RNA–Protein interactions for RNA: 15S_rRNA

15S_rRNA, Transcript of Ribosomal RNA of the small mitochondrial ribosomal subunit, yeastyeast

Gene 15S_rRNA, Length 1,649 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
15S_rRNA15S_rRNA HTS1P07263 546 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
15S_rRNA15S_rRNA SEC20P28791 383 aa4.91□□□□□ -1.62
15S_rRNA15S_rRNA WHI3P34761 661 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
15S_rRNA15S_rRNA MMM1P41800 426 aa4.91□□□□□ -1.62
15S_rRNA15S_rRNA ECL1P48235 211 aa4.91□□□□□ -1.62
15S_rRNA15S_rRNA MSH6Q03834 1242 aa4.91□□□□□ -1.62
15S_rRNA15S_rRNA YHL050CP38721 697 aa4.9□□□□□ -1.62
15S_rRNA15S_rRNA YHR219WP38900 624 aa4.9□□□□□ -1.62
15S_rRNA15S_rRNA SEN54Q02825 467 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
15S_rRNA15S_rRNA GPI13Q07830 1017 aa4.9□□□□□ -1.62
15S_rRNA15S_rRNA YIG1Q08956 461 aa4.9□□□□□ -1.62
15S_rRNA15S_rRNA FLP1P03870 423 aa4.9□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA PPX1P38698 397 aa4.9□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA NIT1P40447 199 aa4.9□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA DOT1Q04089 582 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA BSC2Q05611 235 aa4.9□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA NUT2Q06213 157 aa4.9□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA MSC6Q08818 692 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA FRT1Q99332 602 aa4.9□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA YKL222CP35995 705 aa4.89□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA ECM2P38241 364 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA YHL008CP38750 627 aa4.89□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA CDC55Q00362 526 aa4.89□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA GAS1P22146 559 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA SAP155P43612 1002 aa4.88□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA CIT3P43635 486 aa4.88□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA GCV1P48015 400 aa4.88□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA ALG6Q12001 544 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA RCM1P53972 490 aa4.87□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA NSI1Q12457 570 aa4.87□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA YCR015CP25616 317 aa4.86□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA NUT1P53114 1132 aa4.86□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA UTP22P53254 1237 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA INP54Q08227 384 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA TY1A-LR4P0C2I8 440 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA TY1A-DR6P0CX70 440 aa4.86□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA TY1A-ER1P0CX71 440 aa4.86□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA TY1A-LR2P0CX72 440 aa4.86□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA TY1A-PLP0CX73 440 aa4.86□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA TY1A-JR1P0CX74 440 aa4.86□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA TY1A-LR3P0CX75 440 aa4.86□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA TY1A-ML2P0CX76 440 aa4.86□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA HSP78P33416 811 aa4.86□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA PRP43P53131 767 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA YAF9P53930 226 aa4.86□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA MEC3Q02574 474 aa4.86□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA TY1A-GR1Q12085 440 aa4.86□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA TY1A-PR3Q6Q5H1 440 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA TY1A-OLQ92392 440 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA IPL1P38991 367 aa4.85□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA MON1P53129 644 aa4.85□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA EAR1Q03212 550 aa4.85□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA HEM3P28789 327 aa4.84□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA REI1P38344 393 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA MSH4P40965 878 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA ESC8Q08119 714 aa4.84□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA YLL054CQ12244 843 aa4.84□□□□□ -1.63
15S_rRNA15S_rRNA TAF1P46677 1066 aa4.83□□□□□ -1.64
15S_rRNA15S_rRNA SAM37P50110 327 aa4.83□□□□□ -1.64
15S_rRNA15S_rRNA PMT7Q06644 662 aa4.83□□□□□ -1.64
15S_rRNA15S_rRNA YOR059CQ08448 450 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
15S_rRNA15S_rRNA RPS4AP0CX35 261 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
15S_rRNA15S_rRNA RPS4BP0CX36 261 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
15S_rRNA15S_rRNA OYE3P41816 400 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
15S_rRNA15S_rRNA WHI5Q12416 295 aa4.83□□□□□ -1.64
15S_rRNA15S_rRNA MCM5P29496 775 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
15S_rRNA15S_rRNA GCD6P32501 712 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
15S_rRNA15S_rRNA THI12P42883 340 aa4.82□□□□□ -1.64
15S_rRNA15S_rRNA THI5P43534 340 aa4.82□□□□□ -1.64
15S_rRNA15S_rRNA THI11P47183 340 aa4.82□□□□□ -1.64
15S_rRNA15S_rRNA ALT1P52893 592 aa4.82□□□□□ -1.64
15S_rRNA15S_rRNA YGR045CP53229 120 aa4.82□□□□□ -1.64
15S_rRNA15S_rRNA CDA2Q06703 312 aa4.82□□□□□ -1.64
15S_rRNA15S_rRNA THI13Q07748 340 aa4.82□□□□□ -1.64
15S_rRNA15S_rRNA MET4P32389 672 aa4.81□□□□□ -1.64
15S_rRNA15S_rRNA TSA1P34760 196 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
15S_rRNA15S_rRNA EXO5P38289 585 aa4.81□□□□□ -1.64
15S_rRNA15S_rRNA CIC1P38779 376 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
15S_rRNA15S_rRNA ELA1P53861 379 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
15S_rRNA15S_rRNA NOC3Q07896 663 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
15S_rRNA15S_rRNA ADP1P25371 1049 aa4.8□□□□□ -1.64
15S_rRNA15S_rRNA ASF1P32447 279 aa4.8□□□□□ -1.64
15S_rRNA15S_rRNA SLS1P42900 643 aa4.8□□□□□ -1.64
15S_rRNA15S_rRNA PHO4P07270 312 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
15S_rRNA15S_rRNA VPS35P34110 944 aa4.79□□□□□ -1.64
15S_rRNA15S_rRNA THI80P35202 319 aa4.79□□□□□ -1.64
15S_rRNA15S_rRNA RVS167P39743 482 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
15S_rRNA15S_rRNA SSY1Q03770 852 aa4.79□□□□□ -1.64
15S_rRNA15S_rRNA NFS1P25374 497 aa4.79□□□□□ -1.64
15S_rRNA15S_rRNA NEM1P38757 446 aa4.79□□□□□ -1.64
15S_rRNA15S_rRNA GIP4P39732 760 aa4.79□□□□□ -1.64
15S_rRNA15S_rRNA UGA4P32837 571 aa4.78□□□□□ -1.64
15S_rRNA15S_rRNA YVC1Q12324 675 aa4.78□□□□□ -1.64
15S_rRNA15S_rRNA SMY2P32909 740 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
15S_rRNA15S_rRNA ARL1P38116 183 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
15S_rRNA15S_rRNA POL32P47110 350 aa4.77□□□□□ -1.65
15S_rRNA15S_rRNA TRE1Q08919 783 aa4.77□□□□□ -1.65
15S_rRNA15S_rRNA MGE1P38523 228 aa4.76□□□□□ -1.65
15S_rRNA15S_rRNA PEX7P39108 375 aa4.76□□□□□ -1.65
15S_rRNA15S_rRNA YCS4Q06156 1176 aa4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 32.2 ms