88	□□□□□ -1.47
PEX18	YHR160C	CYC7	P00045	113 aa		5.87	□□□□□ -1.47
PEX18	YHR160C	TOS1	P38288	455 aa		5.87	□□□□□ -1.47
PEX18	YHR160C	SPO74	P45819	413 aa		5.87	□□□□□ -1.47
PEX18	YHR160C	YLL054C	Q12244	843 aa		5.87	□□□□□ -1.47
PEX18	YHR160C	EXO5	P38289	585 aa		5.86	□□□□□ -1.47
PEX18	YHR160C	CTH1	P47976	325 aa		5.86	□□□□□ -1.47
PEX18	YHR160C	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
PEX18	YHR160C	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
PEX18	YHR160C	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
PEX18	YHR160C	VPS35	P34110	944 aa		5.85	□□□□□ -1.47
PEX18	YHR160C	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
PEX18	YHR160C	SLS1	P42900	643 aa		5.85	□□□□□ -1.47
PEX18	YHR160C	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
PEX18	YHR160C	DAL4	Q04895	635 aa		5.85	□□□□□ -1.47
PEX18	YHR160C	LIP5	P32875	414 aa		5.84	□□□□□ -1.47
PEX18	YHR160C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
PEX18	YHR160C	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.83	□□□□□ -1.48	not detected
PEX18	YHR160C	YKL077W	P36081	392 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PEX18	YHR160C	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
PEX18	YHR160C	MMM1	P41800	426 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PEX18	YHR160C	YGR045C	P53229	120 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PEX18	YHR160C	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
PEX18	YHR160C	SDH1	Q00711	640 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PEX18	YHR160C	BRE4	Q07660	1125 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PEX18	YHR160C	MSH3	P25336	1018 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PEX18	YHR160C	SEC20	P28791	383 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PEX18	YHR160C	SEA4	P38164	1038 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PEX18	YHR160C	NEM1	P38757	446 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PEX18	YHR160C	PEX13	P80667	386 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PEX18	YHR160C	ULP1	Q02724	621 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PEX18	YHR160C	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
PEX18	YHR160C	EAR1	Q03212	550 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PEX18	YHR160C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
PEX18	YHR160C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
PEX18	YHR160C	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
PEX18	YHR160C	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
PEX18	YHR160C	SHU2	P38957	223 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PEX18	YHR160C	FAA3	P39002	694 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PEX18	YHR160C	RSM26	P47141	266 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PEX18	YHR160C	AVO1	Q08236	1176 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PEX18	YHR160C	OXR1	Q08952	273 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PEX18	YHR160C	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
PEX18	YHR160C	CIT3	P43635	486 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PEX18	YHR160C	ALT1	P52893	592 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PEX18	YHR160C	YML020W	Q03722	664 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PEX18	YHR160C	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
PEX18	YHR160C	NFS1	P25374	497 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PEX18	YHR160C	RCM1	P53972	490 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PEX18	YHR160C	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
PEX18	YHR160C	SQT1	P35184	431 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PEX18	YHR160C	PEX28	P38848	579 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PEX18	YHR160C	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PEX18	YHR160C	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PEX18	YHR160C	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PEX18	YHR160C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PEX18	YHR160C	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PEX18	YHR160C	YPL109C	Q02981	657 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PEX18	YHR160C	ADI1	Q03677	179 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PEX18	YHR160C	SLD2	P34252	453 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PEX18	YHR160C	NNK1	P36003	928 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PEX18	YHR160C	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PEX18	YHR160C	YAR028W	P39548	234 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PEX18	YHR160C	XKS1	P42826	600 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PEX18	YHR160C	YNR063W	P53749	607 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PEX18	YHR160C	PIC2	P40035	300 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PEX18	YHR160C	YGL140C	P53120	1219 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PEX18	YHR160C	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PEX18	YHR160C	YVC1	Q12324	675 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PEX18	YHR160C	ATE1	P16639	503 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PEX18	YHR160C	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
PEX18	YHR160C	RDH54	P38086	958 aa		5.73	□□□□□ -1.49

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