Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC52,24■■■■■ 5,95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC48,55■■■■■ 5,36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,71■■■■■ 5,23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC45,53■■■■■ 4,88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC45,21■■■■■ 4,83
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,34■■■■■ 4,69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC44,17■■■■■ 4,66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,13■■■■■ 4,65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,96■■■■■ 4,63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC43,91■■■■■ 4,62
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC43,54■■■■■ 4,56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,51■■■■■ 4,56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,41■■■■■ 4,54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,78■■■■■ 4,44
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC42,59■■■■■ 4,41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC42,23■■■■■ 4,35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42,18■■■■■ 4,34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,16■■■■■ 4,34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,12■■■■■ 4,33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,86■■■■■ 4,29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,79■■■■■ 4,28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC41,74■■■■■ 4,27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC41,58■■■■■ 4,25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,54■■■■■ 4,24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,42■■■■■ 4,22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,4■■■■■ 4,22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC41,37■■■■■ 4,21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC41,36■■■■■ 4,21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,23■■■■■ 4,19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,02■■■■■ 4,16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40,97■■■■■ 4,15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,85■■■■■ 4,13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,85■■■■■ 4,13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40,8■■■■■ 4,12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,76■■■■■ 4,12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC40,73■■■■■ 4,11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40,57■■■■■ 4,08
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,43■■■■■ 4,06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC40,39■■■■■ 4,06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,16■■■■■ 4,02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC40,04■■■■■ 4
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC39,98■■■■□ 3,99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC39,93■■■■□ 3,98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC39,81■■■■□ 3,96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,78■■■■□ 3,96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,61■■■■□ 3,93
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,56■■■■□ 3,92
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC39,56■■■■□ 3,92
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,5■■■■□ 3,91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC39,49■■■■□ 3,91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC39,33■■■■□ 3,89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,33■■■■□ 3,89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,29■■■■□ 3,88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,28■■■■□ 3,88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC39,19■■■■□ 3,86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,19■■■■□ 3,86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC39,15■■■■□ 3,86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,13■■■■□ 3,85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC39,11■■■■□ 3,85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC39,03■■■■□ 3,84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC39,01■■■■□ 3,84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC38,98■■■■□ 3,83
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38,86■■■■□ 3,81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,84■■■■□ 3,81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC38,83■■■■□ 3,81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC38,79■■■■□ 3,8
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,76■■■■□ 3,8
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC38,76■■■■□ 3,8
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38,73■■■■□ 3,79
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,73■■■■□ 3,79
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC38,71■■■■□ 3,79
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC38,65■■■■□ 3,78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC38,64■■■■□ 3,78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,61■■■■□ 3,77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC38,52■■■■□ 3,76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,51■■■■□ 3,76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38,39■■■■□ 3,74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,35■■■■□ 3,73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,3■■■■□ 3,72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC38,29■■■■□ 3,72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,23■■■■□ 3,71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,17■■■■□ 3,7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC38,17■■■■□ 3,7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,16■■■■□ 3,7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,08■■■■□ 3,69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38,07■■■■□ 3,68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,05■■■■□ 3,68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,05■■■■□ 3,68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC38,04■■■■□ 3,68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,03■■■■□ 3,68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,01■■■■□ 3,67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,99■■■■□ 3,67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37,96■■■■□ 3,67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,95■■■■□ 3,67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,92■■■■□ 3,66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,88■■■■□ 3,65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC37,87■■■■□ 3,65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC37,82■■■■□ 3,64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC37,77■■■■□ 3,64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC37,74■■■■□ 3,63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms