RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000108593.7

Ctdnep1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdnep1, Length 1,627 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cadps2Q8BYR5 1297 aa41,63■■■■■ 4,26
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gimap6Q8K349 305 aa41,63■■■■■ 4,26
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa41,63■■■■■ 4,25
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Znf526Q8BI66 675 aa41,62■■■■■ 4,25
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ncoa4Q5U4H9 625 aa41,58■■■■■ 4,25
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Col16a1Q8BLX7 1580 aa41,57■■■■■ 4,25
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Marf1Q8BJ34 1730 aaKnown RBP41,56■■■■■ 4,24
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Bcl2l12Q9D3J3 255 aa41,55■■■■■ 4,24
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP41,53■■■■■ 4,24
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fam135bQ9DAI6 1403 aa41,52■■■■■ 4,24
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zmym3Q9JLM4 1370 aa41,51■■■■■ 4,24
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dennd6aQ8BH65 605 aa41,51■■■■■ 4,24
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 CemipQ8BI06 1361 aa41,5■■■■■ 4,23
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cdk12Q14AX6 1484 aaKnown RBP41,49■■■■■ 4,23
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Nlgn1Q99K10 843 aa41,48■■■■■ 4,23
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Kif7B7ZNG0 1348 aa41,48■■■■■ 4,23
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 IbtkQ6ZPR6 1352 aaKnown RBP41,48■■■■■ 4,23
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ncapd2Q8K2Z4 1392 aa41,48■■■■■ 4,23
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm21190A0A0G2JGJ6 266 aa41,47■■■■■ 4,23
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dzip1Q8BMD2 852 aa41,47■■■■■ 4,23
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Abca15E9PWH4 1668 aa41,47■■■■■ 4,23
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP41,46■■■■■ 4,23
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 PaskQ8CEE6 1383 aa41,44■■■■■ 4,22
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP41,44■■■■■ 4,22
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Nyap1Q6PFX7 833 aa41,44■■■■■ 4,22
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Smim5Q8BT42 78 aa41,4■■■■■ 4,22
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Bcl9lQ67FY2 1494 aa41,39■■■■■ 4,22
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 ZgpatQ8VDM1 511 aa41,38■■■■■ 4,21
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Acsbg1Q99PU5 721 aa41,37■■■■■ 4,21
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Hoxb7P09024 217 aa41,36■■■■■ 4,21
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP41,36■■■■■ 4,21
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cabp4Q8VHC5 271 aa41,36■■■■■ 4,21
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Kcnh5Q920E3 988 aa41,36■■■■■ 4,21
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tet3Q8BG87 1668 aa41,35■■■■■ 4,21
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mdc1Q5PSV9 1707 aa41,35■■■■■ 4,21
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Lrrc59Q922Q8 307 aaKnown RBP41,34■■■■■ 4,21
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ano8Q6PB70 1060 aa41,33■■■■■ 4,21
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ggt6Q6PDE7 497 aa41,33■■■■■ 4,21
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 HdgfP51859 237 aaKnown RBP41,32■■■■■ 4,2
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Nckap5lQ6GQX2 1323 aa41,31■■■■■ 4,2
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Sall2Q9QX96 1004 aa41,31■■■■■ 4,2
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ubr1O70481 1757 aa41,31■■■■■ 4,2
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Nid2O88322 1403 aa41,29■■■■■ 4,2
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cdhr2E9Q7P9 1308 aa41,29■■■■■ 4,2
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Birc3O08863 600 aa41,28■■■■■ 4,2
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Sema6bO54951 886 aa41,28■■■■■ 4,2
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cntnap1O54991 1385 aa41,26■■■■■ 4,2
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP41,26■■■■■ 4,19
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slit2Q9R1B9 1521 aa41,24■■■■■ 4,19
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Siglec1Q62230 1695 aa41,24■■■■■ 4,19
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP41,23■■■■■ 4,19
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm21698A0A087WQP8 267 aa41,22■■■■■ 4,19
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm21671G3UY31 267 aa41,22■■■■■ 4,19
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Nfat5Q9WV30 1534 aa41,22■■■■■ 4,19
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Scn7aB1AYL1 1681 aa41,22■■■■■ 4,19
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tex14Q7M6U3 1450 aa41,22■■■■■ 4,19
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Nhsl1Q8CAF4 1587 aa41,21■■■■■ 4,19
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fmnl2A2APV2 1086 aa41,2■■■■■ 4,19
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fnbp4Q6ZQ03 1031 aa41,2■■■■■ 4,19
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Txnrd1Q9JMH6 613 aa41,2■■■■■ 4,19
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 FancaQ9JL70 1439 aa41,19■■■■■ 4,19
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 TatQ8QZR1 454 aa41,19■■■■■ 4,18
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dnajc10Q9DC23 793 aa41,18■■■■■ 4,18
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 TnrQ8BYI9 1358 aa41,16■■■■■ 4,18
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Card10P58660 1021 aa41,16■■■■■ 4,18
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa41,16■■■■■ 4,18
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Map2P20357 1828 aa41,16■■■■■ 4,18
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 PtprvP70289 1705 aa41,15■■■■■ 4,18
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 MypopQ8R4U1 393 aa41,15■■■■■ 4,18
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP41,15■■■■■ 4,18
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Emilin2Q8K482 1074 aa41,14■■■■■ 4,18
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa41,14■■■■■ 4,18
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rad17Q6NXW6 688 aa41,13■■■■■ 4,17
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cypt2Q6P924 180 aa41,12■■■■■ 4,17
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rtl5Q5DTT4 599 aa41,08■■■■■ 4,17
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Robo1O89026 1612 aa41,08■■■■■ 4,17
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Amotl2Q8K371 772 aa41,07■■■■■ 4,17
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Lrp6O88572 1613 aa41,07■■■■■ 4,16
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Trim28Q62318 834 aa41,05■■■■■ 4,16
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slx1bQ8BX32 270 aa41,04■■■■■ 4,16
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Hoxc9P09633 260 aa41,02■■■■■ 4,16
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Nol11Q8BJW5 723 aaKnown RBP41,02■■■■■ 4,16
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pard3Q99NH2 1333 aa40,99■■■■■ 4,15
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tmem132eQ6IEE6 982 aa40,99■■■■■ 4,15
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ppp1r15aP17564 657 aa40,96■■■■■ 4,15
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa40,95■■■■■ 4,15
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Nlrp6Q91WS2 869 aa40,93■■■■■ 4,14
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP40,92■■■■■ 4,14
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 P2rx7Q9Z1M0 595 aa40,92■■■■■ 4,14
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Exoc6Q8R313 802 aa40,91■■■■■ 4,14
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 InhbeO08717 350 aa40,89■■■■■ 4,14
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fbln2P37889 1221 aa40,89■■■■■ 4,14
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa40,87■■■■■ 4,13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ccne1Q61457 408 aa40,86■■■■■ 4,13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP40,85■■■■■ 4,13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Uhrf1bp1lA2RSJ4 1457 aa40,85■■■■■ 4,13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ptpn23Q6PB44 1692 aa40,85■■■■■ 4,13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zeb2Q9R0G7 1215 aa40,84■■■■■ 4,13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Psrc1Q9D0P7 329 aa40,83■■■■■ 4,13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Eif4a2P10630 407 aa40,82■■■■■ 4,13
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 48,7 ms