Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC51,95■■■■■ 5,91
Hoxc9P09633 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC48,13■■■■■ 5,3
Hoxc9P09633 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,37■■■■■ 5,17
Hoxc9P09633 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC45,22■■■■■ 4,83
Hoxc9P09633 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC45,15■■■■■ 4,82
Hoxc9P09633 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC44,26■■■■■ 4,68
Hoxc9P09633 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,88■■■■■ 4,62
Hoxc9P09633 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,88■■■■■ 4,61
Hoxc9P09633 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,65■■■■■ 4,58
Hoxc9P09633 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC43,54■■■■■ 4,56
Hoxc9P09633 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC43,32■■■■■ 4,53
Hoxc9P09633 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,14■■■■■ 4,5
Hoxc9P09633 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4,47
Hoxc9P09633 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,26■■■■■ 4,35
Hoxc9P09633 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,22■■■■■ 4,35
Hoxc9P09633 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC42,13■■■■■ 4,33
Hoxc9P09633 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC41,84■■■■■ 4,29
Hoxc9P09633 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC41,76■■■■■ 4,28
Hoxc9P09633 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41,65■■■■■ 4,26
Hoxc9P09633 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,54■■■■■ 4,24
Hoxc9P09633 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,53■■■■■ 4,24
Hoxc9P09633 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,5■■■■■ 4,23
Hoxc9P09633 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC41,44■■■■■ 4,22
Hoxc9P09633 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,32■■■■■ 4,2
Hoxc9P09633 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,26■■■■■ 4,2
Hoxc9P09633 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,16■■■■■ 4,18
Hoxc9P09633 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC41,1■■■■■ 4,17
Hoxc9P09633 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,1■■■■■ 4,17
Hoxc9P09633 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,02■■■■■ 4,16
Hoxc9P09633 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC41■■■■■ 4,15
Hoxc9P09633 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,95■■■■■ 4,15
Hoxc9P09633 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40,91■■■■■ 4,14
Hoxc9P09633 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC40,67■■■■■ 4,1
Hoxc9P09633 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,57■■■■■ 4,09
Hoxc9P09633 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,41■■■■■ 4,06
Hoxc9P09633 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40,24■■■■■ 4,03
Hoxc9P09633 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,16■■■■■ 4,02
Hoxc9P09633 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40,05■■■■■ 4
Hoxc9P09633 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC39,96■■■■□ 3,99
Hoxc9P09633 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC39,93■■■■□ 3,98
Hoxc9P09633 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,88■■■■□ 3,97
Hoxc9P09633 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC39,79■■■■□ 3,96
Hoxc9P09633 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,77■■■■□ 3,96
Hoxc9P09633 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC39,73■■■■□ 3,95
Hoxc9P09633 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC39,61■■■■□ 3,93
Hoxc9P09633 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,48■■■■□ 3,91
Hoxc9P09633 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC39,43■■■■□ 3,9
Hoxc9P09633 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,38■■■■□ 3,9
Hoxc9P09633 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC39,36■■■■□ 3,89
Hoxc9P09633 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,09■■■■□ 3,85
Hoxc9P09633 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,08■■■■□ 3,85
Hoxc9P09633 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC39,03■■■■□ 3,84
Hoxc9P09633 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,01■■■■□ 3,83
Hoxc9P09633 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC38,98■■■■□ 3,83
Hoxc9P09633 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,95■■■■□ 3,83
Hoxc9P09633 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC38,9■■■■□ 3,82
Hoxc9P09633 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC38,87■■■■□ 3,81
Hoxc9P09633 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC38,83■■■■□ 3,81
Hoxc9P09633 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,8■■■■□ 3,8
Hoxc9P09633 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC38,78■■■■□ 3,8
Hoxc9P09633 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,7■■■■□ 3,79
Hoxc9P09633 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC38,67■■■■□ 3,78
Hoxc9P09633 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC38,63■■■■□ 3,77
Hoxc9P09633 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,61■■■■□ 3,77
Hoxc9P09633 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC38,57■■■■□ 3,76
Hoxc9P09633 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC38,56■■■■□ 3,76
Hoxc9P09633 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,54■■■■□ 3,76
Hoxc9P09633 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38,53■■■■□ 3,76
Hoxc9P09633 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38,46■■■■□ 3,75
Hoxc9P09633 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC38,45■■■■□ 3,75
Hoxc9P09633 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,43■■■■□ 3,74
Hoxc9P09633 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC38,41■■■■□ 3,74
Hoxc9P09633 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC38,31■■■■□ 3,72
Hoxc9P09633 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,29■■■■□ 3,72
Hoxc9P09633 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC38,27■■■■□ 3,72
Hoxc9P09633 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,27■■■■□ 3,72
Hoxc9P09633 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC38,25■■■■□ 3,71
Hoxc9P09633 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,23■■■■□ 3,71
Hoxc9P09633 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,23■■■■□ 3,71
Hoxc9P09633 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,12■■■■□ 3,69
Hoxc9P09633 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38,11■■■■□ 3,69
Hoxc9P09633 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,06■■■■□ 3,68
Hoxc9P09633 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38,05■■■■□ 3,68
Hoxc9P09633 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC38,04■■■■□ 3,68
Hoxc9P09633 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,03■■■■□ 3,68
Hoxc9P09633 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC37,95■■■■□ 3,67
Hoxc9P09633 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,95■■■■□ 3,67
Hoxc9P09633 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,93■■■■□ 3,66
Hoxc9P09633 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,93■■■■□ 3,66
Hoxc9P09633 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,89■■■■□ 3,66
Hoxc9P09633 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,85■■■■□ 3,65
Hoxc9P09633 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37,79■■■■□ 3,64
Hoxc9P09633 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,78■■■■□ 3,64
Hoxc9P09633 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC37,71■■■■□ 3,63
Hoxc9P09633 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC37,68■■■■□ 3,62
Hoxc9P09633 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC37,67■■■■□ 3,62
Hoxc9P09633 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,65■■■■□ 3,62
Hoxc9P09633 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC37,64■■■■□ 3,62
Hoxc9P09633 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37,62■■■■□ 3,61
Hoxc9P09633 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,57■■■■□ 3,6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,5 ms