Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC51,73■■■■■ 5,87
Ccne1Q61457 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC47,92■■■■■ 5,26
Ccne1Q61457 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,17■■■■■ 5,14
Ccne1Q61457 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC45,01■■■■■ 4,8
Ccne1Q61457 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC44,94■■■■■ 4,78
Ccne1Q61457 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC44,04■■■■■ 4,64
Ccne1Q61457 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,7■■■■■ 4,59
Ccne1Q61457 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,68■■■■■ 4,58
Ccne1Q61457 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,58■■■■■ 4,57
Ccne1Q61457 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC43,36■■■■■ 4,53
Ccne1Q61457 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC43,13■■■■■ 4,49
Ccne1Q61457 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,94■■■■■ 4,46
Ccne1Q61457 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,9■■■■■ 4,46
Ccne1Q61457 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,16■■■■■ 4,34
Ccne1Q61457 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,03■■■■■ 4,32
Ccne1Q61457 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC41,97■■■■■ 4,31
Ccne1Q61457 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC41,67■■■■■ 4,26
Ccne1Q61457 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC41,59■■■■■ 4,25
Ccne1Q61457 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41,48■■■■■ 4,23
Ccne1Q61457 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,4■■■■■ 4,22
Ccne1Q61457 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,36■■■■■ 4,21
Ccne1Q61457 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,35■■■■■ 4,21
Ccne1Q61457 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC41,31■■■■■ 4,2
Ccne1Q61457 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,18■■■■■ 4,18
Ccne1Q61457 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,07■■■■■ 4,17
Ccne1Q61457 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,96■■■■■ 4,15
Ccne1Q61457 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,93■■■■■ 4,14
Ccne1Q61457 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC40,92■■■■■ 4,14
Ccne1Q61457 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,86■■■■■ 4,13
Ccne1Q61457 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,82■■■■■ 4,13
Ccne1Q61457 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC40,81■■■■■ 4,12
Ccne1Q61457 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40,79■■■■■ 4,12
Ccne1Q61457 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC40,5■■■■■ 4,07
Ccne1Q61457 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,43■■■■■ 4,06
Ccne1Q61457 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,32■■■■■ 4,05
Ccne1Q61457 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,04■■■■■ 4
Ccne1Q61457 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40,03■■■■■ 4
Ccne1Q61457 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39,99■■■■□ 3,99
Ccne1Q61457 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC39,79■■■■□ 3,96
Ccne1Q61457 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC39,74■■■■□ 3,95
Ccne1Q61457 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,72■■■■□ 3,95
Ccne1Q61457 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC39,65■■■■□ 3,94
Ccne1Q61457 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,56■■■■□ 3,92
Ccne1Q61457 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC39,53■■■■□ 3,92
Ccne1Q61457 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC39,43■■■■□ 3,9
Ccne1Q61457 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,32■■■■□ 3,89
Ccne1Q61457 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,29■■■■□ 3,88
Ccne1Q61457 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC39,26■■■■□ 3,88
Ccne1Q61457 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC39,19■■■■□ 3,86
Ccne1Q61457 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,99■■■■□ 3,83
Ccne1Q61457 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,95■■■■□ 3,83
Ccne1Q61457 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,92■■■■□ 3,82
Ccne1Q61457 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC38,87■■■■□ 3,81
Ccne1Q61457 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC38,8■■■■□ 3,8
Ccne1Q61457 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,79■■■■□ 3,8
Ccne1Q61457 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC38,76■■■■□ 3,8
Ccne1Q61457 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC38,73■■■■□ 3,79
Ccne1Q61457 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC38,7■■■■□ 3,79
Ccne1Q61457 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,7■■■■□ 3,79
Ccne1Q61457 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC38,58■■■■□ 3,77
Ccne1Q61457 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,55■■■■□ 3,76
Ccne1Q61457 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,53■■■■□ 3,76
Ccne1Q61457 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC38,5■■■■□ 3,75
Ccne1Q61457 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC38,47■■■■□ 3,75
Ccne1Q61457 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC38,4■■■■□ 3,74
Ccne1Q61457 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC38,38■■■■□ 3,73
Ccne1Q61457 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,37■■■■□ 3,73
Ccne1Q61457 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38,36■■■■□ 3,73
Ccne1Q61457 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,34■■■■□ 3,73
Ccne1Q61457 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38,31■■■■□ 3,72
Ccne1Q61457 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC38,28■■■■□ 3,72
Ccne1Q61457 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC38,24■■■■□ 3,71
Ccne1Q61457 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC38,19■■■■□ 3,7
Ccne1Q61457 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,12■■■■□ 3,69
Ccne1Q61457 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,12■■■■□ 3,69
Ccne1Q61457 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC38,11■■■■□ 3,69
Ccne1Q61457 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC38,07■■■■□ 3,68
Ccne1Q61457 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,07■■■■□ 3,68
Ccne1Q61457 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,06■■■■□ 3,68
Ccne1Q61457 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,98■■■■□ 3,67
Ccne1Q61457 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37,98■■■■□ 3,67
Ccne1Q61457 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,97■■■■□ 3,67
Ccne1Q61457 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,92■■■■□ 3,66
Ccne1Q61457 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37,91■■■■□ 3,66
Ccne1Q61457 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,86■■■■□ 3,65
Ccne1Q61457 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC37,86■■■■□ 3,65
Ccne1Q61457 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,79■■■■□ 3,64
Ccne1Q61457 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,77■■■■□ 3,64
Ccne1Q61457 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC37,77■■■■□ 3,64
Ccne1Q61457 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,77■■■■□ 3,64
Ccne1Q61457 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,73■■■■□ 3,63
Ccne1Q61457 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,68■■■■□ 3,62
Ccne1Q61457 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC37,6■■■■□ 3,61
Ccne1Q61457 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37,59■■■■□ 3,61
Ccne1Q61457 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC37,52■■■■□ 3,6
Ccne1Q61457 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC37,51■■■■□ 3,6
Ccne1Q61457 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,51■■■■□ 3,59
Ccne1Q61457 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,47■■■■□ 3,59
Ccne1Q61457 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37,47■■■■□ 3,59
Ccne1Q61457 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,46■■■■□ 3,59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,2 ms