Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC52.7■■■■■ 6.03
Nlgn1Q99K10 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC48.85■■■■■ 5.41
Nlgn1Q99K10 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.08■■■■■ 5.29
Nlgn1Q99K10 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC45.83■■■■■ 4.93
Nlgn1Q99K10 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC45.79■■■■■ 4.92
Nlgn1Q99K10 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC44.82■■■■■ 4.77
Nlgn1Q99K10 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
Nlgn1Q99K10 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
Nlgn1Q99K10 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
Nlgn1Q99K10 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.63
Nlgn1Q99K10 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC43.92■■■■■ 4.62
Nlgn1Q99K10 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
Nlgn1Q99K10 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Nlgn1Q99K10 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC42.8■■■■■ 4.44
Nlgn1Q99K10 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Nlgn1Q99K10 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
Nlgn1Q99K10 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC42.48■■■■■ 4.39
Nlgn1Q99K10 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC42.33■■■■■ 4.37
Nlgn1Q99K10 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
Nlgn1Q99K10 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Nlgn1Q99K10 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
Nlgn1Q99K10 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
Nlgn1Q99K10 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
Nlgn1Q99K10 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
Nlgn1Q99K10 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Nlgn1Q99K10 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Nlgn1Q99K10 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
Nlgn1Q99K10 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC41.72■■■■■ 4.27
Nlgn1Q99K10 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
Nlgn1Q99K10 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
Nlgn1Q99K10 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
Nlgn1Q99K10 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Nlgn1Q99K10 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
Nlgn1Q99K10 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Nlgn1Q99K10 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.13
Nlgn1Q99K10 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
Nlgn1Q99K10 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Nlgn1Q99K10 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Nlgn1Q99K10 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
Nlgn1Q99K10 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Nlgn1Q99K10 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
Nlgn1Q99K10 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC40.31■■■■■ 4.04
Nlgn1Q99K10 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
Nlgn1Q99K10 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
Nlgn1Q99K10 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
Nlgn1Q99K10 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
Nlgn1Q99K10 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
Nlgn1Q99K10 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Nlgn1Q99K10 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Nlgn1Q99K10 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
Nlgn1Q99K10 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
Nlgn1Q99K10 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Nlgn1Q99K10 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
Nlgn1Q99K10 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
Nlgn1Q99K10 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.9
Nlgn1Q99K10 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
Nlgn1Q99K10 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Nlgn1Q99K10 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
Nlgn1Q99K10 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Nlgn1Q99K10 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
Nlgn1Q99K10 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
Nlgn1Q99K10 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Nlgn1Q99K10 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
Nlgn1Q99K10 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC39.13■■■■□ 3.85
Nlgn1Q99K10 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
Nlgn1Q99K10 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
Nlgn1Q99K10 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Nlgn1Q99K10 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Nlgn1Q99K10 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
Nlgn1Q99K10 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
Nlgn1Q99K10 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Nlgn1Q99K10 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Nlgn1Q99K10 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Nlgn1Q99K10 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Nlgn1Q99K10 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Nlgn1Q99K10 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Nlgn1Q99K10 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Nlgn1Q99K10 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Nlgn1Q99K10 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.71■■■■□ 3.79
Nlgn1Q99K10 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Nlgn1Q99K10 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
Nlgn1Q99K10 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Nlgn1Q99K10 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Nlgn1Q99K10 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Nlgn1Q99K10 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Nlgn1Q99K10 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Nlgn1Q99K10 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Nlgn1Q99K10 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Nlgn1Q99K10 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Nlgn1Q99K10 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
Nlgn1Q99K10 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Nlgn1Q99K10 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Nlgn1Q99K10 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
Nlgn1Q99K10 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Nlgn1Q99K10 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
Nlgn1Q99K10 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Nlgn1Q99K10 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Nlgn1Q99K10 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Nlgn1Q99K10 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
Nlgn1Q99K10 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms