Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC53,17■■■■■ 6,1
Nid2O88322 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC49,42■■■■■ 5,5
Nid2O88322 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,53■■■■■ 5,36
Nid2O88322 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC46,35■■■■■ 5,01
Nid2O88322 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC46,06■■■■■ 4,96
Nid2O88322 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC45,02■■■■■ 4,8
Nid2O88322 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,92■■■■■ 4,78
Nid2O88322 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,76■■■■■ 4,76
Nid2O88322 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC44,67■■■■■ 4,74
Nid2O88322 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC44,32■■■■■ 4,68
Nid2O88322 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,29■■■■■ 4,68
Nid2O88322 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC43,31■■■■■ 4,52
Nid2O88322 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,19■■■■■ 4,51
Nid2O88322 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC42,96■■■■■ 4,47
Nid2O88322 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,92■■■■■ 4,46
Nid2O88322 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42,9■■■■■ 4,46
Nid2O88322 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,84■■■■■ 4,45
Nid2O88322 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,53■■■■■ 4,4
Nid2O88322 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC42,48■■■■■ 4,39
Nid2O88322 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,47■■■■■ 4,39
Nid2O88322 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,29■■■■■ 4,36
Nid2O88322 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,17■■■■■ 4,34
Nid2O88322 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC42,1■■■■■ 4,33
Nid2O88322 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC42,09■■■■■ 4,33
Nid2O88322 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,82■■■■■ 4,29
Nid2O88322 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,77■■■■■ 4,28
Nid2O88322 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,51■■■■■ 4,24
Nid2O88322 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC41,44■■■■■ 4,22
Nid2O88322 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41,31■■■■■ 4,2
Nid2O88322 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,29■■■■■ 4,2
Nid2O88322 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,23■■■■■ 4,19
Nid2O88322 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC41,1■■■■■ 4,17
Nid2O88322 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41,1■■■■■ 4,17
Nid2O88322 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,05■■■■■ 4,16
Nid2O88322 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,87■■■■■ 4,13
Nid2O88322 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC40,8■■■■■ 4,12
Nid2O88322 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC40,77■■■■■ 4,12
Nid2O88322 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC40,7■■■■■ 4,11
Nid2O88322 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,5■■■■■ 4,07
Nid2O88322 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC40,49■■■■■ 4,07
Nid2O88322 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,31■■■■■ 4,04
Nid2O88322 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC40,25■■■■■ 4,03
Nid2O88322 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC40,25■■■■■ 4,03
Nid2O88322 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3,99
Nid2O88322 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3,99
Nid2O88322 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,99■■■■□ 3,99
Nid2O88322 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC39,99■■■■□ 3,99
Nid2O88322 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,87■■■■□ 3,97
Nid2O88322 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC39,85■■■■□ 3,97
Nid2O88322 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC39,82■■■■□ 3,97
Nid2O88322 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,8■■■■□ 3,96
Nid2O88322 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC39,77■■■■□ 3,96
Nid2O88322 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC39,73■■■■□ 3,95
Nid2O88322 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39,69■■■■□ 3,94
Nid2O88322 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC39,66■■■■□ 3,94
Nid2O88322 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC39,52■■■■□ 3,92
Nid2O88322 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39,48■■■■□ 3,91
Nid2O88322 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,48■■■■□ 3,91
Nid2O88322 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC39,47■■■■□ 3,91
Nid2O88322 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39,43■■■■□ 3,9
Nid2O88322 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC39,4■■■■□ 3,9
Nid2O88322 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,39■■■■□ 3,9
Nid2O88322 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC39,37■■■■□ 3,89
Nid2O88322 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC39,3■■■■□ 3,88
Nid2O88322 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC39,21■■■■□ 3,87
Nid2O88322 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,19■■■■□ 3,86
Nid2O88322 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC39,05■■■■□ 3,84
Nid2O88322 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3,83
Nid2O88322 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC38,97■■■■□ 3,83
Nid2O88322 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,91■■■■□ 3,82
Nid2O88322 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC38,89■■■■□ 3,82
Nid2O88322 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,88■■■■□ 3,81
Nid2O88322 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC38,81■■■■□ 3,8
Nid2O88322 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,7■■■■□ 3,79
Nid2O88322 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,69■■■■□ 3,78
Nid2O88322 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC38,66■■■■□ 3,78
Nid2O88322 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,64■■■■□ 3,78
Nid2O88322 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38,63■■■■□ 3,77
Nid2O88322 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,62■■■■□ 3,77
Nid2O88322 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,58■■■■□ 3,77
Nid2O88322 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC38,57■■■■□ 3,77
Nid2O88322 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,55■■■■□ 3,76
Nid2O88322 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,49■■■■□ 3,75
Nid2O88322 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC38,46■■■■□ 3,75
Nid2O88322 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC38,41■■■■□ 3,74
Nid2O88322 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,31■■■■□ 3,72
Nid2O88322 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,27■■■■□ 3,72
Nid2O88322 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC38,26■■■■□ 3,72
Nid2O88322 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC38,24■■■■□ 3,71
Nid2O88322 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC38,19■■■■□ 3,7
Nid2O88322 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,17■■■■□ 3,7
Nid2O88322 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38,17■■■■□ 3,7
Nid2O88322 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38,16■■■■□ 3,7
Nid2O88322 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC38,15■■■■□ 3,7
Nid2O88322 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,09■■■■□ 3,69
Nid2O88322 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,08■■■■□ 3,69
Nid2O88322 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC38,04■■■■□ 3,68
Nid2O88322 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,03■■■■□ 3,68
Nid2O88322 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC38■■■■□ 3,67
Nid2O88322 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC37,98■■■■□ 3,67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms