Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC52,7■■■■■ 6,03
Nlgn1Q99K10 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC48,85■■■■■ 5,41
Nlgn1Q99K10 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,08■■■■■ 5,29
Nlgn1Q99K10 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC45,83■■■■■ 4,93
Nlgn1Q99K10 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC45,79■■■■■ 4,92
Nlgn1Q99K10 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC44,82■■■■■ 4,77
Nlgn1Q99K10 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,52■■■■■ 4,72
Nlgn1Q99K10 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,46■■■■■ 4,71
Nlgn1Q99K10 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC44,17■■■■■ 4,66
Nlgn1Q99K10 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,94■■■■■ 4,63
Nlgn1Q99K10 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC43,92■■■■■ 4,62
Nlgn1Q99K10 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,74■■■■■ 4,59
Nlgn1Q99K10 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,34■■■■■ 4,53
Nlgn1Q99K10 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC42,8■■■■■ 4,44
Nlgn1Q99K10 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,79■■■■■ 4,44
Nlgn1Q99K10 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,56■■■■■ 4,4
Nlgn1Q99K10 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC42,48■■■■■ 4,39
Nlgn1Q99K10 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC42,33■■■■■ 4,37
Nlgn1Q99K10 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42,29■■■■■ 4,36
Nlgn1Q99K10 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,2■■■■■ 4,35
Nlgn1Q99K10 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,98■■■■■ 4,31
Nlgn1Q99K10 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,88■■■■■ 4,29
Nlgn1Q99K10 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC41,85■■■■■ 4,29
Nlgn1Q99K10 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,84■■■■■ 4,29
Nlgn1Q99K10 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,78■■■■■ 4,28
Nlgn1Q99K10 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,78■■■■■ 4,28
Nlgn1Q99K10 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,76■■■■■ 4,28
Nlgn1Q99K10 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC41,72■■■■■ 4,27
Nlgn1Q99K10 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC41,61■■■■■ 4,25
Nlgn1Q99K10 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,48■■■■■ 4,23
Nlgn1Q99K10 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,38■■■■■ 4,22
Nlgn1Q99K10 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41,33■■■■■ 4,21
Nlgn1Q99K10 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC41,08■■■■■ 4,17
Nlgn1Q99K10 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,91■■■■■ 4,14
Nlgn1Q99K10 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40,82■■■■■ 4,13
Nlgn1Q99K10 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,75■■■■■ 4,11
Nlgn1Q99K10 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC40,55■■■■■ 4,08
Nlgn1Q99K10 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,51■■■■■ 4,08
Nlgn1Q99K10 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC40,48■■■■■ 4,07
Nlgn1Q99K10 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,41■■■■■ 4,06
Nlgn1Q99K10 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,4■■■■■ 4,06
Nlgn1Q99K10 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC40,31■■■■■ 4,04
Nlgn1Q99K10 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40,3■■■■■ 4,04
Nlgn1Q99K10 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC40,16■■■■■ 4,02
Nlgn1Q99K10 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC40,12■■■■■ 4,01
Nlgn1Q99K10 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC39,98■■■■□ 3,99
Nlgn1Q99K10 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC39,98■■■■□ 3,99
Nlgn1Q99K10 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,94■■■■□ 3,98
Nlgn1Q99K10 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,74■■■■□ 3,95
Nlgn1Q99K10 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,63■■■■□ 3,94
Nlgn1Q99K10 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC39,51■■■■□ 3,92
Nlgn1Q99K10 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,44■■■■□ 3,9
Nlgn1Q99K10 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC39,41■■■■□ 3,9
Nlgn1Q99K10 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC39,39■■■■□ 3,9
Nlgn1Q99K10 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC39,38■■■■□ 3,9
Nlgn1Q99K10 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC39,35■■■■□ 3,89
Nlgn1Q99K10 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,34■■■■□ 3,89
Nlgn1Q99K10 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,32■■■■□ 3,88
Nlgn1Q99K10 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,28■■■■□ 3,88
Nlgn1Q99K10 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC39,24■■■■□ 3,87
Nlgn1Q99K10 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC39,22■■■■□ 3,87
Nlgn1Q99K10 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC39,21■■■■□ 3,87
Nlgn1Q99K10 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,13■■■■□ 3,86
Nlgn1Q99K10 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC39,13■■■■□ 3,85
Nlgn1Q99K10 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC39,09■■■■□ 3,85
Nlgn1Q99K10 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC39,08■■■■□ 3,85
Nlgn1Q99K10 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39,07■■■■□ 3,85
Nlgn1Q99K10 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,98■■■■□ 3,83
Nlgn1Q99K10 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38,89■■■■□ 3,82
Nlgn1Q99K10 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC38,88■■■■□ 3,81
Nlgn1Q99K10 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,88■■■■□ 3,81
Nlgn1Q99K10 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC38,88■■■■□ 3,81
Nlgn1Q99K10 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC38,87■■■■□ 3,81
Nlgn1Q99K10 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,87■■■■□ 3,81
Nlgn1Q99K10 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,75■■■■□ 3,79
Nlgn1Q99K10 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,73■■■■□ 3,79
Nlgn1Q99K10 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,72■■■■□ 3,79
Nlgn1Q99K10 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,72■■■■□ 3,79
Nlgn1Q99K10 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38,71■■■■□ 3,79
Nlgn1Q99K10 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC38,64■■■■□ 3,78
Nlgn1Q99K10 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC38,59■■■■□ 3,77
Nlgn1Q99K10 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,57■■■■□ 3,76
Nlgn1Q99K10 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38,49■■■■□ 3,75
Nlgn1Q99K10 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,48■■■■□ 3,75
Nlgn1Q99K10 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,45■■■■□ 3,75
Nlgn1Q99K10 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC38,41■■■■□ 3,74
Nlgn1Q99K10 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC38,33■■■■□ 3,73
Nlgn1Q99K10 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,33■■■■□ 3,73
Nlgn1Q99K10 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,27■■■■□ 3,72
Nlgn1Q99K10 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,26■■■■□ 3,71
Nlgn1Q99K10 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,22■■■■□ 3,71
Nlgn1Q99K10 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,17■■■■□ 3,7
Nlgn1Q99K10 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC38,17■■■■□ 3,7
Nlgn1Q99K10 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,16■■■■□ 3,7
Nlgn1Q99K10 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC38,13■■■■□ 3,69
Nlgn1Q99K10 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC38,12■■■■□ 3,69
Nlgn1Q99K10 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,11■■■■□ 3,69
Nlgn1Q99K10 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38,08■■■■□ 3,69
Nlgn1Q99K10 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC37,99■■■■□ 3,67
Nlgn1Q99K10 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,96■■■■□ 3,67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8,4 ms