Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX96

Sall2, Sal-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall2Q9QX96 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.6■■■■■ 5.53
Sall2Q9QX96 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC47.76■■■■■ 5.24
Sall2Q9QX96 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.69■■■■■ 5.22
Sall2Q9QX96 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.59■■■■■ 5.21
Sall2Q9QX96 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC46.63■■■■■ 5.06
Sall2Q9QX96 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
Sall2Q9QX96 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.95
Sall2Q9QX96 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
Sall2Q9QX96 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
Sall2Q9QX96 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
Sall2Q9QX96 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
Sall2Q9QX96 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
Sall2Q9QX96 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.64
Sall2Q9QX96 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
Sall2Q9QX96 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
Sall2Q9QX96 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
Sall2Q9QX96 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC43.56■■■■■ 4.56
Sall2Q9QX96 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
Sall2Q9QX96 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC43.45■■■■■ 4.55
Sall2Q9QX96 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
Sall2Q9QX96 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC43.13■■■■■ 4.49
Sall2Q9QX96 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
Sall2Q9QX96 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
Sall2Q9QX96 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
Sall2Q9QX96 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Sall2Q9QX96 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
Sall2Q9QX96 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC42.59■■■■■ 4.41
Sall2Q9QX96 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
Sall2Q9QX96 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
Sall2Q9QX96 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
Sall2Q9QX96 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
Sall2Q9QX96 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
Sall2Q9QX96 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
Sall2Q9QX96 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC42.11■■■■■ 4.33
Sall2Q9QX96 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
Sall2Q9QX96 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
Sall2Q9QX96 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
Sall2Q9QX96 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
Sall2Q9QX96 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
Sall2Q9QX96 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC41.77■■■■■ 4.28
Sall2Q9QX96 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
Sall2Q9QX96 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
Sall2Q9QX96 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
Sall2Q9QX96 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
Sall2Q9QX96 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Sall2Q9QX96 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Sall2Q9QX96 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Sall2Q9QX96 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Sall2Q9QX96 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Sall2Q9QX96 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Sall2Q9QX96 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Sall2Q9QX96 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
Sall2Q9QX96 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
Sall2Q9QX96 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Sall2Q9QX96 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
Sall2Q9QX96 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Sall2Q9QX96 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
Sall2Q9QX96 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Sall2Q9QX96 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Sall2Q9QX96 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Sall2Q9QX96 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Sall2Q9QX96 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC40.37■■■■■ 4.05
Sall2Q9QX96 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Sall2Q9QX96 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Sall2Q9QX96 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Sall2Q9QX96 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Sall2Q9QX96 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Sall2Q9QX96 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Sall2Q9QX96 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC40.15■■■■■ 4.02
Sall2Q9QX96 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Sall2Q9QX96 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Sall2Q9QX96 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
Sall2Q9QX96 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Sall2Q9QX96 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Sall2Q9QX96 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
Sall2Q9QX96 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Sall2Q9QX96 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Sall2Q9QX96 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC39.84■■■■□ 3.97
Sall2Q9QX96 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Sall2Q9QX96 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Sall2Q9QX96 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Sall2Q9QX96 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Sall2Q9QX96 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Sall2Q9QX96 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
Sall2Q9QX96 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Sall2Q9QX96 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Sall2Q9QX96 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
Sall2Q9QX96 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC39.48■■■■□ 3.91
Sall2Q9QX96 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Sall2Q9QX96 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC39.44■■■■□ 3.9
Sall2Q9QX96 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Sall2Q9QX96 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
Sall2Q9QX96 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
Sall2Q9QX96 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Sall2Q9QX96 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Sall2Q9QX96 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Sall2Q9QX96 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Sall2Q9QX96 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
Sall2Q9QX96 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Sall2Q9QX96 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms