Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYI9

Tnr, Tenascin-R, mousemouse

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnrQ8BYI9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC52,61■■■■■ 6,01
TnrQ8BYI9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC48,83■■■■■ 5,41
TnrQ8BYI9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,99■■■■■ 5,27
TnrQ8BYI9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC45,81■■■■■ 4,92
TnrQ8BYI9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC45,7■■■■■ 4,91
TnrQ8BYI9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC44,69■■■■■ 4,75
TnrQ8BYI9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,44■■■■■ 4,71
TnrQ8BYI9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,34■■■■■ 4,69
TnrQ8BYI9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC44,13■■■■■ 4,65
TnrQ8BYI9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC43,87■■■■■ 4,61
TnrQ8BYI9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,73■■■■■ 4,59
TnrQ8BYI9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,29■■■■■ 4,52
TnrQ8BYI9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC42,75■■■■■ 4,43
TnrQ8BYI9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,73■■■■■ 4,43
TnrQ8BYI9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,59■■■■■ 4,41
TnrQ8BYI9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC42,44■■■■■ 4,38
TnrQ8BYI9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42,32■■■■■ 4,37
TnrQ8BYI9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,25■■■■■ 4,35
TnrQ8BYI9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC42,14■■■■■ 4,34
TnrQ8BYI9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,89■■■■■ 4,3
TnrQ8BYI9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,83■■■■■ 4,29
TnrQ8BYI9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,79■■■■■ 4,28
TnrQ8BYI9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,71■■■■■ 4,27
TnrQ8BYI9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,68■■■■■ 4,26
TnrQ8BYI9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC41,63■■■■■ 4,25
TnrQ8BYI9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC41,59■■■■■ 4,25
TnrQ8BYI9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC41,44■■■■■ 4,22
TnrQ8BYI9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,41■■■■■ 4,22
TnrQ8BYI9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,35■■■■■ 4,21
TnrQ8BYI9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,16■■■■■ 4,18
TnrQ8BYI9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41,01■■■■■ 4,16
TnrQ8BYI9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4,15
TnrQ8BYI9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40,84■■■■■ 4,13
TnrQ8BYI9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC40,75■■■■■ 4,11
TnrQ8BYI9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC40,59■■■■■ 4,09
TnrQ8BYI9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,42■■■■■ 4,06
TnrQ8BYI9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC40,38■■■■■ 4,06
TnrQ8BYI9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,38■■■■■ 4,05
TnrQ8BYI9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC40,26■■■■■ 4,04
TnrQ8BYI9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,21■■■■■ 4,03
TnrQ8BYI9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,16■■■■■ 4,02
TnrQ8BYI9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,06■■■■■ 4
TnrQ8BYI9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC39,97■■■■□ 3,99
TnrQ8BYI9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC39,96■■■■□ 3,99
TnrQ8BYI9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC39,86■■■■□ 3,97
TnrQ8BYI9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC39,78■■■■□ 3,96
TnrQ8BYI9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,69■■■■□ 3,94
TnrQ8BYI9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,58■■■■□ 3,93
TnrQ8BYI9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39,58■■■■□ 3,93
TnrQ8BYI9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC39,45■■■■□ 3,91
TnrQ8BYI9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC39,45■■■■□ 3,91
TnrQ8BYI9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC39,34■■■■□ 3,89
TnrQ8BYI9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,31■■■■□ 3,88
TnrQ8BYI9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC39,3■■■■□ 3,88
TnrQ8BYI9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,26■■■■□ 3,88
TnrQ8BYI9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,21■■■■□ 3,87
TnrQ8BYI9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC39,13■■■■□ 3,85
TnrQ8BYI9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC39,11■■■■□ 3,85
TnrQ8BYI9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC39,08■■■■□ 3,85
TnrQ8BYI9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC39,05■■■■□ 3,84
TnrQ8BYI9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39,02■■■■□ 3,84
TnrQ8BYI9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC39■■■■□ 3,83
TnrQ8BYI9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC38,9■■■■□ 3,82
TnrQ8BYI9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC38,9■■■■□ 3,82
TnrQ8BYI9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,88■■■■□ 3,81
TnrQ8BYI9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC38,86■■■■□ 3,81
TnrQ8BYI9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC38,81■■■■□ 3,8
TnrQ8BYI9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38,8■■■■□ 3,8
TnrQ8BYI9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,76■■■■□ 3,8
TnrQ8BYI9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,74■■■■□ 3,79
TnrQ8BYI9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,68■■■■□ 3,78
TnrQ8BYI9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC38,66■■■■□ 3,78
TnrQ8BYI9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,63■■■■□ 3,78
TnrQ8BYI9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,62■■■■□ 3,77
TnrQ8BYI9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,57■■■■□ 3,77
TnrQ8BYI9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC38,55■■■■□ 3,76
TnrQ8BYI9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38,54■■■■□ 3,76
TnrQ8BYI9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,51■■■■□ 3,75
TnrQ8BYI9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,39■■■■□ 3,74
TnrQ8BYI9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,33■■■■□ 3,73
TnrQ8BYI9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC38,26■■■■□ 3,72
TnrQ8BYI9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC38,25■■■■□ 3,71
TnrQ8BYI9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC38,21■■■■□ 3,71
TnrQ8BYI9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,2■■■■□ 3,71
TnrQ8BYI9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,2■■■■□ 3,71
TnrQ8BYI9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC38,17■■■■□ 3,7
TnrQ8BYI9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,15■■■■□ 3,7
TnrQ8BYI9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38,13■■■■□ 3,69
TnrQ8BYI9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,13■■■■□ 3,69
TnrQ8BYI9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC37,99■■■■□ 3,67
TnrQ8BYI9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC37,98■■■■□ 3,67
TnrQ8BYI9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37,91■■■■□ 3,66
TnrQ8BYI9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,89■■■■□ 3,66
TnrQ8BYI9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,87■■■■□ 3,65
TnrQ8BYI9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC37,86■■■■□ 3,65
TnrQ8BYI9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,83■■■■□ 3,65
TnrQ8BYI9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC37,74■■■■□ 3,63
TnrQ8BYI9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC37,74■■■■□ 3,63
TnrQ8BYI9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,73■■■■□ 3,63
TnrQ8BYI9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,72■■■■□ 3,63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22,3 ms