RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000108593.7

Ctdnep1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdnep1, Length 1,627 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa67,29■■■■■ 8,36
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 NischQ80TM9 1593 aa66,77■■■■■ 8,28
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Abcc9P70170 1546 aa64,69■■■■■ 7,95
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Abcc8B2RUS7 1588 aa64,36■■■■■ 7,89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 ScribQ80U72 1612 aa61,54■■■■■ 7,44
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 NacadQ5SWP3 1504 aa59,8■■■■■ 7,16
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Kdm5dQ62240 1548 aa59,72■■■■■ 7,15
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dcaf1Q80TR8 1506 aa59,52■■■■■ 7,12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Sycp2Q9CUU3 1500 aa58,59■■■■■ 6,97
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rhox8Q6VSS7 320 aa58,45■■■■■ 6,95
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa58,23■■■■■ 6,91
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 BicraF8VPZ9 1578 aa57,6■■■■■ 6,81
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ccdc180J3QNE4 1664 aa57,58■■■■■ 6,81
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Baz1aO88379 1555 aa57,51■■■■■ 6,8
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Crybg2B7ZCC2 1516 aa57,28■■■■■ 6,76
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP56,52■■■■■ 6,64
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP55,92■■■■■ 6,54
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Smarca2Q6DIC0 1577 aa55,89■■■■■ 6,54
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP55,54■■■■■ 6,48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rtl1Q7M732 1744 aa55,53■■■■■ 6,48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa55,41■■■■■ 6,46
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP55,32■■■■■ 6,45
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP55,08■■■■■ 6,41
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa54,92■■■■■ 6,38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa54,9■■■■■ 6,38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ercc6F8VPZ5 1481 aa54,71■■■■■ 6,35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa54,59■■■■■ 6,33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP54,44■■■■■ 6,3
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Wdr62Q3U3T8 1523 aa54,34■■■■■ 6,29
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 CftrP26361 1476 aa54,33■■■■■ 6,29
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Frmpd1A2AKB4 1549 aa54,28■■■■■ 6,28
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Synj1Q8CHC4 1574 aa54,22■■■■■ 6,27
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa54,22■■■■■ 6,27
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa54,19■■■■■ 6,26
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fam135aQ6NS59 1506 aa54,01■■■■■ 6,24
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Trim41Q5NCC3 630 aa53,89■■■■■ 6,22
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP53,86■■■■■ 6,21
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Baz1bQ9Z277 1479 aa53,51■■■■■ 6,16
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Unc13aQ4KUS2 1712 aa53,43■■■■■ 6,14
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP53,42■■■■■ 6,14
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ubl4bQ9CQ84 188 aa53,32■■■■■ 6,13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP52,79■■■■■ 6,04
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mrc2Q64449 1479 aa52,77■■■■■ 6,04
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Golga3P55937 1487 aa52,77■■■■■ 6,04
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Kif15Q6P9L6 1387 aa52,61■■■■■ 6,01
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Top2bQ64511 1612 aa52,56■■■■■ 6
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Lamc3Q9R0B6 1581 aa52,55■■■■■ 6
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cngb1E1AZ71 1325 aa52,48■■■■■ 5,99
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cux2P70298 1426 aa52,41■■■■■ 5,98
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 TnnQ80Z71 1560 aa52,17■■■■■ 5,94
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fmn1Q05860 1466 aa52,02■■■■■ 5,92
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP51,95■■■■■ 5,91
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cep164Q5DU05 1446 aa51,81■■■■■ 5,88
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ccdc18Q640L5 1455 aa51,8■■■■■ 5,88
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Kif21aQ9QXL2 1672 aa51,72■■■■■ 5,87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Camsap1A2AHC3 1581 aa51,66■■■■■ 5,86
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Il27Q8K3I6 234 aa51,6■■■■■ 5,85
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa51,5■■■■■ 5,84
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa51,49■■■■■ 5,83
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP51,45■■■■■ 5,83
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP51,36■■■■■ 5,81
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Chic1Q8CBW7 227 aa51,26■■■■■ 5,8
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP51,18■■■■■ 5,78
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP51,14■■■■■ 5,78
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 HrcG5E8J6 738 aa51,1■■■■■ 5,77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Grin2bQ01097 1482 aa51,08■■■■■ 5,77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Crocc2F6XLV1 1638 aa51,07■■■■■ 5,77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP51,04■■■■■ 5,76
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Plb1Q3TTY0 1478 aa51,02■■■■■ 5,76
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Duox2A2AQ99 1517 aa50,94■■■■■ 5,75
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP50,79■■■■■ 5,72
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Efcab5A0JP43 1406 aa50,78■■■■■ 5,72
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 NrkQ9R0G8 1455 aa50,75■■■■■ 5,72
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ift140E9PY46 1464 aa50,65■■■■■ 5,7
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Shroom4Q1W617 1475 aa50,5■■■■■ 5,67
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Samd9lQ69Z37 1561 aa50,48■■■■■ 5,67
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 PtprkP35822 1457 aa50,45■■■■■ 5,67
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Disp1Q3TDN0 1521 aa50,41■■■■■ 5,66
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rusc2Q80U22 1514 aa50,24■■■■■ 5,63
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rad54l2Q99NG0 1466 aa50,17■■■■■ 5,62
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP50,17■■■■■ 5,62
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP50,16■■■■■ 5,62
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa50,08■■■■■ 5,61
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gab3Q8BSM5 595 aa50,07■■■■■ 5,61
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Npm2Q80W85 207 aa50,06■■■■■ 5,6
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Magi3Q9EQJ9 1476 aa50,03■■■■■ 5,6
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Grin2aP35436 1464 aa50,01■■■■■ 5,6
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 SynmQ70IV5 1561 aa50■■■■■ 5,59
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Setd1bQ8CFT2 1985 aa49,96■■■■■ 5,59
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa49,92■■■■■ 5,58
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zeb1Q64318 1117 aa49,92■■■■■ 5,58
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa49,89■■■■■ 5,58
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pla2r1Q62028 1487 aa49,81■■■■■ 5,56
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Shroom2A2ALU4 1481 aa49,79■■■■■ 5,56
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gpatch8A2A6A1 1505 aa49,76■■■■■ 5,56
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP49,73■■■■■ 5,55
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Arhgap35Q91YM2 1499 aa49,67■■■■■ 5,54
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Map3k1P53349 1493 aa49,63■■■■■ 5,53
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cep162Q6ZQ06 1403 aa49,61■■■■■ 5,53
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP49,55■■■■■ 5,52
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 6,3 ms